SPI1

Spi1 proto-onkogen

PNR ve spojení s 1 pue.

Dostupné struktury

Ortologické vyhledávání: PDBe , RCSB

Seznam PDB ID
1 pue

Identifikátory

Symbol

SPI1 ; Z; PU.1; SFPI1; SPI-1; SPI-A

Externí ID

OMIM: 165170 MGI : 98282 HomoloGene : 2346 GeneCards : SPI1 Gene

Genová ontologie
Funkce	• RNA polymeráza II distální enhancer sekvenčně specifická vazba DNA • sekvenčně specifická DNA vazebná aktivita transkripčního faktoru RNA polymerázy II • vazba jádrového promotoru • vazba transkripčního faktoru RNA polymerázy II • distální zesilovač RNA polymerázy II aktivita transkripčního faktoru pro vazbu DNA specifická pro sekvenci zapojená do pozitivní regulace transkripce • sekvenčně specifická DNA vazebná transkripce aktivita faktoru • RNA polymeráza II distální zesilovač sekvence specifický pro vazbu DNA aktivita transkripčního faktoru • vazba RNA • vazba na protein • Vazba na proteiny NFAT
buněčná složka	• jaderný chromatin
biologický proces	• negativní regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II • diferenciace lymfoidních progenitorových buněk • regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II • transkripce z promotoru RNA polymerázy II • diferenciace lymfocytů • diferenciace erytrocytů • diferenciace makrofágů • diferenciace granulocytů • udržování somatických kmenových buněk • diferenciace myeloidních dendritických buněk • acetylace histonu H3 • hypermethylace Ostrov CpG • negativní regulace biosyntetického procesu MHC II. třídy • regulace diferenciace erytrocytů • negativní regulace genové exprese, epigenetická • negativní regulace transkripce, templátem DNA • pozitivní regulace transkripce, templátem DNA • pozitivní regulace transkripce z RNA polymerázy II promotor • regrese anatomické struktury • negativní regulace acetylace histonu H4 • apoptotický proces zapojený do vzorování krevních cév
Zdroje: Amigo / QuickGO

Profil exprese RNA

Více informací

ortology

Pohled

Člověk

Myš

Entrez

RefSeq (mRNA)

RefSeq (protein)

Locus (UCSC)

Chr 11:
47,38 – 47,4 Mb

Chr 2:
91,08 – 91,12 Mb

Hledejte v PubMed

[jeden]

[2]

Transkripční faktor PU.1 je protein , který je u lidí kódován genem SPI1 [ 1] .

Funkce

Tento gen kóduje transkripční faktor domény ETS, který aktivuje genovou expresi během vývoje myeloidních a B-lymfoidních buněk. Protein lokalizovaný v jádře se váže na sekvence bohaté na puriny známé jako PU boxy, sídlí v blízkosti promotorů cílových genů a reguluje jejich expresi ve shodě s dalšími transkripčními faktory a kofaktory . Protein může také regulovat alternativní sestřih cílových genů. Existuje několik variant transkriptů kódujících různé izoformy tohoto genu [2] .

Předpokládá se, že mnohonásobné zvýšení syntézy Pu.1 v některých buňkách podkožního tuku během stárnutí přispívá k inhibici adipogeneze a ztenčování podkožní tukové tkáně u starších osob. [3]

Interakce

Ukázalo se, že SPI1 interaguje s:

FUS , [4]
GATA2 , [5]
IRF4 , [6] [7]
NENO . [osm]

