IRF3

Regulační faktor interferonu 3

PNR ve spojení s 1j2f.

Dostupné struktury

Ortologické vyhledávání: PDBe , RCSB

Seznam PDB ID
1J2F , 1QWT , 1T2K , 1ZOQ , 2O61 , 2O6G , 2PI0 , 3A77 , 3QU6

Identifikátory

Symbol

IRF3

Externí ID

OMIM: 603734 MGI : 1859179 HomoloGene : 1208 GeneCards : IRF3 Gene

Genová ontologie
Funkce	• Vazba na DNA • sekvenčně specifická DNA vazebná aktivita transkripčního faktoru • aktivita transkripčního kofaktoru • vazba na protein • identická vazba na protein • aktivita homodimerizace proteinu • vazba na DNA regulační oblasti transkripce
buněčná složka	• jádro • nukleoplazma • cytoplazma • cytosol
biologický proces	• negativní regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II • signální dráha toll-like receptoru • signální dráha toll -like receptoru nezávislá na MyD88 • transkripce z promotoru RNA polymerázy II • apoptotický proces • buněčná odpověď na podnět poškození DNA • virový proces • cytokiny zprostředkovaná signální dráha • lipopolysacharidy zprostředkovaná signální dráha • negativní regulace produkce interferonu typu I • pozitivní regulace produkce interferonu typu I • pozitivní regulace produkce interferonu-alfa • pozitivní regulace produkce interferonu-beta • signální dráha toll-like receptor 3 • signální dráha toll-like receptor 4 • TRIF- signální dráha závislého toll-like receptoru • signální dráha MDA-5 • pozitivní regulace I-kappaB kinázy/NF-kappaB signalizace • odpověď na exogenní dsRNA • vrozená imunitní odpověď • biosyntetický proces interferonu I. • negativní regulace biosyntetického procesu interferonu-beta • negativní regulace obranné reakce na virus hostitelem • pozitivní regulace cytokinové sekr • obranná odpověď na virus • signální dráha zprostředkovaná interferonem-gama • signální dráha interferonu I. typu • pozitivní regulace signální dráhy zprostředkované interferonem I. • buněčná odpověď na dsRNA • apoptotický proces makrofágů
Zdroje: Amigo / QuickGO

Profil exprese RNA

Více informací

ortology

Pohled

Člověk

Myš

Entrez

RefSeq (mRNA)

RefSeq (protein)

Locus (UCSC)

Chr 19:
50,16 – 50,17 Mb

Chr 7:
45 - 45 Mb

Hledejte v PubMed

[jeden]

[2]

Interferonový regulační faktor 3 , také známý jako IRF3 , je jedním z interferonových regulačních faktorů . [jeden]

Funkce

IRF3 je členem rodiny interferonových regulačních transkripčních faktorů (IRF). [1] IRF3 byl původně nalezen v homologech IRF1 a IRF2 . IRF3 byl dále charakterizován a bylo zjištěno, že obsahuje několik funkčních domén, včetně exportní domény jaderného signálu, vazebné domény DNA, asociace s C-terminální oblastí MAF a několik regulačních fosforylovaných míst. [2] IRF3 je v neaktivní cytoplazmatické formě, kdy fosforylace serinu / threoninu tvoří komplex s CREBBP [3] Tento komplex se translokuje do jádra a aktivuje transkripci interferonů alfa a beta, stejně jako dalších interferonem indukovaných genů . [čtyři]

IRF3 hraje důležitou roli v systému přirozené imunitní odpovědi na virovou infekci . [5] Bylo zjištěno , že agregované MAVS aktivují dimerizaci IRF3. [6]

Interakce

Ukázalo se, že IRF3 interaguje s IRF7 . [7]

