IRF1

Regulační faktor interferon 1 je protein , který je u lidí kódován genem IRF1 . [1] [2]

Funkce

Regulační faktor Interferon 1 byl prvním členem rodiny interferonových regulačních transkripčních faktorů (IRF) , který byl identifikován. Nejprve byl popsán jako transkripční faktor schopný aktivovat expresi cytokinů interferonu beta , [3] , ale následně bylo zjištěno, že IRF-1 může fungovat jako transkripční aktivátor nebo represor různých cílových genů. IRF-1 reguluje expresi cílových genů vazbou na interferonové stimulační elementy (ISRE) ve svých promotorech . Protein IRF-1 se váže na ISRE prostřednictvím N-terminálních helix-turn-helix DNA-vazebných domén [4] , které jsou mezi všemi IRF proteiny vysoce konzervované.

Kromě své funkce jako transkripčního faktoru se také ukázalo, že IRF-1 je schopen transaktivovat tumor supresorový protein p53 prostřednictvím svého kofaktoru p300 . [5]

Ukázalo se, že IRF-1 hraje roli v imunitních odpovědích , které regulují apoptózu , poškození DNA a potlačení nádorů . [6]

Nařízení

Bylo zjištěno, že extrémní C-konec IRF-1 reguluje schopnost aktivovat transkripci, nanoprotilátky namířené do této oblasti (MF1) jsou schopny zvýšit aktivitu IRF-1. [7]

Modelové organismy

Ke studiu funkcí IRF1 byly použity modelové organismy . Provizorní knockout myší kmen , nazvaný Irf1 tm1a(EUCOMM)Wtsi , [11] [12] byl vytvořen v rámci mezinárodního programu Knockout Mouse Consortium - velkého projektu mutageneze k vytvoření a distribuci modelových zvířat pro výzkum nemocí zainteresovanými subjekty. vědci - v Sangerově institutu . [13] [14] [15]

Samci a samice podstoupili standardní fenotypové testování ke stanovení účinku odstranění. [9] [16] Bylo provedeno 25 studií a dva fenotypové parametry byly shledány abnormálními. Homozygotní mutantní zvířata vykazovala patologii lymfocytů periferní krve , zejména snížení počtu CD8 pozitivních T buněk a NK buněk a zvýšení CD4 pozitivních T buněk. Myši měly také abnormální kožní fenotypy , jak bylo stanoveno vyšetřením kaudální epidermis . [9]

Interakce

Ukázalo se, že IRF1 interaguje s:

• CHIP [17]
• GAGE [18]
• HSP70 / HSP90 [19]
• IRF8 [20] [21]
• KPNA2 [22]
• MYD88 [23]
• PCAF [24]
• STAT1 [25]
• TAT [26]
• VEGFR2 [27]

