RFC1

Replikační faktor C (aktivátor 1) 1, 145 kDa

Zavedeno na základě PNR 2EBU .

Dostupné struktury

Ortologické vyhledávání: PDBe , RCSB

Seznam PDB ID
2EBU , 2K6G , 2K7F

Identifikátory

Symbol

RFC1 ; AI; MHCBFB; POGA; RECC1; RFC; RFC140

Externí ID

OMIM: 102579 MGI : 97891 HomoloGene : 2187 GeneCards : RFC1 Gene

Genová ontologie
Funkce	• Vazba na DNA • Aktivita zavaděče DNA svorky • vazba dvouřetězcové DNA • vazba na protein • vazba ATP • aktivita aktivátoru enzymu • vazba specifická pro proteinovou doménu • sekvenčně specifická vazba DNA
buněčná složka	• jádro • nukleoplazma • komplex DNA replikačního faktoru C • jadérko • Golgiho aparát • buněčné spojení • extracelulární vezikulární exozom
biologický proces	• negativní regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II • mitotický buněčný cyklus • udržování telomer prostřednictvím rekombinace • udržování telomer • katabolický proces ATP • replikace DNA závislá na DNA • prodlužování řetězce DNA zapojené do replikace DNA • oprava DNA • oprava nukleotidovou excizí spojenou s transkripcí • oprava nukleotidovou excizí • nukleotidová excize oprava, vyplňování mezer v DNA • transkripce, templátovaná DNA • udržování telomer pomocí telomerázy • udržování telomer pomocí semikonzervativní replikace • pozitivní regulace katalytické aktivity • pozitivní regulace transkripce, templátem DNA
Zdroje: Amigo / QuickGO

Profil exprese RNA

Více informací

ortology

Pohled

Člověk

Myš

Entrez

RefSeq (mRNA)

RefSeq (protein)

Locus (UCSC)

Chr 4:
39,29 – 39,37 Mb

Chr 5:
65,26 – 65,34 Mb

Hledejte v PubMed

[jeden]

[2]

Replikační faktor C podjednotka 1 je protein kódovaný u lidí genem RFC1 . [1] [2]

Funkce

Protein kódovaný tímto genem je velká podjednotka replikačního faktoru C, který je podjednotkou pěti doplňkových proteinů DNA polymerázy . Replikační faktor C je DNA-dependentní ATPáza , která je nezbytná pro eukaryotickou replikaci a opravu DNA . Protein působí jako aktivátor DNA polymeráz, váže se na 3' konce primerů a také podporuje koordinovanou syntézu obou řetězců. Může také hrát roli ve stabilitě telomer . [2]

Interakce

Bylo zjištěno, že RFC1 interaguje s:

BRD4 , [3]
HDAC1 , [4]
PCNA , [3] [5] [6] [7] [8]
RELA [9] a
RFC3 . [10] [11] [12]

