ImageJ

Aktuální verze stránky ještě nebyla zkontrolována zkušenými přispěvateli a může se výrazně lišit od verze recenzované 9. dubna 2015; kontroly vyžadují 24 úprav .
ImageJ

Snímek obrazovky ImageJ
Typ Zpracování obrazu
Vývojář Wayne Rasband ( NIH )
Zapsáno v Java [1]
Operační systém Jakékoli ( založené na Javě )
Hardwarová platforma Java virtuální stroj
Nejnovější verze 1,52u (17. března 2020)
Licence veřejná doména
webová stránka imagej.net
 Mediální soubory na Wikimedia Commons

ImageJ  je open source program pro analýzu a zpracování obrazu . Napsáno v Javě zaměstnanci National Institutes of Health [2] a distribuováno bez licenčních omezení ve veřejné doméně . Otevřené API umožňuje flexibilně zvyšovat funkčnost prostřednictvím zásuvných modulů a vestavěný jazyk maker  automatizuje složité opakující se akce [3] . ImageJ je široce používán v biomedicínském výzkumu, astronomii , geografii a dalších oborech analýzy obrazu jako alternativa k proprietárnímu softwaru .

Zásuvné moduly třetích stran pokrývají širokou škálu úloh analýzy a zpracování obrazu: umožňují 3D vizualizaci od buněk po radiologické snímky [4] , automatická porovnávání [5] až po vytváření automatizovaných studijních systémů, například v hematologii [6] . Zásuvná architektura ImageJ a vestavěný vývojový systém činí tuto platformu velmi oblíbenou pro práci a výuku analýzy a zpracování obrazu [7] [8] .

ImageJ můžete používat prostřednictvím online apletu nebo stažením aplikace. Aplikace funguje na všech operačních systémech, pro které existuje verze Java Virtual Machine od 1.4: Microsoft Windows , Mac OS , Mac OS X , Linux a Sharp Zaurus PDA . Zdrojový kód ImageJ je volně dostupný [9] .

Ideologem a vývojářem projektu je Wayne Rasband (Pobočka výzkumných služeb Národního ústavu duševního zdraví).

Funkce

ImageJ umožňuje zobrazovat, upravovat, analyzovat, zpracovávat, ukládat a tisknout 8bitové, 16bitové a 32bitové obrázky. Program umí číst mnoho obrazových formátů, zejména TIFF , PNG , GIF , JPEG , BMP , DICOM , FITS , a také formáty surových dat. ImageJ podporuje zásobníky  – sérii obrázků kombinovaných v jednom okně a na víceprocesorových systémech lze paralelně provádět vícevláknové pracné operace. V ImageJ můžete vypočítat plochu a statistiku hodnot pixelů oblastí snímku vybraných ručně nebo pomocí prahových funkcí, měřit vzdálenosti a úhly. vytvářet histogramy hustoty a kreslit profily čar. ImageJ podporuje základní funkce zpracování obrazu, jako jsou logické a aritmetické operace mezi obrazy, manipulace s kontrastem, konvoluce , Fourierova analýza , ostření, vyhlazování , detekce hran a střední filtr . Program umožňuje provádět geometrické transformace : změnu měřítka , rotaci, odraz atd. Počet současně používaných obrázků je omezen pouze velikostí dostupné paměti.

Historie

Před ImageJ v roce 1997 byla podobná analýza obrazu možná s bezplatným programem NIH Image pro počítače Macintosh a operační systémy až po Mac OS X. Jeho vývojem byl program Image SXM pro práci s obrázky získanými na rastrovacích mikroskopech používaných pro fyzikální výzkum. Byla také vyvinuta verze pro Windows , spravovaná společností Scion Corporation. Obě verze jsou stále dostupné [10] .

Poznámky

  1. ↑ Projekt image_j Open Source na Open Hub: Stránka jazyků - 2006.
  2. ↑ Collins TJ ImageJ pro  mikroskopii //  BioTechniques : deník. - 2007. - Červenec ( roč. 43 , č. 1 Suppl ). - str. 25-30 . - doi : 10.2144/000112517 . — PMID 17936939 .
  3. ↑ Girish V., Vijayalakshmi A. Cenově dostupná analýza obrazu pomocí NIH Image/ImageJ   // Indian J Cancer : deník. - 2004. - Sv. 41 , č. 1 . — Str. 47 . — PMID 15105580 . Archivováno z originálu 11. dubna 2011.
  4. ↑ Barboriak D., Padua A., York G., Macfall J. Vytváření aplikací podporujících DICOM pomocí ImageJ  (neurčité)  // J Digit Imaging. - 2005. - T. 18 , č. 2 . - S. 91-9 . - doi : 10.1007/s10278-004-1879-4 . — PMID 15827831 .
  5. ↑ Rajwa B., McNally H., Varadharajan P., Sturgis J., Robinson J. Vizualizace a porovnání dat AFM/CLSM pomocí sady nástrojů s otevřeným zdrojovým kódem  //  Microsc Res Tech : deník. - 2004. - Sv. 64 , č. 2 . - S. 176-184 . - doi : 10.1002/jemt.20067 . — PMID 15352089 .
  6. ↑ Gering E., Atkinson C. Rychlá metoda pro počítání jaderných erytrocytů na obarvených krevních nátěrech pomocí digitální analýzy obrazu  // J  Parasitol : deník. - 2004. - Sv. 90 , č. 4 . - S. 879-881 . - doi : 10.1645/GE-222R . — PMID 15357090 .
  7. ↑ Burger W., Burge M. Digitální zpracování obrazu : Algoritmický přístup pomocí Javy  . - Springer , 2007. - ISBN 1846283795 . Archivováno 17. května 2014 na Wayback Machine
  8. ↑ Dougherty , G. Digitální zpracování obrazu pro lékařské aplikace  . - Cambridge University Press , 2009. - ISBN 9780521860857 .
  9. ↑ Rueden CT, Eliceiri KW Vizualizační přístupy pro multidimenzionální biologická obrazová data  (italsky)  // BioTechniques : deník. - 2007. - Luglio ( v. 43 , č. 1 Suppl ). - str. 31, 33-6 . - doi : 10.2144/000112511 . — PMID 17936940 .
  10. ↑ Obrázek NIH: O . Získáno 18. listopadu 2008. Archivováno z originálu dne 20. dubna 2012.

Literatura


Odkazy

Distribuce

Pro usnadnění nasazení softwaru je ImageJ distribuován také jako součást distribucí.

Pluginy

NIH Image Program