Poznámky

↑ Ray D., Culine S., Tavitain A., Moreau-Gachelin F. Lidský homolog domnělého protoonkogenu Spi-1: charakterizace a exprese v nádorech // Onkogen : deník. - 1990. - Červenec ( ročník 5 , č. 5 ). - str. 663-668 . — PMID 1693183 .
↑ Entrez Gen: SPI1 slezinný fokus formující virus (SFFV) provirální integrace onkogenu spi1 . (neurčitý)
↑ Hai P. Nguyen, Frances Lin, Danielle Yi, Ying Xie, Jennie Dinh, Pengya Xue, Hei Sook Sul, (2021). Regulační buňky závislé na stárnutí se objevují v podkožním tuku, aby inhibovaly adipogenezi . Vývojová buňka doi : 10.1016/j.devcel.2021.03.026
↑ Hallier M., Lerga A., Barnache S., Tavitian A., Moreau-Gachelin F. Transkripční faktor Spi-1/PU.1 interaguje s potenciálním sestřihovým faktorem TLS // Journal of Biological Chemistry : journal. - 1998. - únor ( roč. 273 , č. 9 ). - S. 4838-4842 . — PMID 9478924 .
↑ Zhang P., Behre G., Pan J., Iwama A., Wara-Aswapati N., Radomska HS, Auron PE, Tenen DG, Sun Z. Negativní cross-talk between hematopoeetic regulators: GATA proteins repress PU.1 ( English) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. - 1999. - Červenec ( roč. 96 , č. 15 ). - S. 8705-8710 . — PMID 10411939 .
↑ Brass AL, Zhu AQ, Singh H. Požadavky na sestavení komplexů aktivátoru PU.1-Pip (IRF-4): inhibiční funkce in vivo pomocí fúzovaných dimerů // The EMBO Journal : deník. - 1999. - únor ( roč. 18 , č. 4 ). - str. 977-991 . doi : 10.1093 / emboj/18.4.977 . — PMID 10022840 .
↑ Escalante ČR, Shen L., Escalante MC, Brass AL, Edwards TA, Singh H., Aggarwal AK Krystalizace a charakterizace ternárního komplexu PU.1/IRF-4/DNA // Journal of Structural Biology : deník. - 2002. - Červenec ( roč. 139 , č. 1 ). - S. 55-9 . — PMID 12372320 .
↑ Hallier M., Tavitian A., Moreau-Gachelin F. Transkripční faktor Spi-1/PU.1 váže RNA a interferuje s proteinem vázajícím RNA p54nrb // Journal of Biological Chemistry : journal. - 1996. - Květen ( roč. 271 , č. 19 ). - S. 11177-11181 . — PMID 8626664 .