Viz také

• Interferon
• IRF1, IRF2 , IRF3 , IRF4 , IRF5 , IRF6 , IRF7 , IRF8 a IRF9

Poznámky

1. ↑ Maruyama M., Fujita T., Taniguchi T. Sekvence cDNA kódující lidský IRF-1  //  Nucleic Acids Res : deník. - 1989. - Červen ( roč. 17 , č. 8 ). — S. 3292 . doi : 10.1093 / nar/17.8.3292 . — PMID 2726461 .
2. ↑ Itoh S., Harada H., Nakamura Y., White R., Taniguchi T. Assignment of the human interferon regulator factor-1 (IRF1) gene to chromozom 5q23-q31  //  Genomics :  journal. - Academic Press , 1991. - Listopad ( roč. 10 , č. 4 ). - S. 1097-1099 . - doi : 10.1016/0888-7543(91)90208-V . — PMID 1680796 .
3. ↑ Miyamoto M., Fujita T., Kimura Y., Maruyama M., Harada H., Sudo Y., Miyata T., Taniguchi T. Regulovaná exprese genu kódujícího jaderný faktor, IRF-1, který se specificky váže na Regulační prvky genu IFN-beta  (anglicky)  // Cell  : journal. - Cell Press , 1988. - Září ( roč. 54 , č. 6 ). - S. 903-913 . - doi : 10.1016/S0092-8674(88)91307-4 . — PMID 3409321 .
4. ↑ Escalante ČR, Yie J., Thanos D., Aggarwal AK Struktura IRF-1 s navázanou DNA odhaluje determinanty regulace interferonu  //  Nature: journal. - 1998. - Leden ( roč. 391 , č. 6662 ). - str. 103-106 . - doi : 10.1038/34224 . — PMID 9422515 .
5. ↑ Dornan D., Eckert M., Wallace M., Shimizu H., Ramsay E., Hupp TR, Ball KL Vazba interferonového regulačního faktoru 1 na p300 stimuluje na DNA závislou acetylaci p53   // Mol . buňka. Biol. : deník. - 2004. - Listopad ( roč. 24 , č. 22 ). - S. 10083-10098 . - doi : 10.1128/MCB.24.22.10083-10098.2004 . — PMID 15509808 .
6. ↑ Entrez Gen: IRF1 interferonový regulační faktor 1 . Archivováno z originálu 8. března 2010. (neurčitý)
7. ↑ Möller A., ​​​​Pion E., Narayan V., Ball KL Intracelulární aktivace interferonového regulačního faktoru-1 nanobodies do multifunkční (Mf1) domény  //  J. Biol. Chem.  : deník. - 2010. - prosinec ( roč. 285 , č. 49 ). - S. 38348-38361 . - doi : 10.1074/jbc.M110.149476 . — PMID 20817723 .
8. ↑ Údaje o infekci Citrobacter pro Irf1 . Vítejte Trust Sanger Institute. Získáno 19. března 2015. Archivováno z originálu 3. dubna 2015. (neurčitý)
9. ↑ 1 2 3 Gerdin AK The Sanger Mouse Genetics Program: Vysoce výkonná charakterizace knockout myší  //  Acta Ophthalmologica : deník. - Wiley-Liss , 2010. - Sv. 88 , č. S248 . - doi : 10.1111/j.1755-3768.2010.4142.x .
10. ↑ Portál zdrojů myši Archivováno 24. prosince 2011 na Wayback Machine , Wellcome Trust Sanger Institute.
11. ↑ International Knockout Mouse Consortium (odkaz není dostupný) . Získáno 19. března 2015. Archivováno z originálu 20. března 2012. (neurčitý) 
12. ↑ Informatika genomu myši . Datum přístupu: 19. března 2015. Archivováno z originálu 9. ledna 2015. (neurčitý)
13. ↑ Skarnes WC, Rosen B., West AP, Koutsourakis M., Bushell W., Iyer V., Mujica AO, Thomas M., Harrow J., Cox T., Jackson D., Severin J., Biggs P., Fu J., Nefedov M., de Jong PJ, Stewart AF, Bradley A. Podmíněný knockout zdroj pro genomovou studii funkce myšího genu  //  Nature: journal. - 2011. - Sv. 474 , č.p. 7351 . - str. 337-342 . - doi : 10.1038/příroda10163 . — PMID 21677750 .
14. ↑ Knihovna Dolgin E. Mouse nastavena jako knockout   // Nature . - 2011. - Červen ( roč. 474 , č. 7351 ). - str. 262-263 . - doi : 10.1038/474262a . — PMID 21677718 .
15. ↑ Collins FS, Rossant J., Wurst W. Myš ze všech důvodů   // Cell . - Cell Press , 2007. - Leden ( roč. 128 , č. 1 ). - S. 9-13 . - doi : 10.1016/j.cell.2006.12.018 . — PMID 17218247 .
16. ↑ van der Weyden L., White JK, Adams DJ, Logan DW Sada nástrojů pro genetiku myši: odhalující funkce a mechanismus. (anglicky)  // Genome Biol : deník. - 2011. - Sv. 12 , č. 6 . — S. 224 . - doi : 10.1186/cz-2011-12-6-224 . — PMID 21722353 .
