GROMACS

GROMACS
Typ Modelování
Vývojář Univerzita v Groningenu
Zapsáno v C / C++
Operační systém Křížová platforma
Nejnovější verze
Čitelné formáty souborů GROMACS Residue Topology [d] a GROMACS Residue Topology (s rem) [d]
Vygenerované formáty souborů GROMACS Residue Topology [d] a GROMACS Residue Topology (s rem) [d]
Licence GNU General Public License
webová stránka gromacs.org

GROMACS ( anglicky  groningen stroj pro chemické simulace , Groningen stroj pro chemickou simulaci ) je softwarový balík pro modelování fyzikálních a chemických procesů v molekulární dynamice . Vyvinutý týmem Hermanna Berendsena na katedře biofyzikální chemie na Univerzitě v Groningenu . V současné době je vyvíjen a podporován úsilím nadšenců, mezi něž patří zástupci University of Uppsala a Royal Institute of Technology . Balíček je určen pro modelování biomolekul (například molekul proteinů a lipidů) mající mnoho spojených interakcí mezi atomy. Poskytuje vysokorychlostní výpočty pro nesouvisející interakce. Je považován za jeden z nejrychlejších nástrojů. Je to bezplatný a open source software. Zdrojový kód je dostupný pod licencí GPL .

Viz také

Programy používané v modelování podle prvních principů

Poznámky

  1. ↑ Poznámky k vydání GROMACS 2018.1 

Odkazy