POLR2D

Polypeptid D RNA polymeráza II (řízená DNA)

PNR je reprezentován příkladem 2c35.

Dostupné struktury

Ortologické vyhledávání: PDBe , RCSB

Seznam PDB ID
2C35

Identifikátory

Symbol

POLR2D ; HSRBP4; HSRPB4; RBP4; RPB16

Externí ID

OMIM: 606017 MGI : 1916491 HomoloGene : 37968 GeneCards : POLR2D Gene

EC číslo

2.7.7.6

Genová ontologie
Funkce	• nukleotidová vazba • vazba jednovláknové DNA • vazba jednovláknové RNA • aktivita RNA polymerázy řízená DNA • vazba faktoru iniciace translace
buněčná složka	• tělo zpracovávající cytoplazmatickou mRNA • jádro • nukleoplazma • DNA-řízená RNA polymeráza II, jádrový komplex
biologický proces	• katabolický proces mRNA transkribované do jádra, rozpad závislý na deadenylaci • sestřih mRNA, přes spliceosom • oprava DNA • oprava nukleotidovou excizí spojenou s transkripcí • oprava nukleotidovou excizí • transkripce z promotoru RNA polymerázy II • iniciace transkripce z promotoru RNA polymerázy II • prodloužení transkripce z promotoru RNA polymerázy II • 7-methylguanosinová mRNA capping • RNA sestřih • genová exprese • virový proces • export mRNA z jádra v reakci na tepelný stres • nábor 3'-koncových procesních faktorů do holoenzymového komplexu RNA polymerázy II • pozitivní regulace iniciace translace • pozitivní regulace virové transkripce
Zdroje: Amigo / QuickGO

Profil exprese RNA

Více informací

ortology

Pohled

Člověk

Myš

Entrez

RefSeq (mRNA)

RefSeq (protein)

Locus (UCSC)

Chr 2:
128,6 – 128,62 Mb

Chr 18:
31,79 – 31,8 Mb

Hledejte v PubMed

[jeden]

[2]

Podjednotka RPB4 DNA-dependentní RNA polymerázy II je enzym kódovaný u lidí genem POLR2D [1] .

Tento gen kóduje čtvrtou největší podjednotku RNA polymerázy II , která je zodpovědná za syntézu RNA v eukaryotech . V kvasinkách se tato polymerázová podjednotka váže na polymerázu za suboptimálních růstových podmínek a může hrát roli v ochraně před stresem. 3' nepřeložená oblast tohoto genového transkriptu obsahuje sekvenci pro ribozomální pseudogen [2] .

Poznámky

↑ Khazak V., Estojak J., Cho H., Majors J., Sonoda G., Testa JR, Golemis EA Analýza interakce nové RNA polymerázy II (pol II) podjednotky hsRPB4 s jejím partnerem hsRPB7 as pol II (eng.) // Mol Cell Biol : deník. - 1998. - Květen ( roč. 18 , č. 4 ). - S. 1935-1945 . — PMID 9528765 .
↑ Entrez Gen: POLR2D polymeráza (RNA) II (DNA řízený) polypeptid D. (neurčitý)

