SPEN

Rodina transkripčních represorů Spen

PNR je založen na 1%1.

Dostupné struktury

Ortologické vyhledávání: PDBe , RCSB

Seznam PDB ID
1OW1 , 2RT5 , 4P6Q

Identifikátory

Symbol

SPEN ; HIAA0929; MÁTA; RBM15C; OSTRÝ

Externí ID

OMIM: 613484 MGI : 1891706 HomoloGene : 124461 GeneCards : SPEN Gene

Genová ontologie
Funkce	• nukleotidová vazba • vazba transkripčního faktoru RNA polymerázy II • vazba transkripčního faktoru RNA polymerázy II aktivita transkripčního faktoru podílející se na negativní regulaci transkripce • vazba jednovláknové DNA • sekvenčně specifická aktivita transkripčního faktoru vazby DNA • aktivita korepresoru transkripce • vazba na protein • vazba poly(A) RNA
buněčná složka	• jádro • jadérko • transkripční represorový komplex • extracelulární vezikulární exozom
biologický proces	• negativní regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II • transkripce, DNA-templát • Notch signální dráha • virový proces • negativní regulace transkripce, DNA-templát • pozitivní regulace transkripce, DNA-templát • pozitivní regulace neurogeneze
Zdroje: Amigo / QuickGO

Profil exprese RNA

Více informací

ortology

Pohled

Člověk

Myš

Entrez

RefSeq (mRNA)

RefSeq (protein)

Locus (UCSC)

Chr 1:
16,17 – 16,27 Mb

Chr 4:
141,47 – 141,54 Mb

Hledejte v PubMed

[jeden]

[2]

Interaktivní protein Msx2 je protein kódovaný u lidí genem SPEN . [1] [2] [3]

Tento gen kóduje hormon, který je indukován transkripčním represorem. Transkripční represe tohoto genového produktu může nastat prostřednictvím interakce s jinými represory, prostřednictvím náboru proteinů účastnících se deacetylace histonů nebo prostřednictvím příjmu transkripčních aktivátorů. Produkt tohoto genu obsahuje karboxy-terminální doménu , která umožňuje vazbu na jiné korepresorové proteiny . Tato doména také umožňuje interakci se členy komplexu NuRD, komplexu remodelace nukleozomálních proteinů, který obsahuje aktivní deacetylázy . Navíc tento represor obsahuje několik motivů rozpoznávání RNA , které umožňují vazbu na steroidní receptor pro koaktivátor RNA ; tato vazba může modulovat aktivitu ligandových i neligandových steroidních receptorů. [3]

Interakce

Bylo prokázáno, že SPEN interaguje s HDAC1 , [4] SRA1 [2] a korepresorem jaderného receptoru 2 . [2]

Poznámky

↑ Newberry EP, Latifi T., Towler DA RRM doména MINT, nového proteinu vázajícího Msx2, rozpoznává a reguluje potkaní promotor osteokalcinu // Biochemistry: journal. - 1999. - září ( roč. 38 , č. 33 ). - S. 10678-10690 . - doi : 10.1021/bi990967j . — PMID 10451362 .
↑ 1 2 3 Shi Y., Downes M., Xie W., Kao HY, Ordentlich P., Tsai CC, Hon M., Evans RM Sharp, indukovatelný kofaktor, který integruje represi a aktivaci jaderného receptoru // Genes Dev : journal . - 2001. - Květen ( roč. 15 , č. 9 ). - S. 1140-1151 . - doi : 10.1101/gad.871201 . — PMID 11331609 .
↑ 1 2 Entrez Gen: SPEN spen homolog, transkripční regulátor (Drosophila) . Archivováno z originálu 5. prosince 2010. (neurčitý)
↑ Shi, Y; Downes M., Xie W., Kao H Y., Ordentlich P., Tsai C C., Hon M., Evans R M. Sharp, indukovatelný kofaktor, který integruje represi a aktivaci jaderného receptoru (anglicky) // Genes Dev. : deník. — Spojené státy americké, 2001 . — Květen ( roč. 15 , č. 9 ). - S. 1140-1151 . — ISSN 0890-9369 . - doi : 10.1101/gad.871201 . — PMID 11331609 .