Poznámky

↑ Luckow B., Bunz F., Stillman B., Lichter P., Schütz G. Klonování, exprese a chromozomální lokalizace 140kilodaltonové podjednotky replikačního faktoru C z myší a lidí // Molekulární a buněčná biologie : deník. - 1994. - březen ( roč. 14 , č. 3 ). - S. 1626-1634 . — PMID 8114700 .
↑ 1 2 Entrez Gen: RFC1 replikační faktor C (aktivátor 1) 1, 145 kDa . (neurčitý)
↑ 1 2 Maruyama T., Farina A., Dey A., Cheong J., Bermudez VP, Tamura T., Sciortino S., Shuman J., Hurwitz J., Ozato K. Savčí bromodoménový protein, brd4, interaguje s replikační faktor C a inhibuje progresi do S fáze // Molekulární a buněčná biologie : deník. - 2002. - září ( roč. 22 , č. 18 ). - S. 6509-6520 . - doi : 10.1128/mcb.22.18.6509-6520.2002 . — PMID 12192049 .
↑ Anderson LA, Perkins ND Velká podjednotka replikačního faktoru C interaguje s histondeacetylázou, HDAC1 // Journal of Biological Chemistry : journal. - 2002. - srpen ( roč. 277 , č. 33 ). - S. 29550-29554 . - doi : 10.1074/jbc.M200513200 . — PMID 12045192 .
↑ Fotedar R., Mossi R., Fitzgerald P., Rousselle T., Maga G., Brickner H., Messier H., Kasibhatla S., Hübscher U., Fotedar A. Konzervovaná doména velké podjednotky faktoru replikace C váže PCNA a působí jako dominantní negativní inhibitor replikace DNA v savčích buňkách // The EMBO Journal : deník. - 1996. - Srpen ( roč. 15 , č. 16 ). - str. 4423-4433 . — PMID 8861969 .
↑ Mossi R., Jónsson ZO, Allen BL, Hardin SH, Hübscher U. Replikační faktor C interaguje s C-terminální stranou jaderného antigenu proliferující buňky // Journal of Biological Chemistry : journal. - 1997. - Leden ( roč. 272 , č. 3 ). - S. 1769-1776 . doi : 10.1074 / jbc.272.3.1769 . — PMID 8999859 .
↑ van der Kuip H., Carius B., Haque SJ, Williams BR, Huber C., Fischer T. DNA-vazebná podjednotka p140 replikačního faktoru C je upregulována v cyklujících buňkách a asociuje se s regulačními proteiny buněčného cyklu fáze G1.) // Journal of Molecular Medicine : deník. - 1999. - Duben ( roč. 77 , č. 4 ). - str. 386-392 . - doi : 10.1007/s001090050365 . — PMID 10353443 .
↑ Ohta S., Shiomi Y., Sugimoto K., Obuse C., Tsurimoto T. Proteomický přístup k identifikaci proteinů vážících nukleární antigen proliferujících buněk (PCNA) v lyzátech lidských buněk. Identifikace lidského komplexu CHL12/RFCs2-5 jako nového proteinu vázajícího PCNA (anglicky) // Journal of Biological Chemistry : journal. - 2002. - říjen ( roč. 277 , č. 43 ). - S. 40362-40367 . - doi : 10.1074/jbc.M206194200 . — PMID 12171929 .
↑ Anderson LA, Perkins ND Regulace funkce RelA (p65) velkou podjednotkou replikačního faktoru C // Molekulární a buněčná biologie : deník. - 2003. - Leden ( roč. 23 , č. 2 ). - str. 721-732 . - doi : 10.1128/mcb.23.2.721-732.2003 . — PMID 12509469 .
↑ Ellison V., Stillman B. Rekonstituce rekombinantního lidského replikačního faktoru C (RFC) a identifikace RFC subkomplexu s DNA-dependentní aktivitou ATPázy // Journal of Biological Chemistry : journal. - 1998. - březen ( roč. 273 , č. 10 ). - S. 5979-5987 . doi : 10.1074/ jbc.273.10.5979 . — PMID 9488738 .
↑ Uhlmann F., Cai J., Flores-Rozas H., Dean FB, Finkelstein J., O'Donnell M., Hurwitz J. In vitro rekonstituce lidského replikačního faktoru C z jeho pěti podjednotek // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. - 1996. - Červen ( roč. 93 , č. 13 ). - str. 6521-6526 . - doi : 10.1073/pnas.93.13.6521 . — PMID 8692848 .
↑ Tomida J., Masuda Y., Hiroaki H., Ishikawa T., Song I., Tsurimoto T., Tateishi S., Shiomi T., Kamei Y., Kim J., Kamiya K., Vaziri C., Ohmori H., Todo T. Ubiquitylation of RFC2 subunit of Replication factor C complex (anglicky) // Journal of Biological Chemistry : journal. - 2008. - Duben ( roč. 283 , č. 14 ). - S. 9071-9079 . - doi : 10.1074/jbc.M709835200 . — PMID 18245774 .

