IRF9

Regulační faktor interferonu 9

Identifikátory

IRF9 ; IRF-9; ISGF3; ISGF3G; str. 48

Externí ID

OMIM: 147574 MGI : 107587 HomoloGene : 4436 GeneCards : IRF9 Gene

Genová ontologie
Funkce	• vazba na DNA regulační oblasti • sekvenčně specifická aktivita transkripčního faktoru vázajícího DNA • vazba na bílkoviny
buněčná složka	• jádro • nukleoplazma • cytoplazma • cytosol
biologický proces	• regulace transkripce podle templátu DNA • transkripce z promotoru RNA polymerázy II • signální dráha buněčného povrchového receptoru • signální dráha zprostředkovaná cytokiny • biosyntetický proces interferonu typu I • obranná odpověď na virus • signální dráha zprostředkovaná interferonem-gama • signální dráha interferonu I. typu
Zdroje: Amigo / QuickGO

ortology

Pohled

Člověk

Myš

Entrez

RefSeq (mRNA)

RefSeq (protein)

Locus (UCSC)

Chr 14:
24,63 – 24,64 Mb

Chr 14:
55,6 – 55,61 Mb

Hledejte v PubMed

[jeden]

[2]

Interferonový regulační faktor 9 je protein kódovaný u lidí genem IRF9 , dříve známým jako ISGF3G [1] [2] [3] . Kromě toho je tento gen znám jako p48, ISGF3 [3] .

Interakce

Ukázalo se, že IRF9 interaguje s proteiny STAT2 [4] [5] a STAT1 . [4] .

Poznámky

↑ Veals SA, Schindler C., Leonard D., Fu XY, Aebersold R., Darnell JE Jr, Levy DE Podjednotka transkripčního faktoru citlivého na alfa-interferon souvisí s interferonovým regulačním faktorem a Myb rodinami proteinů vázajících DNA ( anglicky) // Mol Cell Biol : deník. - 1992. - Srpen ( roč. 12 , č. 8 ). - S. 3315-3324 . — PMID 1630447 .
↑ McCusker D., Wilson M., Trowsdale J. Organizace genů kódujících aktivátory lidského proteazomu PA28alfa a beta // Immunogenetika: časopis. - 1999. - Červen ( roč. 49 , č. 5 ). - str. 438-445 . - doi : 10.1007/s002510050517 . — PMID 10199920 .
↑ 1 2 Entrez Gen: ISGF3G interferonem stimulovaný transkripční faktor 3, gama 48 kDa . (neurčitý)
↑ 12 Horvath , CM; Stark GR; KerrIM; Darnell J E. Interakce mezi STAT a non-STAT proteiny v interferonem stimulovaném genovém faktoru 3 transkripčním komplexu // Mol . buňka. Biol. : deník. - SPOJENÉ STÁTY AMERICKÉ, 1996. - Prosinec ( vol. 16 , č. 12 ). - S. 6957-6964 . — ISSN 0270-7306 . — PMID 8943351 .
↑ Martinez-Moczygemba, M; Gutch MJ; francouzský DL; Reich N C. Výrazná struktura STAT podporuje interakci STAT2 s podjednotkou p48 interferonem-alfa stimulovaného transkripčního faktoru ISGF3 // J. Biol. Chem. : deník. - SPOJENÉ STÁTY, 1997. - Srpen ( sv. 272 , č. 32 ). - S. 20070-20076 . — ISSN 0021-9258 . doi : 10.1074 / jbc.272.32.20070 . — PMID 9242679 .

