Chimérický gen

Chimérické geny (doslova označované jako nukleotidové sekvence sestávající z fragmentů polynukleotidů z různých zdrojů) jsou tvořeny spojením částí dvou nebo více kódujících nebo nekódujících sekvencí za vzniku nových genů se specifickou funkcí. Tyto mutace se liší od fúzních genů , které kombinují celé sekvence genů nebo jejich rozšířené kódující oblasti do jednoho otevřeného čtecího rámce a často si zachovávají kombinaci svých původních funkcí.

Formace

Chimérické geny mohou být tvořeny několika různými způsoby. Mnoho chimérických genů se tvoří kvůli chybám v replikaci DNA nebo opravě DNA , takže části dvou různých genů jsou neúmyslně spojeny [1] . Chimérické geny se mohou tvořit také retrotranspozicí , kdy retrotransposon náhodně zkopíruje genový transkript a vloží jej do genomu na nové místo. V závislosti na tom, kde se nový retrogen objeví , může rekrutovat nové exony k vytvoření chimérického genu. A konečně, ektopická rekombinace může produkovat chimérické geny  – když dochází k výměně mezi částmi genomu, které spolu ve skutečnosti nesouvisí. Tento proces se často vyskytuje v lidských genomech. Je známo, že anomální chiméry, které se tímto procesem tvoří, způsobují barevnou slepotu .

Evoluční význam chimérických proteinů

Chimérické geny hrají důležitou roli v evoluci genetické diverzity. Stejně jako genové duplikace poskytují zdroj nových genů, které mohou organizmům umožnit vyvinout nové fenotypy a přizpůsobit se jejich prostředí. Na rozdíl od duplicitních genů se chimérické proteiny okamžitě liší od svých rodičovských genů, a proto je pravděpodobnější, že budou vykonávat zcela nové funkce.

Chimérické fúzní proteiny se často tvoří v genomech [1] a mnohé z nich jsou pravděpodobně nefunkční a zmizí v důsledku přirozeného výběru . V některých případech však mohou tyto nové peptidy tvořit plně funkční genové produkty, které jsou selektivně upřednostňovány a rychle proliferují v populacích.

Funkce

Jeden z nejznámějších chimérických genů byl identifikován u Drosophila a pojmenován Jingwei (jgw) [2] . Tento gen je vytvořen z retrotransponované kopie alkoholdehydrogenázy , která se spojila s genem žlutého císaře (ymp, yellow-emperor) [3] za vzniku nového proteinu [2] . Nové aminokyselinové zbytky odvozené z genu žlutého císaře umožňují novému proteinu působit na alkoholy a dioly s dlouhým řetězcem, včetně růstových hormonů a feromonů [4] , a tím ovlivňovat vývoj much. V tomto případě kombinace různých proteinových domén vedla ke genu, který byl plně funkční a preferovaný přirozeným výběrem.

Funkce mnoha chimérických genů nejsou dosud známy. V některých případech tyto genové produkty nejsou prospěšné a mohou dokonce způsobit onemocnění, jako je rakovina [5] .

Poznámky

  1. 1 2 Rogers, RL, Bedford, T a Hartl DL. „Tvorba a dlouhověkost chimérických a duplicitních genů v Drosphila “. Genetika . 181:313-322.
  2. 1 2 Long, M., CH Langley 1993. "Přirozený výběr a původ jingwei , chiméricky zpracovaný funkční gen u Drosophila ." Science 260: 91-95.
  3. ymp žlutý císař [Drosophila melanogaster (ovocná muška) ] . Národní lékařská knihovna. Staženo: 10. července 2022.
  4. Zhang J, Dean AM, Brunet F, Long M. 2004. "Vývoj funkční rozmanitosti proteinů v nových genech Drosophila ." Proč Natl Acad Sci USA 101: 16246-50.
  5. Shi, X.; Singh, S.; Lin, E.; Li, H. (2021). „Chimérické RNA v rakovině“ . Pokroky v klinické chemii . 100 : 1-35. DOI : 10.1016/bs.acc.2020.04.001 . PMID  33453863 .