Literatura

Lu Y., Riegel AT Lidský protein vázající DNA, PO-GA, je homologní s velkou podjednotkou myšího replikačního faktoru C: regulace alternativním 3' zpracováním mRNA // Gen : deník. - Elsevier , 1994. - Sv. 145 , č.p. 2 . - str. 261-265 . - doi : 10.1016/0378-1119(94)90017-5 . — PMID 7914507 .
Bunz F., Kobayashi R., Stillman B. cDNA kódující velkou podjednotku lidského replikačního faktoru C (anglicky) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. - 1994. - Sv. 90 , č. 23 . - S. 11014-11018 . - doi : 10.1073/pnas.90.23.11014 . — PMID 8248204 .
Lu Y., Zeft AS, Riegel AT Klonování a exprese nového lidského proteinu vázajícího DNA, PO-GA // Biochemical and Biophysical Research Communications : deník. - 1993. - Sv. 193 , č. 2 . - str. 779-786 . - doi : 10.1006/bbrc.1993.1693 . — PMID 8512577 .
Uhlmann F., Cai J., Flores-Rozas H., Dean FB, Finkelstein J., O'Donnell M., Hurwitz J. In vitro rekonstituce lidského replikačního faktoru C z jeho pěti podjednotek // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. - 1996. - Sv. 93 , č. 13 . - str. 6521-6526 . - doi : 10.1073/pnas.93.13.6521 . — PMID 8692848 .
Fotedar R., Mossi R., Fitzgerald P., Rousselle T., Maga G., Brickner H., Messier H., Kasibhatla S., Hübscher U., Fotedar A. Konzervovaná doména velké podjednotky replikačního faktoru C váže PCNA a působí jako dominantní negativní inhibitor replikace DNA v savčích buňkách // The EMBO Journal : deník. - 1996. - Sv. 15 , č. 16 . - str. 4423-4433 . — PMID 8861969 .
Uchiumi F., Ohta T., Tanuma S. Replikační faktor C rozpoznává 5'-fosfátové konce telomer // Biochemical and Biophysical Research Communications : deník. - 1997. - Sv. 229 , č.p. 1 . - str. 310-315 . - doi : 10.1006/bbrc.1996.1798 . — PMID 8954124 .
Mossi R., Jónsson ZO, Allen BL, Hardin SH, Hübscher U. Replikační faktor C interaguje s C-terminální stranou jaderného antigenu proliferující buňky (anglicky) // Journal of Biological Chemistry : journal. - 1997. - Sv. 272 , č.p. 3 . - S. 1769-1776 . doi : 10.1074 / jbc.272.3.1769 . — PMID 8999859 .
Cujec TP, Cho H., Maldonado E., Meyer J., Reinberg D., Peterlin BM Transaktivátor viru lidské imunodeficience Tat interaguje s holoenzymem RNA polymerázy II // Molekulární a buněčná biologie : deník. - 1997. - Sv. 17 , č. 4 . - S. 1817-1823 . — PMID 9121429 .
Ubeda M., Habener JF Velká podjednotka DNA replikačního komplexu C (DSEB/RF-C140) štěpená a inaktivovaná kaspázou-3 (CPP32/YAMA) během Fas-indukované apoptózy (anglicky) // Journal of Biological Chemistry : journal . - 1997. - Sv. 272 , č.p. 31 . - S. 19562-19568 . - doi : 10.1074/jbc.272.31.19562 . — PMID 9235961 .
Rhéaume E., Cohen LY, Uhlmann F., Lazure C., Alam A., Hurwitz J., Sékaly RP, Denis F. Velká podjednotka replikačního faktoru C je substrátem pro kaspázu-3 in vitro a je štěpena proteáza podobná kaspáze-3 během apoptózy zprostředkované Fas // The EMBO Journal : deník. - 1998. - Sv. 16 , č. 21 . - S. 6346-6354 . - doi : 10.1093/emboj/16.21.6346 . — PMID 9351817 .
