| Xbal | |
|---|---|
| Identifikátory | |
| Kód KF | 3.1.21.4 |
| Enzymové databáze | |
| IntEnz | pohled IntEnz |
| BRENDA | Vstup BRENDA |
| ExPASy | NiceZyme pohled |
| MetaCyc | metabolická dráha |
| KEGG | Vstup do KEGG |
| PRIAM | profil |
| Struktury PNR | RCSB PDB PDBe PDBj PDBsoučet |
| Vyhledávání | |
| PMC | články |
| PubMed | články |
| NCBI | NCBI proteiny |
Xbal je restrikční endonukleáza izolovaná z bakterie Xanthomonas badrii [1] .
Xbal je restrikční endonukleáza (typ II, podtyp P). To znamená, že Xbal rozpoznává palindromickou sekvenci DNA a vytváří omezení v palindromu v pevném bodě. V přítomnosti dimethylsulfoxidu (DMSO) a při vysokých koncentracích glycerolu v médiu ztrácí Xbal schopnost rozpoznat palindrom a provádí nespecifickou restrikci ( hvězdná aktivita ) . Po omezení se vytvoří lepivé konce s výstupky čtyř základen.
| palindromická zápletka | Omezovací produkty |
|---|---|
| 5'-TCTAGA-3' 3'-AGATCT-5' | 5'-T CTAGA-3' 3'-AGATC T-5' |
Aktivita restrikčního enzymu Xbal je inhibována methylací adeninu ( DAM metyláza ). Aktivita restrikčního enzymu je však zachována, když je cytosin ( DCM- nebo CpG - methyláza) methylován. .
Po dokončení restrikce DNA může být Xbal inaktivován tepelnou denaturací na 65 °C po dobu 20 minut. .
Xbal je široce používán ve výzkumu molekulární biologie. Xbal se používá zejména při klonování specifických nukleotidových sekvencí [2] v restrikční analýze .
Například Xbal byl použit při analýze polymorfismů estrogenového receptoru α [3] a lipoproteinu a (ApoB) [4] .