Viz také

Interferon
IRF1 , IRF2 , IRF4 , IRF5 , IRF6 , IRF7 , IRF8 a IRF9

Poznámky

↑ 1 2 Hiscott J., Pitha P., Genin P., Nguyen H., Heylbroeck C., Mamane Y., Algarte M., Lin R. Spouštění interferonové odpovědi: role transkripčního faktoru IRF-3 . ) / / J. Interferon Cytokine Res. : deník. - 1999. - Sv. 19 , č. 1 . - str. 1-13 . - doi : 10.1089/107999099314360 . — PMID 10048763 .
↑ Lin R., Heylbroeck C., Genin P., Pitha PM, Hiscott J. Základní role interferonového regulačního faktoru 3 v přímé aktivaci transkripce RANTES chemokinů // Mol Cell Biol : deník. - 1999. - únor ( roč. 19 , č. 2 ). - S. 959-966 . — PMID 9891032 .
↑ Yoneyama M., Suhara W., Fujita T. Kontrola aktivace IRF-3 fosforylací (neopr.) // J. Interferon Cytokine Res.. - 2002. - V. 22 , č. 1 . - S. 73-6 . doi : 10.1089 / 107999002753452674 . — PMID 11846977 .
↑ Entrez Gen: IRF3 interferonový regulační faktor 3 . (neurčitý)
↑ Collins SE, Noyce RS, Mossman KL Přirozená buněčná odpověď na vstup virových částic vyžaduje IRF3, ale ne replikaci viru // J Virol : deník. - 2004. - únor ( roč. 78 , č. 4 ). - S. 1706-1717 . - doi : 10.1128/JVI.78.4.1706-1717.2004 . — PMID 14747536 .
↑ Hou F., Sun L., Zheng H., Skaug B., Jiang QX, Chen ZJ MAVS Forms Functional Prion-like Aggregates To Activate and Propagate Antiviral Innate Immune Response // Cell : journal. - Cell Press , 2011. - 5. srpna ( roč. 146 , č. 3 ). - S. 448-461 . - doi : 10.1016/j.cell.2011.06.041 . — PMID 21782231 .
↑ Au WC, Yeow WS, Pitha PM Analýza funkčních domén interferonového regulačního faktoru 7 a jeho asociace s IRF-3 // Virology : journal. - 2001. - únor ( roč. 280 , č. 2 ). - str. 273-282 . - doi : 10.1006/viro.2000.0782 . — PMID 11162841 .