Ellison V., Stillman B. Rekonstituce rekombinantního lidského replikačního faktoru C (RFC) a identifikace RFC subkomplexu s DNA-dependentní aktivitou ATPázy // Journal of Biological Chemistry : journal. - 1998. - Sv. 273 , č.p. 10 . - S. 5979-5987 . doi : 10.1074/ jbc.273.10.5979 . — PMID 9488738 .
Coll JM, Hickey RJ, Cronkey EA, Jiang HY, Schnaper L., Lee MY, Uitto L., Syvaoja JE, Malkas LH Mapování //specifických interakcí protein-protein v hlavní složce syntezomu DNA prsní buňky Res. : deník. - 1998. - Sv. 9 , č. 11-12 . - str. 629-639 . — PMID 9563011 .
Allen BL, Uhlmann F., Gaur LK, Mulder BA, Posey KL, Jones LB, Hardin SH Vlastnosti rozpoznávání DNA N-terminální DNA vazebné domény v rámci velké podjednotky replikačního faktoru C // Výzkum nukleových kyselin : deník. - 1998. - Sv. 26 , č. 17 . - str. 3877-3882 . doi : 10.1093 / nar/26.17.3877 . — PMID 9705493 .
van der Kuip H., Carius B., Haque SJ, Williams BR, Huber C., Fischer T. Podjednotka vázající DNA p140 replikačního faktoru C je upregulována v cyklujících buňkách a asociuje se s regulačními proteiny buněčného cyklu fáze G1 (angl. ) // Journal of Molecular Medicine : deník. - 1999. - Sv. 77 , č. 4 . - str. 386-392 . - doi : 10.1007/s001090050365 . — PMID 10353443 .
Wang Y., Cortez D., Yazdi P., Neff N., Elledge SJ, Qin J. BASC, superkomplex proteinů asociovaných s BRCA1 zapojených do rozpoznávání a opravy aberantních struktur DNA (anglicky) // Genes & Development : deník. - 2000. - Sv. 14 , č. 8 . - S. 927-939 . — PMID 10783165 .
Yazdi PT, Wang Y., Zhao S., Patel N., Lee EY, Qin J. SMC1 je downstream efektor ve větvi ATM / NBS1 kontrolního bodu lidské S-fáze // Genes & Development : journal . - 2002. - Sv. 16 , č. 5 . - str. 571-582 . - doi : 10.1101/gad.970702 . — PMID 11877377 .
Anderson LA, Perkins ND Velká podjednotka replikačního faktoru C interaguje s histondeacetylázou, HDAC1 // Journal of Biological Chemistry : journal. - 2002. - Sv. 277 , č.p. 33 . - S. 29550-29554 . - doi : 10.1074/jbc.M200513200 . — PMID 12045192 .
Ohta S., Shiomi Y., Sugimoto K., Obuse C., Tsurimoto T. Proteomický přístup k identifikaci proteinů vážících nukleární antigen proliferujících buněk (PCNA) v lyzátech lidských buněk. Identifikace lidského komplexu CHL12/RFCs2-5 jako nového proteinu vázajícího PCNA (anglicky) // Journal of Biological Chemistry : journal. - 2002. - Sv. 277 , č.p. 43 . - S. 40362-40367 . - doi : 10.1074/jbc.M206194200 . — PMID 12171929 .
Maruyama T., Farina A., Dey A., Cheong J., Bermudez VP, Tamura T., Sciortino S., Shuman J., Hurwitz J., Ozato K. Savčí bromodoménový protein, Brd4, interaguje s replikačním faktorem C a inhibuje progresi do S fáze // Molekulární a buněčná biologie : deník. - 2002. - Sv. 22 , č. 18 . - S. 6509-6520 . - doi : 10.1128/MCB.22.18.6509-6520.2002 . — PMID 12192049 .