17. ↑ Narayan V., Pion E., Landré V., Müller P., Ball KL Ubikvitinace interferonového regulačního faktoru-1 tumor supresorového proteinu závislá na dokování pomocí ubikvitin ligázy CHIP  // J Biol Chem  .  : deník. - 2010. - říjen ( roč. 286 , č. 1 ). - S. 607-619 . - doi : 10.1074/jbc.M110.153122 . — PMID 20947504 .
18. ↑ Kular RK, Yehiely F., Kotlo KU, Cilensek ZM, Bedi R., Deiss LP GAGE, antiapoptotický protein váže a moduluje expresi nukleofosminu/B23 a regulačního faktoru interferonu 1  //  J. Interferon Cytokine Res . : deník. - 2009. - říjen ( roč. 29 , č. 10 ). - S. 645-655 . - doi : 10.1089/jir.2008.0099 . — PMID 19642896 .
19. ↑ Narayan V., Eckert M., Zylicz A., Zylicz M., Ball KL Kooperativní regulace interferonového regulačního faktoru-1 tumor supresorového proteinu základními složkami molekulárního chaperonového aparátu  // J Biol Chem  .  : deník. - 2009. - září ( roč. 284 , č. 38 ). - S. 25889-25899 . - doi : 10.1074/jbc.M109.019505 . — PMID 19502235 .
20. ↑ Schaper F., Kirchhoff S., Posern G., Köster M., Oumard A., Sharf R., Levi BZ, Hauser H. Funkční domény interferonového regulačního faktoru I (IRF-1  )  // Biochem. J. : deník. - 1998. - říjen ( roč. 335 , č. 1 ). - S. 147-157 . — PMID 9742224 .
21. ↑ Sharf R., Azriel A., Lejbkowicz F., Winograd SS, Ehrlich R., Levi BZ Funkční doménová analýza proteinu vázajícího konsensus interferonové sekvence (ICSBP) a jeho asociace s interferonovými regulačními faktory  //  J. Biol . Chem.  : deník. - 1995. - Červen ( roč. 270 , č. 22 ). - S. 13063-13069 . doi : 10.1074/ jbc.270.22.13063 . — PMID 7768900 .
22. ↑ Umegaki N., Tamai K., Nakano H., Moritsugu R., Yamazaki T., Hanada K., Katayama I., Kaneda Y. Diferenciální regulace exprese karyoferinu alfa 2 pomocí TGF-beta1 a IFN-gama u normálního člověka epidermální keratinocyty: evidentní příspěvek KPNA2 k jaderné translokaci IRF-1  //  J. Invest. Dermatol. : deník. - 2007. - Červen ( roč. 127 , č. 6 ). - S. 1456-1464 . - doi : 10.1038/sj.jid.5700716 . — PMID 17255955 .
23. ↑ Negishi H., Fujita Y., Yanai H., Sakaguchi S., Ouyang X., Shinohara M., Takayanagi H., Ohba Y., Taniguchi T., Honda K. Důkaz pro licencování IFN-gama-indukovaného IFN regulační faktor 1 transkripční faktor od MyD88 v programu indukce genu závislého na Toll-like receptoru  (anglicky)  // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America  : journal. - 2006. - říjen ( roč. 103 , č. 41 ). - S. 15136-15141 . - doi : 10.1073/pnas.0607181103 . — PMID 17018642 .
24. ↑ Masumi A., Wang IM, Lefebvre B., Yang XJ, Nakatani Y., Ozato K. Histonacetyláza PCAF je forbolesterem indukovatelný koaktivátor z rodiny IRF, který poskytuje zvýšenou  citlivost na interferon  Mol// buňka. Biol. : deník. - 1999. - březen ( roč. 19 , č. 3 ). - S. 1810-1820 . — PMID 10022868 .
25. ↑ Chatterjee-Kishore M., van Den Akker F., Stark GR Adenovirus E1A downreguluje transkripci LMP2 tím, že interferuje s vazbou stat1 na IRF1  //  J. Biol. Chem.  : deník. - 2000. - Červenec ( roč. 275 , č. 27 ). - S. 20406-20411 . - doi : 10.1074/jbc.M001861200 . — PMID 10764778 .
26. ↑ Sgarbanti M., Borsetti A., Moscufo N., Bellocchi MC, Ridolfi B., Nappi F., Marsili G., Marziali G., Coccia EM, Ensoli B., Battistini A. Modulace replikace viru lidské imunodeficience 1 regulační faktory interferonu  (anglicky)  // Journal of Experimental Medicine : deník. — Rockefeller University Press, 2002. — Květen ( roč. 195 , č. 10 ). - S. 1359-1370 . - doi : 10.1084/jem.20010753 . — PMID 12021315 .
27. ↑ Lee JH, Chun T., Park SY, Rho SB Interferonový regulační faktor-1 (IRF-1) reguluje angiogenezi indukovanou VEGF v HUVEC   // Biochim . Biophys. Acta : deník. - 2008. - září ( roč. 1783 , č. 9 ). - S. 1654-1662 . - doi : 10.1016/j.bbamcr.2008.04.006 . — PMID 18472010 .

