IRF6

Regulační interferonový faktor 6
Identifikátory
SymbolIRF6  ; LPS; OFC6; JÁMA.; PPS; PPS1; VWS; VWS1
Externí IDOMIM:  607199 MGI :  1859211 HomoloGene :  4479 GeneCards : IRF6 Gene
ortology
PohledČlověkMyš
Entrez366454139
SouborENSG00000117595ENSMUSG00000026638
UniProtO14896P97431
RefSeq (mRNA)NM_001206696NM_016851
RefSeq (protein)NP_001193625NP_058547
Locus (UCSC)Chr 1:
209,96 – 209,98 Mb		Chr 1:
193,15 – 193,17 Mb
Hledejte v PubMed[jeden][2]

Interferonový regulační faktor 6 , také známý jako IRF6  , je protein , který je u lidí kódován genem IRF6 . [jeden]

Funkce

Tento gen kóduje člena rodiny interferonových transkripčních regulačních faktorů (IRF). Členové rodiny se dělí na vysoce konzervovanou doménu vázající DNA na N-konci helix-turn-helix a na méně konzervovanou doménu vázající protein na C-konci [2]

Funkce IRF6 je spojena s tvorbou pojivové tkáně , jako je ta v patře. [3] Tento gen kóduje člena rodiny interferonových transkripčních regulačních faktorů (MAF).

Patologie

Mutace v genu IRF6 může vést k autosomálně dominantnímu Van der Woude syndromu (VWS) [4] nebo přidruženému syndromu popliteálního pterygia [ ( PPS) .  [5]

Van der Woudeův syndrom může zahrnovat rozštěp rtu a patra , spolu se zubními abnormalitami a píštělemi rtů. Kromě toho jsou sdílené alely v IRF6 také spojeny s případy nesyndromového rozštěpu rtu a/nebo patra ve studiích genomové asociace a v mnoha studiích kandidátských genů. [6] Tyto poruchy jsou způsobeny mutacemi v genu IRF6 a některými fenotypovými heterogenitami různých typů mutací IRF6. [1] Jedno vysvětlení této fenotypové variace mezi syndromy je založeno na rozdílném účinku na strukturu dimerizovaných mutantních proteinů. Mutace VWS mohou vést k haploinsuficienci , zatímco mutace PPS mohou být výsledkem negativní dominance v přírodě. [7] Spektrum mutací VWS a PPS bylo nedávno shromážděno. [osm]

Bylo prokázáno, že IRF6 hraje důležitou roli ve vývoji keratinocytů. [9] [10] Role IRF6 u běžných forem rozštěpu rtu a patra byla také prokázána [11] a může vysvětlit ~ 20 % případů rozštěpu rtu. [12] Varianty IRF6 poskytly v několika studiích silný důkaz pro asociaci syndromového rozštěpu rtu a/nebo patra. Studie Birnbauma a kolegů v roce 2009 potvrdila vliv tohoto genu na etiologii rozštěpu rtu a/nebo patra a studie GENEVA Cleft Consortium , která studovala rodiny z několika populací, potvrdila zjištění, že mutace IRF6 jsou silně spojeny s rozštěpem. rtu a/nebo patra. Role IRF6 jako výsledek rozštěpu rtu a/nebo rozštěpu patra je podpořena analýzou IRF6 u mutantních myší, které vykazují hyperproliferativní epidermis, nepodléhají terminální diferenciaci, což má za následek mnohočetné epiteliální adheze, které mohou uzavřít ústní dutiny a vést k rozštěpu rtu . Studie na zvířatech ukazují, že IRF6 určuje proliferaci keratinocytů a také hraje klíčovou roli při tvorbě orálního peridermu.

Nedávno se pomocí myší genetiky, analýzy genové exprese, studií imunoprecipitace chromatinu a luciferázových testů ukázalo, že IRF6 je přímým cílem p63, který je základem několika malformačních syndromů zahrnujících rozštěpové rysy a p63 aktivuje transkripci IRF6 prostřednictvím zesilovacího prvku. IRF6. Změna zesilovacího prvku zvyšuje náchylnost pouze k rozštěpu rtu. A rozštěp rtu s nebo bez rozštěpu patra – tyto rysy byly pozorovány pouze u rodin s mutací IRF6. Kromě toho lze do stejné rodiny zařadit různé typy rozštěpů. [6]

