Tandem se opakuje

Tandemové repetice  jsou sekvence opakujících se fragmentů DNA . Podle velikosti se dělí do tří tříd: satelitní DNA , minisatelity a mikrosatelity .

Satelity

Délka sekvence vysoce repetitivních satelitů se pohybuje od 100 000 do více než 1 milionu nukleotidů . Opakující se sekvence má typicky více než 100 párů bází. Lidská satelitní alfa DNA se nachází v centromerách všech chromozomů . Délka jedné repetice je 171 párů bází a celá opakující se oblast zaujímá asi 3-5 % velikosti každého chromozomu. Ostatní satelity mají kratší délku opakování. Většina satelitů lidí i jiných organismů je lokalizována v centromeře.

Minisatelity

Minisatelity jsou opakující se fragmenty DNA o délce 7 až 100 nukleotidů . Nacházejí se na více než 1000 místech v lidském genomu . Používají se jako molekulární markery při určování příbuznosti, v populačních genetických studiích při určování příslušnosti k určité populaci, při hybridizačních studiích, při snímání DNA . Jeden typ minisatelitů, hypervariabilní minisatelity ( proměnný počet  tandemových repetic ), se nacházejí v nekódujících oblastech DNA a jsou také široce používány v populačních studiích, protože nejsou ovlivněny přirozeným výběrem . Lidské telomery a telomery jiných savců obsahují tandemové repetice GGGTTA .

Mikrosatelity

Mikrosatelity (nebo jednoduché krátké tandemové repetice) jsou opakující se fragmenty DNA o délce od 1 do 6 párů bází . Mikrosatelity se vyznačují vysokou rychlostí změn sekvence v důsledku skluzu replikace DNA a bodových mutací . Podobně jako minisatelity se používají jako molekulární markery v populačních genetických studiích.

Odkazy