Literatura

Zhang KT Tat, Tat-asociovaná kináza a transkripce. (anglicky) // J. Biomed. sci. : deník. - 1998. - Sv. 5 , č. 1 . - S. 24-7 . - doi : 10.1007/BF02253352 . — PMID 9570510 .
Yankulov K., Bentley D. Transkripční kontrola: Tat kofaktory a transkripční elongace. (anglicky) // Curr. Biol. : deník. - 1998. - Sv. 8 , č. 13 . - P.R447-9 . - doi : 10.1016/S0960-9822(98)70289-1 . — PMID 9651670 .
Romano G., Kasten M., De Falco G. a kol. Regulační funkce Cdk9 a cyklinu T1 v genové expresi transaktivační dráhy HIV tat. (anglicky) // J. Cell. Biochem. : deník. - 2000. - Sv. 75 , č. 3 . - str. 357-368 . - doi : 10.1002/(SICI)1097-4644(19991201)75:3<357::AID-JCB1>3.0.CO;2-K . — PMID 10536359 .
Marcello A., Zoppé M., Giacca M. Vícenásobné způsoby regulace transkripce transaktivátorem HIV-1 Tat. (anglicky) // IUBMB Life: journal. - 2002. - Sv. 51 , č. 3 . - S. 175-181 . - doi : 10.1080/152165401753544241 . — PMID 11547919 .
Stevens M., De Clercq E., Balzarini J. Regulace transkripce HIV-1: molekulární cíle pro chemoterapeutickou intervenci. (anglicky) // Med Res Rev : journal. - 2007. - Sv. 26 , č. 5 . - str. 595-625 . - doi : 10.1002/med.20081 . — PMID 16838299 .
Harrich D., McMillan N., Munoz L. a kol. Povedou různé interakce Tat k novým cílům antiretrovirových léků? (eng.) // Současné cíle v oblasti drog: časopis. - 2007. - Sv. 7 , č. 12 . - S. 1595-1606 . - doi : 10.2174/138945006779025338 . — PMID 17168834 .
Kato H., Sumimoto H., Pognonec P. a kol. HIV-1 Tat působí jako procesní faktor in vitro ve spojení s buněčnými elongačními faktory. (anglicky) // Genes Dev. : deník. - 1992. - Sv. 6 , č. 4 . - S. 655-666 . - doi : 10.1101/gad.6.4.655 . — PMID 1559613 .
Southgate C., Zapp ML, Green MR Aktivace transkripce proteinem HIV-1 Tat připoutaným k rodící se RNA prostřednictvím jiného proteinu. (anglicky) // Nature: journal. - 1990. - Sv. 345 , č.p. 6276 . - S. 640-642 . - doi : 10.1038/345640a0 . — PMID 2190099 .
Wu-Baer F., Sigman D., Gaynor RB Specifická vazba RNA polymerázy II na trans-aktivační oblast RNA viru lidské imunodeficience je regulována buněčnými kofaktory a Tat. (anglicky) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. - 1995. - Sv. 92 , č. 16 . - str. 7153-7157 . - doi : 10.1073/pnas.92.16.7153 . — PMID 7638159 .
Herrmann CH, Rice AP Lentivirus Tat proteiny se specificky spojují s buněčnou proteinkinázou, TAK, která hyperfosforyluje karboxy-terminální doménu velké podjednotky RNA polymerázy II: kandidát na kofaktor Tat. (anglicky) // J. Virol. : deník. - 1995. - Sv. 69 , č. 3 . - S. 1612-1620 . — PMID 7853496 .
Keen NJ, Gait MJ, Karn J. Virus lidské imunodeficience typu 1 Tat je nedílnou součástí aktivovaného transkripčně-prodlužovacího komplexu. (anglicky) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. - 1996. - Sv. 93 , č. 6 . - S. 2505-2510 . - doi : 10.1073/pnas.93.6.2505 . — PMID 8637904 .
Yang X., Herrmann CH, Rice AP Proteiny Tat viru lidské imunodeficience se specificky spojují s TAK in vivo a pro svou funkci vyžadují karboxy-terminální doménu RNA polymerázy II. (anglicky) // J. Virol. : deník. - 1996. - Sv. 70 , č. 7 . - S. 4576-4584 . — PMID 8676484 .
Agostini I., Navarro JM, Rey F. a kol. Transaktivátor viru lidské imunodeficience typu 1 Vpr: spolupráce s doménami aktivátoru vázanými na promotor a vazba na TFIIB. (anglicky) // J. Mol. Biol. : deník. - 1996. - Sv. 261 , č.p. 5 . - S. 599-606 . - doi : 10.1006/jmbi.1996.0485 . — PMID 8800208 .
Zhou Q., Sharp PA Tat-SF1: kofaktor pro stimulaci transkripčního prodloužení pomocí HIV-1 Tat. (anglicky) // Science: journal. - 1996. - Sv. 274 , č.p. 5287 . - S. 605-610 . - doi : 10.1126/science.274.5287.605 . — PMID 8849451 .
Okamoto H., Sheline CT, Corden JL a kol. Transaktivace Tat proteinem viru lidské imunodeficience vyžaduje C-terminální doménu RNA polymerázy II. (anglicky) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. - 1996. - Sv. 93 , č. 21 . - S. 11575-11579 . - doi : 10.1073/pnas.93.21.11575 . — PMID 8876177 .
Chun RF, Zhang KT Požadavky na karboxyterminální doménu RNA polymerázy II pro aktivovanou transkripci lidských retrovirů lidský T-buněčný lymfotropní virus I a HIV-1. (anglicky) // J. Biol. Chem. : deník. - 1996. - Sv. 271 , č.p. 44 . - S. 27888-27894 . doi : 10.1074 / jbc.271.44.27888 . — PMID 8910388 .
Parada CA, Roeder RG Zvýšená procesivita RNA polymerázy II spouštěná Tat-indukovanou fosforylací její karboxy-terminální domény. (anglicky) // Nature: journal. - 1996. - Sv. 384 , č.p. 6607 . - str. 375-378 . - doi : 10.1038/384375a0 . — PMID 8934526 .
García-Martínez LF, Ivanov D., Gaynor RB Association of Tat s purifikovanými komplexy preiniciace transkripce HIV-1 a HIV-2. (anglicky) // J. Biol. Chem. : deník. - 1997. - Sv. 272 , č.p. 11 . - S. 6951-6958 . doi : 10.1074 / jbc.272.11.6951 . — PMID 9054383 .
Cujec TP, Cho H., Maldonado E., et al. Transaktivátor viru lidské imunodeficience Tat interaguje s holoenzymem RNA polymerázy II. (anglicky) // Mol. buňka. Biol. : deník. - 1997. - Sv. 17 , č. 4 . - S. 1817-1823 . — PMID 9121429 .
García-Martinez LF, Mavankal G., Neveu JM, et al. Purifikace kinázy asociované s Tat odhaluje komplex TFIIH, který moduluje transkripci HIV-1. (anglicky) // EMBO J. : deník. - 1997. - Sv. 16 , č. 10 . - S. 2836-2850 . - doi : 10.1093/emboj/16.10.2836 . — PMID 9184228 .