Viz také

Poznámky

  1. ↑ 1 2 Kondo S., Schutte BC, Richardson RJ, Bjork BC, Knight AS, Watanabe Y., Howard E., de Lima RL, Daack-Hirsch S., Sander A., ​​​​McDonald-McGinn DM, Zackai EH , Lammer EJ, Aylsworth AS, Ardinger HH, Lidral AC, Pober BR, Moreno L., Arcos-Burgos M., Valencia C., Houdayer C., Bahuau M., Moretti-Ferreira D., Richieri-Costa A., Dixon MJ, Murray JC Mutace v IRF6 způsobují syndromy Van der Woude a popliteální pterygium   // Nat . Genet.  : deník. - 2002. - říjen ( roč. 32 , č. 2 ). - str. 285-289 . - doi : 10.1038/ng985 . — PMID 12219090 .
  2. ↑ Entrez Gene: IRF6 . Archivováno z originálu 7. března 2010.
  3. ↑ Blanton SH, Cortez A., Stal S., Mulliken JB, Finnell RH, Hecht JT Variace v IRF6 přispívá k nesyndromovému rozštěpu rtu a patra   // Am . J. Med. Genet. A : deník. - 2005. - září ( roč. 137A , č. 3 ). - str. 259-262 . - doi : 10.1002/ajmg.a.30887 . — PMID 16096995 .
  4. ↑ Van der Woude, A. Fistula labii inferioris congenita a její asociace s rozštěpem rtu a patra   // Am . J. Hum. Genet. : deník. - 1954. - Červen ( roč. 6 , č. 2 ). - str. 244-256 . — PMID 13158329 .
  5. ↑ Gorlin RJ, Sedano HO, Červenka J. Syndrom popliteálního pterygia. Syndrom zahrnující rozštěp rtu, podkolenní a mezikruální pterygii, digitální a genitální anomálie  (anglicky)  // Pediatrie : deník. — Americká akademie pediatrie, 1968. - únor ( sv. 41 ). - S. 503-509 . — PMID 4384166 .
  6. ↑ 1 2 Dixon MJ, Marazita ML, Beaty TH, Murray JC Rozštěp rtu a patra: pochopení genetických a environmentálních vlivů   // Nat . Rev. Genet.  : deník. - 2011. - březen ( roč. 12 , č. 3 ). - S. 167-178 . - doi : 10.1038/nrg2933 . — PMID 21331089 .
  7. ↑ Little HJ, Rorick NK, Su LI, Baldock C., Malhotra S., Jowitt T., Gakhar L., Subramanian R., Schutte BC, Dixon MJ, Shore P. Missense mutace, které způsobují Van der Woude syndrom a popliteální pterygium syndrom ovlivňuje DNA-vazebné a transkripční aktivační funkce IRF6   // Human Molecular Genetics : deník. — Oxford University Press , 2008. — Listopad ( roč. 18 , č. 3 ). - str. 535-545 . doi : 10.1093 / hmg/ddn381 . — PMID 19036739 .
  8. ↑ de Lima RL, Hoper SA, Ghassibe M. a kol. Prevalence a nenáhodná distribuce exonických mutací v interferonovém regulačním faktoru 6 (IRF6) u 307 rodin s Van der Woude syndromem a 37 rodin se syndromem popliteálního pterygia   // Genet . Med. : deník. - 2009. - Duben ( roč. 11 , č. 4 ). - str. 241-247 . - doi : 10.1097/GIM.0b013e318197a49a . — PMID 19282774 .
  9. ↑ Richardson RJ, Dixon J., Malhotra S., Hardman MJ, Knowles L., Boot-Handford RP, Shore P., Whitmarsh A., Dixon MJ Irf6 je klíčovým determinantem  přepínače proliferace a diferenciace keratinocytů  // Nat. Genet.  : deník. - 2006. - Listopad ( roč. 38 , č. 11 ). - S. 1329-1334 . - doi : 10.1038/ng1894 . — PMID 17041603 .
  10. ↑ Ingraham ČR, Kinoshita A., Kondo S., Yang B., Sajan S., Trout KJ, Malik MI, Dunnwald M., Goudy SL, Lovett M., Murray JC, Schutte BC Abnormální kožní, končetinová a kraniofaciální morfogeneze v myši deficientní na interferonový regulační faktor 6 (Irf6)  (anglicky)  // Nat. Genet.  : deník. - 2006. - Listopad ( roč. 38 , č. 11 ). - S. 1335-1340 . - doi : 10.1038/ng1903 . — PMID 17041601 .
  11. ↑ Zucchero TM, Cooper ME, Maher BS, Daack-Hirsch S., Nepomuceno B., Ribeiro L., Caprau D., Christensen K., Suzuki Y., Machida J., Natsume N., Yoshiura K., Vieira AR , Orioli IM, Castilla EE, Moreno L., Arcos-Burgos M., Lidral AC, Field LL, Liu YE, Ray A., Goldstein TH, Schultz RE, Shi M., Johnson MK, Kondo S., Schutte BC, Marazita ML, Murray JC Varianty genu pro regulační faktor 6 (IRF6) pro interferon a riziko izolovaného rozštěpu rtu nebo patra   // N. Engl . J. Med.  : deník. — Sv. 351 , č.p. 8 . - str. 769-780 . - doi : 10.1056/NEJMoa032909 . — PMID 15317890 .
  12. ↑ Rakhimov F., Marazita ML, Visel A., Cooper ME, Hitchler MJ, Rubini M., Domann FE, Govil M., Christensen K., Bille C., Melbye M., Jugessur A., ​​​​Lie RT, Wilcox AJ, Fitzpatrick DR, Green ED, Mossey PA, Little J., Steegers-Theunissen RP, Pennacchio LA , Schutte BC, Murray JC Narušení vazebného místa AP-2α v zesilovači IRF6 je silně spojeno s  rozštěpem rtu  Nat. Genet.  : deník. - 2008. - Listopad ( roč. 40 , č. 11 ). - S. 1341-1347 . - doi : 10.1038/ng.242 . — PMID 18836445 .