Retrotranspozony

Retrotranspozony ( mobilní genetické prvky prvního typu nebo transpozony , které se pohybují přes meziprodukty RNA ) jsou genetické prvky, které se mohou samy reprodukovat v genomu a jsou všudypřítomnými složkami DNA mnoha eukaryotických organismů .

Retrotranspozony jsou podtřídou transpozonů . Retrotranspozony jsou široce distribuovány v rostlinách, kde jsou často základní složkou jaderné DNA . U kukuřice tvoří 49–78 % genomu retrotranspozony, [1] u pšenice je asi 90 % genomu reprezentováno opakujícími se sekvencemi, z nichž 68 % jsou transponovatelné prvky. [2] U savců tvoří téměř polovinu genomu (45–48 %) transpozony nebo zbytky transpozonů. Přibližně 42 % lidského genomu tvoří retrotranspozony a asi 2–3 % transposony DNA . [3]

Klasifikace

Retrotranspozony, neboli mobilní genetické elementy prvního typu, se skládají ze dvou podtypů - retrotranspozony s dlouhými terminálními repeticemi ( angl.  LTR , long terminal repeats ) a retrotranspozony bez dlouhých terminálních repetic.

Ty se zase dělí na dlouhé rozptýlené repetice ( anglicky  LINEs , long interspersed elements ) a krátké rozptýlené repetice ( anglicky  SINE , short interspersed elements ).

Poznámky

1. ↑ SanMiguel P., Bennetzen JL Důkaz, že nedávné zvýšení velikosti genomu kukuřice bylo způsobeno masivní amplifikací intergenových retrotranpozonů  //  Annals of Botany  : journal. - 1998. - Sv. 82 , č. Pružné A. - str. 37-44 . - doi : 10.1006/anbo.1998.0746 .
2. ↑ Li W., Zhang P., Fellers JP, Friebe B., Gill BS [www.blackwell-synergy.com/doi/abs/10.1111/j.1365-313X.2004.02228.x the core Triticeae genome]  (anglicky)  // Rostlina J. : deník. - 2004. - Listopad ( roč. 40 , č. 4 ). - S. 500-511 . - doi : 10.1111/j.1365-313X.2004.02228.x . — PMID 15500466 .  (nedostupný odkaz)
3. ↑ Lander ES, Linton LM, Birren B., et al. Počáteční sekvenování a analýza lidského genomu  //  Nature : journal. - 2001. - únor ( roč. 409 , č. 6822 ). - S. 860-921 . - doi : 10.1038/35057062 . — PMID 11237011 .

Literatura

• Zhimulev I. F. Obecná a molekulární genetika. - 1. - Novosibirsk: Univerzitní nakladatelství Novosibirsk, 2002. - 459 s. - 2000 výtisků.  — ISBN 5761505096 .
• Liu, J., Gao, M., He, J., Wu, K., Lin, S., Jin, L., ... & Chen, J. (2021). Čtečka RNA m 6 A YTHDC1 umlčuje retrotranspozony a hlídá identitu buněk ES. Nature, 591 (7849), 322-326. PMID 33658714 doi : 10.1038/s41586-021-03313-9
• Billon, V., & Cristofari, G. (2021). Rodící se RNA m 6 Modifikace v jádru konfliktu gen-retrotransposon. Buněčný výzkum, 1-3. doi : 10.1038/s41422-021-00518-5
• Xu, Z., Ma, A. & Ma, YC (2021). Methylace RNA zachovává identitu buněk ES chromatinovým umlčením retrotransposonů. Sig Transduct Target Ther 6, 258 . doi : 10.1038/s41392-021-00683-4

Viz také

• transpozony
• DNA transpozony

Slovníky a encyklopedie	Britannica (online)