Literatura

• Harada H., Taniguchi T., Tanaka N. Role interferonových regulačních faktorů v interferonovém systému a kontrole buněčného růstu  (anglicky)  // Biochimie : deník. - 1999. - Sv. 80 , č. 8-9 . - S. 641-650 . - doi : 10.1016/S0300-9084(99)80017-0 . — PMID 9865486 .
• Pitha PM, Au WC, Lowther W., Juang YT, Schafer SL, Burysek L., Hiscott J., Moore PA Role interferonových regulačních faktorů (IRF) ve virem zprostředkované signalizaci a regulaci buněčného růstu  (anglicky)  / / Biochemie : deník. - 1999. - Sv. 80 , č. 8-9 . - S. 651-658 . - doi : 10.1016/S0300-9084(99)80018-2 . — PMID 9865487 .
• Yu-Lee L. Stimulace interferonového regulačního faktoru-1 prolaktinem  (anglicky)  // Lupus : journal. - 2002. - Sv. 10 , č. 10 . - S. 691-699 . - doi : 10.1191/096120301717164921 . — PMID 11721695 .
• Pine R. IRF a tuberkulóza  (neopr.)  // J. Interferon Cytokine Res.. - 2002. - T. 22 , č. 1 . - S. 15-25 . - doi : 10.1089/107999002753452629 . — PMID 11846972 .
• Romeo G., Fiorucci G., Chiantore MV, Percario ZA, Vannucchi S., Affabris E. IRF-1 jako negativní regulátor buněčné proliferace  (neopr.)  // J. Interferon Cytokine Res.. - 2002. - T. 22 , č. 1 . - S. 39-47 . - doi : 10.1089/107999002753452647 . — PMID 11846974 .
• Cha Y., Sims SH, Romine MF, Kaufmann M., Deisseroth AB Lidský interferonový regulační faktor 1: organizace intronu a exonu  (anglicky)  // DNA Cell Biol. : deník. - 1992. - Sv. 11 , č. 8 . - S. 605-611 . - doi : 10.1089/dna.1992.11.605 . — PMID 1382447 .
• Harada H., Fujita T., Miyamoto M., Kimura Y., Maruyama M., Furia A., Miyata T., Taniguchi T. Strukturně podobné, ale funkčně odlišné faktory, IRF-1 a IRF-2, se váží na stejné regulační prvky IFN a IFN-indukovatelné geny  (anglicky)  // Cell  : journal. - Cell Press , 1989. - Sv. 58 , č. 4 . - str. 729-739 . - doi : 10.1016/0092-8674(89)90107-4 . — PMID 2475256 .
• Miyamoto M., Fujita T., Kimura Y., Maruyama M., Harada H., Sudo Y., Miyata T., Taniguchi T. Regulovaná exprese genu kódujícího jaderný faktor, IRF-1, který se specificky váže na IFN -regulační prvky genu beta  (anglicky)  // Cell  : journal. - Cell Press , 1988. - Sv. 54 , č. 6 . - S. 903-913 . - doi : 10.1016/S0092-8674(88)91307-4 . — PMID 3409321 .
• Harada H., Takahashi E., Itoh S., Harada K., Hori TA, Taniguchi T. Struktura a regulace genů lidského interferonového regulačního faktoru 1 (IRF-1) a IRF-2: implikace pro genovou síť v interferonový systém  (anglicky)  // Mol. buňka. Biol. : deník. - 1994. - Sv. 14 , č. 2 . - S. 1500-1509 . — PMID 7507207 .
