Projekt Human Proteome

Human Proteome Project ( HPP ) je mezinárodní projekt na vytvoření mapy proteomu, která zahrnuje všechny proteiny kódované lidským genomem . Primárním úkolem projektu je sestavení proteomických map hlavních proteinů krevní plazmy , jater , mozku [1] .

Historie

Mezinárodní projekt „Human Proteome“ byl zahájen v září 2010 v Sydney a stal se pokračováním projektu „Human Genome“ [2] . Mezi účastníky projektu Human Proteome je šest iniciačních zemí: Korejská republika , USA , Ruská federace , Švédsko , Kanada a Írán ). Z hlediska rozsahu nastoleného problému a odhadované pracnosti práce se projekt Human Proteome ukázal být mnohem větší než projekt Human Genome. Zatímco lidský genom tvoří asi 20 tisíc genů, počet proteinů v lidském těle díky přítomnosti různých proteinových proteoforem přesahuje 2 miliony [3] . Navíc na rozdíl od genomu se proteom neustále mění v závislosti na vlivu intracelulárních a vnějších faktorů a ve skutečnosti je souborem proteinů fixovaných v čase v konkrétním biologickém objektu a v konkrétní situaci.

Metody

Mezi metodami studia proteomu akceptovanými mezinárodním společenstvím se jednou z nejúspěšněji rozvíjejících se stal chromozomově nebo genově centrický přístup, ve kterém jsou výsledky analýzy proteinů mapovány na jejich odpovídající geny kódující proteiny . Formalizace vědeckého úkolu díky genově centrickému přístupu činí jeho realizaci mnohem realističtější ve srovnání s alternativními přístupy (total protein typing), což vám umožňuje zaměřit se na proteiny kódované geny konkrétního chromozomu, a tím rozdělit projekt na samostatné podprojekty - podle počtu párů chromozomů v genomu člověka [4] .

Viz také

Poznámky

  1. ↑ Dedov, I. I., Tyulpakov, A. N., Čechonin, V. P., Baklaushev, V. P., Archakov, A. I., & Moshkovsky, S. A. Personalizovaná medicína: současný stav a vyhlídky // Bulletin Ruské akademie lékařských věd. - 2012. - T. 67 , č. 12 . - S. 4-12 . — ISSN 0869-6047 . - doi : 10.15690/vramn.v67i12.474 .
  2. ↑ Legrain P., Aebersold R., Archakov A., Bairoch A., Bala K., Beretta L., Bergeron J., Borchers CH, Corthals GL, Costello CE et al. Projekt lidského proteomu: současný stav a budoucí směr // Molekulární a buněčná proteomika. - 2011. - T. 10 , č. 7 . - S. M111. 009993 . - doi : 10.1074/mcp.M111.009993 .
  3. ↑ Archakov A., Zgoda V., Kopylov A., Naryzhny S., Černobrovkin A., Ponomarenko E., Lisitsa A. Chromozomově centrický přístup k překonání úzkých míst v projektu Human Proteome Project // Odborný přehled proteomiky. - 2012. - T. 9 , č. 6 . - S. 667-676 . - doi : 10.1021/pr300821n .
  4. ↑ Ponomarenko, E. A., Zgoda, V. G., Kopylov, A. T., advokát, E. V., Ilgisonis, E. V., Lisitsa, A. V., & Archakov, A. I. Rusko v mezinárodním projektu „human proteome“: první výsledky a vyhlídky // Biomedicínská chemie - 2015. - T. 61 , č. 2 . - S. 169-175 . - doi : 10.18097/PBMC20156102169 .

Literatura