Literatura

Klemsz MJ, McKercher SR, Celada A., Van Beveren C., Maki RA Makrofág a B buněčný specifický transkripční faktor PU.1 souvisí s ets onkogenem. (anglicky) // Cell : journal. - Cell Press , 1990. - Sv. 61 , č. 1 . - str. 113-124 . - doi : 10.1016/0092-8674(90)90219-5 . — PMID 2180582 .
Nguyen VC, Ray D., Gross MS, de Tand MF, Frézal J., Moreau-Gachelin F. Lokalizace lidského onkogenu SPI1 na chromozomu 11, oblast p11.22. (anglicky) // Human Genetics : journal. - 1990. - Sv. 84 , č. 6 . - str. 542-546 . - doi : 10.1007/bf00210807 . — PMID 2338340 .
Chen H., Ray-Gallet D., Zhang P., Hetherington CJ, Gonzalez DA, Zhang DE, Moreau-Gachelin F., Tenen DG PU.1 (Spi-1) autoreguluje svou expresi v myeloidních buňkách. (anglicky) // Oncogene. - 1995. - Sv. 11 , č. 8 . - S. 1549-1560 . — PMID 7478579 .
Nagulapalli S., Pongubala JM, Atchison ML Více proteinů fyzicky interaguje s PU.1. Transkripční synergie s NF-IL6 beta (C/EBP delta, CRP3). (anglicky) // Journal of Immunology : deník. - 1995. - Sv. 155 , č.p. 9 . - str. 4330-4338 . — PMID 7594592 .
Pongubala JM, Atchison ML Aktivace transkripčního faktoru 1 a modulátor cyklického prvku odpovědi AMP mohou modulovat aktivitu zesilovače kappa 3' imunoglobulinu. (anglicky) // Journal of Biological Chemistry : journal. - 1995. - Sv. 270 , č.p. 17 . - S. 10304-10313 . doi : 10.1074/ jbc.270.17.10304 . — PMID 7730336 .
Hromas R., Orazi A., Neiman RS, Maki R., Van Beveran C., Moore J., Klemsz M. Hematopoetická linie a stádium omezená exprese člena onkogenové rodiny ETS PU.1. (anglicky) // Krev : deník. — Americká hematologická společnost, 1993. - Sv. 82 , č. 10 . - S. 2998-3004 . — PMID 8219191 .
Hagemeier C., Bannister AJ, Cook A., Kouzarides T. Aktivační doména transkripčního faktoru PU.1 váže in vitro protein retinoblastomu (RB) a transkripční faktor TFIID: RB vykazuje sekvenční podobnost s TFIID a TFIIB. (anglicky) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. - 1993. - Sv. 90 , č. 4 . - S. 1580-1584 . - doi : 10.1073/pnas.90.4.1580 . — PMID 8434021 .
Hallier M., Tavitian A., Moreau-Gachelin F. Transkripční faktor Spi-1/PU.1 váže RNA a interferuje s RNA-vazebným proteinem p54nrb. (anglicky) // Journal of Biological Chemistry : journal. - 1996. - Sv. 271 , č.p. 19 . - S. 11177-11181 . doi : 10.1074 / jbc.271.19.11177 . — PMID 8626664 .
Bassuk AG, Anandappa RT, Leiden JM Fyzikální interakce mezi Ets a proteiny NF-kappaB/NFAT hrají důležitou roli v jejich kooperativní aktivaci zesilovače viru lidské imunodeficience v T buňkách. (anglicky) // Journal of Virology : deník. - 1997. - Sv. 71 , č. 5 . - S. 3563-3573 . — PMID 9094628 .
Li SL, Valente AJ, Zhao SJ, Clark RA PU.1 je nezbytný pro aktivitu promotoru p47(phox) v myeloidních buňkách. (anglicky) // Journal of Biological Chemistry : journal. - 1997. - Sv. 272 , č.p. 28 . - S. 17802-17809 . doi : 10.1074 / jbc.272.28.17802 . — PMID 9211934 .
Tsukada J., Misago M., Serino Y., Ogawa R., Murakami S., Nakanishi M., Tonai S., Kominato Y., Morimoto I., Auron PE, Eto S. Virus lidské T-buněčné leukémie typu I Tax transaktivuje promotor genu lidského prointerleukinu-1beta prostřednictvím asociace se dvěma transkripčními faktory, jaderným faktorem-interleukin-6 a Spi-1. (anglicky) // Krev : deník. — Americká hematologická společnost, 1997. - Sv. 90 , č. 8 . - S. 3142-3153 . — PMID 9376596 .
Hallier M., Lerga A., Barnache S., Tavitian A., Moreau-Gachelin F. Transkripční faktor Spi-1/PU.1 interaguje s potenciálním sestřihovým faktorem TLS. (anglicky) // Journal of Biological Chemistry : journal. - 1998. - Sv. 273 , č.p. 9 . - S. 4838-4842 . doi : 10.1074/ jbc.273.9.4838 . — PMID 9478924 .
Suzuki S., Kumatori A., Haagen IA, Fujii Y., Sadat MA, Jun HL, Tsuji Y., Roos D., Nakamura M. PU.1 jako základní aktivátor pro expresi genu gp91(phox) u člověka periferní neutrofily, monocyty a B lymfocyty. (anglicky) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. - 1998. - Sv. 95 , č. 11 . - S. 6085-6090 . - doi : 10.1073/pnas.95.11.6085 . — PMID 9600921 .
Carrère S., Verger A., Flourens A., Stehelin D., Duterque-Coquillaud M. Erg proteiny, transkripční faktory rodiny Ets, tvoří homo, heterodimery a ternární komplexy prostřednictvím dvou odlišných domén. (anglicky) // Oncogene : deník. - 1998. - Sv. 16 , č. 25 . - str. 3261-3268 . - doi : 10.1038/sj.onc.1201868 . — PMID 9681824 .
Sato M., Morii E., Takebayashi-Suzuki K., Yasui N., Ochi T., Kitamura Y., Nomura S. Transkripční faktor spojený s mikroftalmií interaguje s PU.1 a c-Fos: stanovení jejich subcelulární lokalizace. (anglicky) // Biochemical and Biophysical Research Communications : deník. - 1999. - Sv. 254 , č.p. 2 . - str. 384-387 . - doi : 10.1006/bbrc.1998.9918 . — PMID 9918847 .
Brass AL, Zhu AQ, Singh H. Požadavky na sestavení komplexů aktivátoru PU.1-Pip (IRF-4): inhibiční funkce in vivo pomocí fúzovaných dimerů. (anglicky) // The EMBO Journal : deník. - 1999. - Sv. 18 , č. 4 . - str. 977-991 . doi : 10.1093 / emboj/18.4.977 . — PMID 10022840 .
Yamamoto H., Kihara-Negishi F., Yamada T., Hashimoto Y., Oikawa T. Fyzikální a funkční interakce mezi transkripčním faktorem PU.1 a koaktivátorem CBP. (anglicky) // Oncogene : deník. - 1999. - Sv. 18 , č. 7 . - S. 1495-1501 . - doi : 10.1038/sj.onc.1202427 . — PMID 10050886 .
Rao S., Matsumura A., Yoon J., Simon MC SPI-B aktivuje transkripci prostřednictvím jedinečné prolinové, serinové a threoninové domény a vykazuje rozdíly v DNA vazebné afinitě od PU.1. (anglicky) // Journal of Biological Chemistry : journal. - 1999. - Sv. 274 , č.p. 16 . - S. 11115-11124 . doi : 10.1074 / jbc.274.16.11115 . — PMID 10196196 .
Mao S., Frank RC, Zhang J., Miyazaki Y., Nimer SD Funkční a fyzikální interakce mezi proteiny AML1 a proteinem ETS, MEF: implikace pro patogenezi t(8;21)-pozitivních leukémií. (anglicky) // Molekulární a buněčná biologie : deník. - 1999. - Sv. 19 , č. 5 . - str. 3635-3644 . — PMID 10207087 .