Haloquadratum walsbyi

Haloquadratum walsbyi
vědecká klasifikace
Doména:ArchaeaTyp:EuryarcheotesTřída:halobakterieObjednat:Haloferacales Gupta a kol. 2015Rodina:HaloferacaceaeRod:Haloquadratum Burns a kol. 2007Pohled:Haloquadratum walsbyi
Mezinárodní vědecký název
Haloquadratum walsbyi Burns a kol. 2007

Haloquadratum walsbyi  (lat.)  je jediný druh halofilní archaea rodu Haloquadratum [1] , zařazený do čeledi Haloferacaceae ze třídy halobakterií ( Halobacteria ) [2] . Neobvyklý tím, že jeho buňky mají plochý čtvercový tvar [3] .

Tato archaea byla objevena v roce 1980 A. E. Walsbym v pobřežním podvodním slaném jezeře na Sinajském poloostrově v Egyptě a formálně popsána Burnsem a kolegy v roce 2007. Organismy jsou pozoruhodné díky tvaru extrémně tenkých (asi 0,15 µm tlustých) buněk, blízkých pravidelnému čtvercovému tvaru. Laboratorně nekultivován až do roku 2004 [4] .

Struktura a život

Buňky této archaea obvykle obsahují polyhydroxyalkanoátová granula a také velké množství refrakčních a plynem naplněných vakuol, které buňkám poskytují vztlak, udržují je na vodní hladině a pomáhají umístit buňky do správných úhlů pro maximální světlo. účinnost zachycení [5] . Organismy se mohou vzájemně spojovat a vytvářet křehké pláty o šířce až 40 mikrometrů.

H. walsbyi lze nalézt v solných pánvích po celém světě. Když se mořská voda odpařuje z mělkých vodních útvarů, dochází k postupné koncentraci a srážení uhličitanu vápenatého a síranu vápenatého, což má za následek tvorbu nasycené solanky. Další odpařování vede k vysrážení chloridu sodného ( halitu ) a následně ke vzniku koncentrovaného roztoku chloridu hořečnatého. V konečné fázi tvorby halitových krystalů, než vysoká koncentrace chloridu hořečnatého učiní vodu v jezeře sterilní, H. walsbyi se množí a může představovat asi 80 % biomasy solného jezírka. Laboratorně jsou tyto archaea kultivovány v prostředí s velmi vysokou koncentrací chloridů (více než 2 mol/l MgCl 2 a více než 3 mol/l NaCl), v tomto smyslu jsou jedním z nejhalofilnějších organismů na planetě. Je třeba poznamenat, že optimální teplota pro život Haloquadratum je 40 °C.

Genetika

Mapování genomu H. walsbyi dokončeno. To vědcům umožnilo lépe porozumět genealogii a taxonomii organismu a roli, kterou hraje v ekosystému. Genomické srovnání španělských a australských izolátů (kmeny HBSQ001 a C23T) ukázalo významnou podobnost genomů a zachování genového řádu, což ukazuje na rychlé a globální rozšíření druhu.

Ekologie

Přesná role H. walsbyi v ekosystému není známa, ale vzhledem k její jedinečné morfologii může studium této archaea poskytnout důležité informace týkající se evoluce a morfologické adaptace domény.

Poznámky

  1. Rod Haloquadratum  : [ angl. ]  // LPSN.  (Přístup: 4. října 2017) .
  2. Klasifikace domén a kmenů - Hierarchická klasifikace prokaryot (bakterií) : Verze 2.0  : [ eng. ]  // LPSN. - 2016. - 2. října.
  3. Stoeckenius W. Walsbyho čtvercová bakterie: jemná struktura ortogonálního prokaryota  : [ ang. ] // Journal of Bacteriology. - 1981. - Sv. 148, č.p. 1 (1. října). - S. 352-360. — ISSN 0021-9193 .
  4. David G. Burns, Peter H. Janssen, Takashi Itoh, Masahiro Kamekura, Zhuo Li. Haloquadratum walsbyi gen. nov., sp. listopadu, čtvercový haloarchaeon Walsby, izolovaný ze salternových krystalizátorů v Austrálii a Španělsku  // International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. - 2007. - T. 57 , č. 2 . - S. 387-392 . - doi : 10.1099/ijs.0.64690-0 . Archivováno z originálu 18. září 2018.
  5. Aharon Oren, Nuphar Pri-El, Orr Shapiro, Nachshon Siboni. Studie vztlaku v přirozených společenstvích čtvercových plyno-vakuolových archaea v nádržích salternativních krystalizátorů  // Saline Systems. - 2006-04-14. - T. 2 . - S. 4 . — ISSN 1746-1448 . - doi : 10.1186/1746-1448-2-4 . Archivováno z originálu 11. června 2020.