X-gal

5-brom-4-chlor-3-indoyl-beta-D-galaktopyranosid
Všeobecné
Systematický
název
5-brom-4-chlor-3-indoyl-beta-D-galaktopyranosid
Chem. vzorec C14H15BrClNO6 _ _ _ _ _
Fyzikální vlastnosti
Molární hmotnost 408,629 g/ mol
Klasifikace
Reg. Číslo CAS 7240-90-6
PubChem
Reg. číslo EINECS 230-640-8
ÚSMĚVY   C1=CC(=C(C2=C1NC=C20[CH]3[C@@H]([C@H]([C@H]([C@H](O3)CO)O)O )O)Cl)Br
InChI   InChI=lS/C14H15BrClNO6/c15-5-1-2-6-9(10(5)16)7(3-17-6)22-14-13(21)12(20)11(19)8( 4-18)23-14/h1-3,8,11-14,17-21H,4H2/t8-,11+,12+,13-,14-/m1/s1OPIFSICVWOWJMJ-AEOCFKNESA-N
CHEBI 75055
ChemSpider
Údaje jsou založeny na standardních podmínkách (25 °C, 100 kPa), pokud není uvedeno jinak.
 Mediální soubory na Wikimedia Commons

X-gal (také BCIG z anglického  bromo-chloro-indolyl-galaktopyranosid ) je organická sloučenina skládající se z galaktózy kombinované s indolem . Je velmi široce používán jako substrát pro beta-galaktosidázy v genetickém inženýrství a molekulární biologii .

Aplikace

Klonování

X-gal se používá při klonování genů ke stanovení buněčné exprese enzymu p-galaktosidázy kódovaného v genu lacZ .

X-gal je štěpen β-galaktosidázami za vzniku galaktózy a 5-brom-4-chlor-3-hydroxyindolu. Ten se oxiduje na 5,5'-dibrom-4,4'-dichlor-indigo, nerozpustný barevný produkt. X-gal se přidá do Petriho misky nebo kultivační baňky spolu s induktorem p-galaktosidázy, jako je IPTG .

X-gal umožňuje vizuálně určit, které kolonie E. coli byly transformovány požadovaným vektorem. Normálně je v buňkách E. coli enzym kódovaný genem lacZ syntetizován působením induktoru IPTG a modré barvení se ztrácí v buňkách obsahujících geneticky upravený konstrukt, ve kterém je gen lacZ narušen v důsledku genetického vložení.

Reportér

Gen lacZ lze použít jako reportér , když bakterie nebo kvasinky rostou na médiu obsahujícím X-gal. Když je promotor cílového genu spojen s kódující částí genu galaktosidázy, vazba aktivátorového proteinu na promotor vede k vytvoření barevného produktu štěpení X-gal. [jeden]

Vodní průzkum

X-Gal se používá k detekci E. coli a příbuzných bakterií ve vzorcích vody.

Poznámky

  1. Joung J., Ramm E., Pabo C. Bakteriální dvouhybridní selekční systém pro studium interakcí protein-DNA a protein-protein  // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America  :  journal . - 2000. - Sv. 97 , č. 13 . - str. 7382-7387 . - doi : 10.1073/pnas.110149297 . — PMID 10852947 .