Literatura

Ternovskaia LN, Prokhorova LG, Moroz VM [Antagonistické vzájemné vztahy mezi stafylokoky a Sarcinou izolovanými z horních cest dýchacích prakticky zdravých osob] (anglicky) // Antibiotiki : journal. - 1977. - Sv. 21 , č. 12 . - S. 1072-1075 . — PMID 1020939 .
Nagase T., Ishikawa K., Suyama M. a kol. Predikce kódujících sekvencí neidentifikovaných lidských genů. XIII. Kompletní sekvence 100 nových cDNA klonů z mozku, které kódují velké proteiny in vitro. (anglicky) // DNA Res. : deník. - 1999. - Sv. 6 , č. 1 . - str. 63-70 . - doi : 10.1093/dnares/6.1.63 . — PMID 10231032 .
Shi Y., Hon M., Evans RM Receptor delta aktivovaný peroxisomovým proliferátorem, integrátor transkripční represe a signalizace nukleárních receptorů. (anglicky) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. - 2002. - Sv. 99 , č. 5 . - S. 2613-2618 . - doi : 10.1073/pnas.052707099 . — PMID 11867749 .
Oswald F., Kostezka U., Astrahantseff K., et al. SHARP je nová součást signální dráhy Notch/RBP-Jkappa. (anglicky) // EMBO J. : deník. - 2002. - Sv. 21 , č. 20 . - str. 5417-5426 . - doi : 10.1093/emboj/cdf549 . — PMID 12374742 .
Ariyoshi M., Schwabe JW Konzervovaný strukturní motiv odhaluje zásadní transkripční represivní funkci Spenových proteinů a jejich roli ve vývojové signalizaci. (anglicky) // Genes Dev. : deník. - 2003. - Sv. 17 , č. 15 . - S. 1909-1920 . - doi : 10.1101/gad.266203 . — PMID 12897056 .
Ota T., Suzuki Y., Nishikawa T. a kol. Kompletní sekvenování a charakterizace 21 243 lidských cDNA plné délky. (anglicky) // Nat. Genet. : deník. - 2004. - Sv. 36 , č. 1 . - str. 40-5 . - doi : 10.1038/ng1285 . — PMID 14702039 .
Dotzlaw H., Papaioannou M., Moehren U., et al. Souhra koaktivátoru a korepresoru indukovaná agonistou-antagonistou na lidském androgenním receptoru. (anglicky) // Mol. buňka. Endocrinol. : deník. - 2004. - Sv. 213 , č.p. 1 . - str. 79-85 . - doi : 10.1016/j.mce.2003.10.036 . — PMID 15062576 .
Beausoleil SA, Jedrychowski M., Schwartz D. a kol. Rozsáhlá charakterizace jaderných fosfoproteinů buněk HeLa. (anglicky) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. - 2004. - Sv. 101 , č. 33 . - S. 12130-12135 . - doi : 10.1073/pnas.0404720101 . — PMID 15302935 .
Vadlamudi RK, Manavathi B., Singh RR, a kol. Podstatná role Pak1 fosforylace SHARP v Notch signalizaci. (anglicky) // Oncogene : deník. - 2005. - Sv. 24 , č. 28 . - S. 4591-4596 . - doi : 10.1038/sj.onc.1208672 . — PMID 15824732 .
Li J., Wang J., Yang X. a kol. Spen homolog Msx2-interagující jaderný cílový protein interaguje s E2 ubikvitin-konjugujícím enzymem UbcH8. (anglicky) // Mol. buňka. Biochem. : deník. - 2007. - Sv. 288 , č.p. 1-2 . - S. 151-157 . - doi : 10.1007/s11010-006-9131-9 . — PMID 16583136 .
Gregory SG, Barlow KF, McLay KE a kol. Sekvence DNA a biologická anotace lidského chromozomu 1. (anglicky) // Nature : journal. - 2006. - Sv. 441 , č.p. 7091 . - str. 315-321 . - doi : 10.1038/nature04727 . — PMID 16710414 .
Lim J., Hao T., Shaw C. a kol. Interakční síť protein-protein pro lidské dědičné ataxie a poruchy degenerace Purkyňových buněk. (anglicky) // Cell : journal. - Cell Press , 2006. - Vol. 125 , č. 4 . - S. 801-814 . - doi : 10.1016/j.cell.2006.03.032 . — PMID 16713569 .
Beausoleil SA, Villén J., Gerber SA, a kol. Přístup založený na pravděpodobnosti pro vysoce výkonnou analýzu fosforylace proteinů a lokalizaci místa. (anglicky) // Nat. Biotechnol. : deník. - 2006. - Sv. 24 , č. 10 . - S. 1285-1292 . - doi : 10.1038/nbt1240 . — PMID 16964243 .
Olsen JV, Blagoev B., Gnad F., et al. Globální, in vivo a místně specifická dynamika fosforylace v signálních sítích. (anglicky) // Cell : journal. - Cell Press , 2006. - Vol. 127 , č. 3 . - str. 635-648 . - doi : 10.1016/j.cell.2006.09.026 . — PMID 17081983 .
Feng Y., Bommer GT, Zhai Y. a kol. Homolog SHARP Drosophila funguje jako pozitivní regulátor signalizace Wnt/beta-catenin/T-buněčný faktor při neoplastické transformaci. (anglicky) // Cancer Res. : deník. - 2007. - Sv. 67 , č. 2 . - S. 482-491 . - doi : 10.1158/0008-5472.CAN-06-2314 . — PMID 17234755 .