Phylo

Phylo
Vývojáři McGillovo centrum pro bioinformatiku, McGill University
Datum vydání listopadu 2010
Žánr simulátor
Technické údaje
motor Adobe Flash
Herní mód Hra pro jednoho hráče
Jazyk rozhraní Angličtina, francouzština, ruština, španělština, němčina, čínština, korejština, hebrejština, rumunština, portugalština
Oficiální stránka

Phylo ( Phylo: A Human Computing Framework for Comparative Genomics [1] ) je experimentální počítačová hra o optimalizaci zarovnání více sekvencí [2] . Původně byl vyvinut v Centru pro bioinformatiku na McGill University a představen ve Flashi 29. listopadu [3] 2010. Hráči musí vyřešit hádanky , které představují nukleotidové sekvence různých taxonů. Porovnáním nukleotidových sekvencí reprezentovaných jako vícebarevné bloky se hráči snaží získat nejvyšší skóre pro každou sadu sekvencí tím, že sladí co nejvíce barev a minimalizují nedokonalosti.

Přijatá data zpracovává Bioinformatické centrum univerzity; v případě, že je hráčova strategie úspěšnější než stávající počítačové algoritmy, používá se ke zlepšení automatických nástrojů pro optimalizaci vícenásobného zarovnání sekvencí. Obecně lze získané informace využít k hledání řešení problémů různých onemocnění, např. rakoviny [4] .

Poznámky

  1. Matt Hickey. Phylo, hra, která pomáhá mapovat genetický kód  ( 30. listopadu 2010). Získáno 26. února 2013. Archivováno z originálu 23. března 2013.
  2. Kawrykow A. , Roumanis G. , Kam A. , Kwak D. , Leung C. , Wu C. , Zarour E. , Sarmenta L. , Blanchette M. , Waldispühl J. Phylo : občanský vědecký přístup pro zlepšení vícenásobné sekvence zarovnání.  (anglicky)  // Public Library of Science ONE. - 2012. - Sv. 7, č. 3 . - P. e31362. - doi : 10.1371/journal.pone.0031362 . — PMID 22412834 .
  3. Lisa Grossmanová. Počítačová hra z vás udělá genetického  vědce . The Wired (11. října 2030). Získáno 26. února 2013. Archivováno z originálu 23. března 2013.
  4. Marcella McCarthyová. Vědci outsourcují svou práci prostřednictvím počítačové hry  ( 8. prosince 2010). Získáno 26. února 2013. Archivováno z originálu 23. března 2013.