ARHGAP29

ARHGAP29  je gen umístěný na prvním lidském chromozomu na pozici 1p22, který kóduje Rho GTPase-activated protein (GAP) 29, [1] protein , který zprostředkovává cyklickou regulaci malých proteinů vázající se na GTP , jako je RhoA [2] .

Funkce

ARHGAP29 je exprimován ve vyvíjející se tváři a může působit downstream od proteinu IRF6 k ovlivnění kraniofaciálního vývoje [3] .

Struktura

ARHGAP29 obsahuje čtyři domény, včetně svinuté oblasti, která interaguje s Rap2, [4] doménu C1, oblast Rho, doménu GTPázy a malou C-terminální oblast, která interaguje s PTPL1 [2] .

Klinický význam

Genomové studie a metaanalýzy [5] prokázaly asociaci lokusu 1p22 obsahujícího ARHGAP29 s nesyndromovým rozštěpem rtu/rozštěpu patra [6] . Následné studie [3] identifikovaly vzácné kódující varianty, včetně nesmyslných mutací a posunů čtecího rámce, u pacientů s nesyndromovým rozštěpem rtu/rozštěpu patra . Role ARHGAP29 v kraniofaciálním vývoji byla uzavřena poté, co souvislému genu ABCA4 chyběly funkční nebo expresní údaje, které by jej podpořily jako etiologický gen pro nesyndromový rozštěp rtu/rozštěpu patra , ačkoli s tím byl spojen jednonukleotidový polymorfismus v genu ABCA4 nemoc .

Poznámky

  1. ↑ Heasman SJ, Ridley AJ. 2008. Savčí Rho GTPázy: nové poznatky o jejich funkcích ze studií in vivo. Nat Rev Mol Cell Biol 9(9) 690-701.
  2. ↑ 1 2 Saras J, Franzen P, Aspenstrom P, Hellman U, Gonez LJ, Heldin CH. 1997. Nový protein aktivující GTPázu pro Rho interaguje s doménou PDZ protein-tyrosin fosfatázy PTPL1" J Biol Chem 272(39) 24333-24338.
  3. ↑ 1 2 Leslie, EJ; Mansilla MA, Biggs LC, Schuette K., Bullard S., Cooper M., Dunnwald M., Lidral AC, Marazita ML, Beaty TH, Murray JC Analýza exprese a mutace implikuje ARHGAP29 jako etiologický gen pro rozštěp rtu s nebo bez lokus rozštěpu patra identifikovaný celogenomovou asociací na chromozomu 1p22  //  Birth Defects Research Part A: Clinical and Molecular Teratology : journal. - 2012. - Sv. 94 . - S. 934-942 . - doi : 10.1002/bdra.23076 . — PMID 23008150 .
  4. ↑ Myagmar BE, Umikawa M, Asato T, Taira K, Oshiro M, Hino A, Takei K, Uezato H, Kariya K. 2005. PARG1, protein-tyrosin fosfatáza-asociovaný RhoGAP, jako domnělý Rap2 efektor“ Biochem Biophys Res Commun 329(3) 1046-1052.
  5. ↑ Ludwig, KU; Mangold E., Herms S., Nowak S., Reutter H., Paul A., Becker J., Herberz R., AlChawa T., Nasser E., Böhmer AC, Mattheisen M., Alblas MA, Barth S., Kluck N., Lauster C., Braumann B., Reich RH, Hemprich A., Pötzsch S., Blaumeiser B., Daratsianos N., Kreusch T., Murray JC, Marazita ML, Ruczinski I., Scott AF, Beaty TH , Kramer FJ, Wienker TF, Steegers-Theunissen RP, Rubini M., Mossey PA, Hoffmann P., Lange C., Cichon S., Propping P., Knapp M., Nöthen MM celogenomové metaanalýzy nesyndromických rozštěpů rtu s nebo bez rozštěpu patra identifikovat šest nových rizikových lokusů  // Nature Genetics  : journal  . - 2012. - Sv. 44 , č. 9 . - S. 968-971 . - doi : 10.1038/ng.22360 . — PMID 22863734 .
  6. ↑ Beaty, T.H.; Murray JC, Marazita ML, Munger RG, Ruczinski I., Hetmanski JB, Liang KY, Wu T., Murray T., Fallin MD, Redett RA, Raymond G., Schwender H., Jin SC, Cooper ME, Dunnwald M. , Mansilla MA, Leslie E., Bullard S., Lidral AC, Moreno LM, Menezes R., Vieira AR, Petřín A., Wilcox AJ, Lie RT, Jabs EW, Wu-Chou YH, Chen PK, Wang H., Ye X., Huang S., Yeow V., Chong SS, Jee SH, Shi B., Christensen K., Melbye M., Doheny KF, Pugh EW, Ling H., Castilla EE, Czeizel AE, Ma L., Field LL, Brody L., Pangilinan F., Mills JL, Molloy AM, Kirke PN, Scott JM, Arcos-Burgos M., Scott AF Celogenomová asociační studie rozštěpu rtu s a bez rozštěpu patra identifikuje rizikové varianty blízko MAFB a ABCA4. (anglicky)  // Nature Genetics  : journal. - 2010. - Sv. 42 , č. 6 . - str. 525-529 . - doi : 10.1038/ng.580 . — PMID 20436469 .