• Sharf R., Azriel A., Lejbkowicz F., Winograd SS, Ehrlich R., Levi BZ Funkční doménová analýza proteinu vázajícího konsensus interferonové sekvence (ICSBP) a jeho asociace s regulačními faktory interferonu  (anglicky)  // J. Biol. Chem.  : deník. - 1995. - Sv. 270 , č.p. 22 . - S. 13063-13069 . doi : 10.1074/ jbc.270.22.13063 . — PMID 7768900 .
• Willman CL, Sever CE, Pallavicini MG, Harada H., Tanaka N., Slovak ML, Yamamoto H., Harada K., Meeker TC, List AF Deletion of IRF-1, mapping na chromozom 5q31.1, u lidské leukémie a preleukemická myelodysplazie  (anglicky)  // Science : journal. - 1993. - Sv. 259 , č.p. 5097 . - S. 968-971 . - doi : 10.1126/science.8438156 . — PMID 8438156 .
• Drew PD, Franzoso G., Becker KG, Bours V., Carlson LM, Siebenlist U., Ozato K. NF kappa B a interferonový regulační faktor 1 fyzicky interagují a synergicky indukují expresi hlavního genu histokompatibility I. třídy  //  J Interferon Cytokine Res. : deník. - 1997. - Sv. 15 , č. 12 . - S. 1037-1045 . - doi : 10.1089/jir.1995.15.1037 . — PMID 8746784 .
• Ronco LV, Karpova AY, Vidal M., Howley PM Onkoprotein lidského papilomaviru 16 E6 se váže na regulační faktor-3 interferonu a inhibuje jeho transkripční aktivitu  // Genes Dev  .  : deník. - 1998. - Sv. 12 , č. 13 . - S. 2061-2072 . - doi : 10.1101/gad.12.13.2061 . — PMID 9649509 .
• Nozawa H., Oda E., Ueda S., Tamura G., Maesawa C., Muto T., Taniguchi T., Tanaka N. Funkčně inaktivující bodová mutace v tumor-supresorovém genu IRF-1 identifikovaném u lidské rakoviny žaludku  ( anglicky)  // Int. J. Cancer : deník. - 1998. - Sv. 77 , č. 4 . - str. 522-527 . - doi : 10.1002/(SICI)1097-0215(19980812)77:4<522::AID-IJC8>3.0.CO;2-W . — PMID 9679752 .
• Schaper F., Kirchhoff S., Posern G., Köster M., Oumard A., Sharf R., Levi BZ, Hauser H. Funkční domény interferonového regulačního faktoru I (IRF-1)  (anglicky)  // Biochem. J. : deník. - 1998. - Sv. 335 , č.p. 1 . - S. 147-157 . — PMID 9742224 .
• Masumi A., Wang IM, Lefebvre B., Yang XJ, Nakatani Y., Ozato K. Histonacetyláza PCAF je forbol-esterem indukovatelný koaktivátor z rodiny IRF, který propůjčuje zvýšenou citlivost na interferon  (anglicky)  // Mol. buňka. Biol. : deník. - 1999. - Sv. 19 , č. 3 . - S. 1810-1820 . — PMID 10022868 .