Literatura

Pitha PM, Au WC, Lowther W., Juang YT, Schafer SL, Burysek L., Hiscott J., Moore PA Role interferonových regulačních faktorů (IRF) ve virem zprostředkované signalizaci a regulaci buněčného růstu (anglicky) / / Biochemie : deník. - 1999. - Sv. 80 , č. 8-9 . - S. 651-658 . - doi : 10.1016/S0300-9084(99)80018-2 . — PMID 9865487 .
Yoneyama M., Suhara W., Fujita T. Kontrola aktivace IRF-3 fosforylací (neopr.) // J. Interferon Cytokine Res.. - 2002. - V. 22 , č. 1 . - S. 73-6 . doi : 10.1089 / 107999002753452674 . — PMID 11846977 .
Au WC, Moore PA, Lowther W., Juang YT, Pitha PM Identifikace člena rodiny interferonových regulačních faktorů, který se váže na interferonem stimulovaný reakční element a aktivuje expresi interferonem indukovaných genů // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. - 1996. - Sv. 92 , č. 25 . - S. 11657-11661 . - doi : 10.1073/pnas.92.25.11657 . — PMID 8524823 .
Yoneyama M., Suhara W., Fukuhara Y., Fukuda M., Nishida E., Fujita T. Přímé spouštění interferonového systému typu I virovou infekcí: aktivace komplexu transkripčních faktorů obsahujících IRF-3 a CBP/p300 ( anglicky) // EMBO J. : deník. - 1998. - Sv. 17 , č. 4 . - S. 1087-1095 . - doi : 10.1093/emboj/17.4.1087 . — PMID 9463386 .
Weaver BK, Kumar KP, Reich NC interferonový regulační faktor 3 a CREB-vazebný protein/p300 jsou podjednotky transkripčního faktoru aktivovaného dvouvláknovou RNA DRAF1 // Mol . buňka. Biol. : deník. - 1998. - Sv. 18 , č. 3 . - S. 1359-1368 . — PMID 9488451 .
Lin R., Heylbroeck C., Pitha PM, Hiscott J. Na viru závislá fosforylace transkripčního faktoru IRF-3 reguluje jadernou translokaci, transaktivační potenciál a proteazomem zprostředkovanou degradaci // Mol . buňka. Biol. : deník. - 1998. - Sv. 18 , č. 5 . - S. 2986-2996 . — PMID 9566918 .
Ronco LV, Karpova AY, Vidal M., Howley PM Onkoprotein lidského papilomaviru 16 E6 se váže na regulační faktor-3 interferonu a inhibuje jeho transkripční aktivitu // Genes Dev . : deník. - 1998. - Sv. 12 , č. 13 . - S. 2061-2072 . - doi : 10.1101/gad.12.13.2061 . — PMID 9649509 .
Bellingham J., Gregory-Evans K., Gregory-Evans CY Mapování lidského interferonového regulačního faktoru 3 (IRF3) na chromozom 19q13.3-13.4 intragenním polymorfním markerem (anglicky) // Annals of Human Genetics : deník. - 1999. - Sv. 62 , č. Pt 3 . - str. 231-234 . - doi : 10.1046/j.1469-1809.1998.6230231.x . — PMID 9803267 .
Lowther WJ, Moore PA, Carter KC, Pitha PM Klonování a funkční analýza lidského promotoru IRF-3 // DNA Cell Biol . : deník. - 1999. - Sv. 18 , č. 9 . - S. 685-692 . doi : 10.1089 / 104454999314962 . — PMID 10492399 .
Kim T., Kim TY, Song YH, Min IM, Yim J., Kim TK Aktivace interferonového regulačního faktoru 3 v reakci na látky poškozující DNA // J. Biol. Chem. : deník. - 1999. - Sv. 274 , č.p. 43 . - S. 30686-30689 . doi : 10.1074 / jbc.274.43.30686 . — PMID 10521456 .
Kumar KP, McBride KM, Weaver BK, Dingwall C., Reich NC regulovaná jaderná cytoplazmatická lokalizace regulačního faktoru 3 interferonu, podjednotka faktoru 1 aktivovaného dvouvláknovou RNA // Mol . buňka. Biol. : deník. - 2000. - Sv. 20 , č. 11 . - str. 4159-4168 . - doi : 10.1128/MCB.20.11.4159-4168.2000 . — PMID 10805757 .
Suhara W., Yoneyama M., Iwamura T., Yoshimura S., Tamura K., Namiki H., Aimoto S., Fujita T. Analýzy virem indukovaných asociací homomerních a heteromerních proteinů mezi IRF-3 a koaktivátorem CBP/p300 (anglicky) // J. Biochem. : deník. - 2000. - Sv. 128 , č.p. 2 . - S. 301-307 . - doi : 10.1093/oxfordjournals.jbchem.a022753 . — PMID 10920266 .
Servant MJ, ten Oever B., LePage C., Conti L., Gessani S., Julkunen I., Lin R., Hiscott J. Identifikace odlišných signálních drah vedoucích interferonového regulačního faktoru 3 k J. Biol. Chem. : deník. - 2001. - Sv. 276 , č.p. 1 . - str. 355-363 . - doi : 10.1074/jbc.M007790200 . — PMID 11035028 .
Smith EJ, Marié I., Prakash A., García-Sastre A., Levy DE Fosforylace IRF3 a IRF7 v buňkách infikovaných virem nevyžaduje dvouvláknovou RNA-dependentní protein kinázu R nebo Ikappa B kinázu, ale je blokována virem vakcínie E3L protein (anglicky) // J. Biol. Chem. : deník. - 2001. - Sv. 276 , č.p. 12 . - S. 8951-8957 . - doi : 10.1074/jbc.M008717200 . — PMID 11124948 .
Au WC, Yeow WS, Pitha PM Analýza funkčních domén interferonového regulačního faktoru 7 a jeho asociace s IRF-3 (anglicky) // Virology : journal. - 2001. - Sv. 280 , č.p. 2 . - str. 273-282 . - doi : 10.1006/viro.2000.0782 . — PMID 11162841 .
Barnes BJ, Moore PA, Pitha PM Virus-specifická aktivace nového regulačního faktoru interferonu, IRF-5, vede k indukci odlišných genů interferonu alfa // J. Biol. Chem. : deník. - 2001. - Sv. 276 , č.p. 26 . - S. 23382-23390 . - doi : 10.1074/jbc.M101216200 . — PMID 11303025 .
Mach CM, Hargrove BW, Kunkel GR Protein aktivátoru genu pro malý RNA, SphI postoktamerový homologický faktor/faktor aktivující transkripci genu selenocystein tRNA, stimuluje transkripci genu lidského interferonového regulačního faktoru-3 (anglicky) // J. Biol . Chem. : deník. - 2002. - Sv. 277 , č.p. 7 . - S. 4853-4858 . - doi : 10.1074/jbc.M108308200 . — PMID 11724783 .
Morin P., Bragança J., Bandu MT, Lin R., Hiscott J., Doly J. J//Preferenční vazebná místa pro interferonové regulační faktory 3 a 7 zapojené do transkripce genu interferonu-A , Civas A. Biol. : deník. - 2002. - Sv. 316 , č.p. 5 . - S. 1009-1022 . - doi : 10.1006/jmbi.2001.5401 . — PMID 11884139 .
Dang O., Navarro L., Anderson K., David M. Špičková hrana: antrax letální toxin inhibuje aktivaci IFN-regulačního faktoru 3 lipopolysacharidem // J. Immunology: journal. - 2004. - Sv. 172 , č.p. 2 . - str. 747-751 . - doi : 10.4049/jimmunol.172.2.747 . — PMID 14707042 .