Viz také

Interferon
IRF1 , IRF2 , IRF3 , IRF4 , IRF5 , IRF6 , IRF7 a IRF8

Literatura

Cebulla CM, Miller DM, Sedmak DD Virová inhibice přenosu interferonového signálu // Intervirologie : deník. - 2000. - Sv. 42 , č. 5-6 . - str. 325-330 . - doi : 10.1159/000053968 . — PMID 10702714 .
Reich NC Nukleární/cytoplazmatická lokalizace IRF v reakci na virovou infekci nebo stimulaci interferonem // J. Interferon Cytokine Res. : deník. - 2002. - Sv. 22 , č. 1 . - str. 103-109 . - doi : 10.1089/107999002753452719 . — PMID 11846981 .
Robertson NG, Khetarpal U., Gutierrez-Espeleta GA, a kol. Izolace nových a známých genů z knihovny lidské kochleární cDNA lidského plodu pomocí subtraktivní hybridizace a diferenciálního screeningu // Genomics : journal. - Academic Press , 1995. - Sv. 23 , č. 1 . - str. 42-50 . - doi : 10.1006/geno.1994.1457 . — PMID 7829101 .
David M., Romero G., Zhang ZY a kol. In vitro aktivace transkripčního faktoru ISGF3 interferonem alfa zahrnuje tyrosin fosfatázu a tyrosin kinázu spojenou s membránou // J. Biol. Chem. : deník. - 1993. - Sv. 268 , č.p. 9 . - str. 6593-6599 . — PMID 8454630 .
Horvath CM, Stark GR, Kerr IM, Darnell JE Interakce mezi STAT a non-STAT proteiny v interferonem stimulovaném genovém faktoru 3 transkripčním komplexu // Mol . buňka. Biol. : deník. - 1997. - Sv. 16 , č. 12 . - S. 6957-6964 . — PMID 8943351 .
Martinez-Moczygemba M., Gutch MJ, French DL, Reich NC Odlišná struktura STAT podporuje interakci STAT2 s podjednotkou p48 interferonem-alfa-stimulovaného transkripčního faktoru ISGF3 // J. Biol. Chem. : deník. - 1997. - Sv. 272 , č.p. 32 . - S. 20070-20076 . doi : 10.1074 / jbc.272.32.20070 . — PMID 9242679 .
Reddy PH, Stockburger E., Gillevet P., Tagle DA Mapování a charakterizace nových (CAG)n repetitivních cDNA z dospělého lidského mozku odvozených metodou zachycení oligo // Genomics : journal. - Academic Press , 1998. - Sv. 46 , č. 2 . - S. 174-182 . - doi : 10.1006/geno.1997.5044 . — PMID 9417904 .
Lau JF, Parisien JP, Horvath CM Subcelulární lokalizace regulačního faktoru interferonu je určena bipartitním jaderným lokalizačním signálem v doméně vázající DNA a interakcí s cytoplazmatickými retenčními faktory // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal . - 2000. - Sv. 97 , č. 13 . - str. 7278-7283 . - doi : 10.1073/pnas.97.13.7278 . — PMID 10860992 .
Nehyba J., Hrdlicková R., Burnside J., Bose HR A Novel Interferon Regulatory Factor (IRF), IRF-10, Has a Unique Role in Immune Defense and Is Induced by the v-Rel Oncoprotein // Mol . buňka. Biol. : deník. - 2002. - Sv. 22 , č. 11 . - S. 3942-3957 . - doi : 10.1128/MCB.22.11.3942-3957.2002 . — PMID 11997525 .
Chawla-Sarkar M., Leaman DW, Jacobs BS a kol. Rezistence na interferony v melanomových buňkách nekoreluje s expresí nebo aktivací signálního převodníku a aktivátoru transkripce 1 (Stat1 ) // J. Interferon Cytokine Res. : deník. - 2002. - Sv. 22 , č. 5 . - str. 603-613 . - doi : 10.1089/10799900252982089 . — PMID 12060499 .
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších sekvencí cDNA v plné délce // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal . - 2003. - Sv. 99 , č. 26 . - S. 16899-16903 . - doi : 10.1073/pnas.242603899 . — PMID 12477932 .
Lau JF, Nusinzon I., Burakov D. a kol. Role metazoálních mediátorových proteinů v transkripci reagující na interferon // Mol . buňka. Biol. : deník. - 2003. - Sv. 23 , č. 2 . - S. 620-628 . - doi : 10.1128/MCB.23.2.620-628.2003 . — PMID 12509459 .
Jikuya H., Takano J., Kikuno R. a kol. Charakterizace dlouhých cDNA klonů ze sleziny dospělého člověka. II. Kompletní sekvence 81 cDNA klonů // DNA Res . : deník. - 2003. - Sv. 10 , č. 1 . - str. 49-57 . - doi : 10.1093/dnares/10.1.49 . — PMID 12693554 .
Ota T., Suzuki Y., Nishikawa T. a kol. Kompletní sekvenování a charakterizace 21 243 lidských cDNA plné délky // Nat . Genet. : deník. - 2004. - Sv. 36 , č. 1 . - str. 40-5 . - doi : 10.1038/ng1285 . — PMID 14702039 .
Thompson HG, Harris JW, Lin L., Brody JP Identifikace proteinu Zibra, jeho genomická organizace, regulace a exprese v buňkách rakoviny prsu // Exp . Cell Res. : deník. - 2004. - Sv. 295 , č.p. 2 . - str. 448-459 . - doi : 10.1016/j.yexcr.2004.01.019 . — PMID 15093743 .
Sakamoto S., Potla R., Larner AC Histonová deacetylázová aktivita je nutná k rekrutování RNA polymerázy II do promotorů vybraných genů časné odezvy stimulovaných interferonem // J. Biol. Chem. : deník. - 2004. - Sv. 279 , č.p. 39 . - S. 40362-40367 . - doi : 10.1074/jbc.M406400200 . — PMID 15194680 .