Virus ptačí encefalomyelitidy

Virus ptačí encefalomyelitidy
vědecká klasifikace
Skupina:Viry [1]Oblast:RiboviriaKrálovství:OrthornaviraeTyp:PisuviricotaTřída:PisoniviricetesObjednat:PicornaviralesRodina:pikornaviryRod:TremovirusPohled:Virus ptačí encefalomyelitidy
Mezinárodní vědecký název
Tremovirus A
Synonyma
  • Virus ptačí encefalomyelitidy
Baltimorská skupina
IV: (+)ssRNA viry

Virus ptačí encefalomyelitidy ( Tremovirus A )  je typ viru z rodiny pikornavirů . V roce 2014 došlo ke změně původního názvu druhu ( virus ptačí encefalomyelitidy ), stejně jako několik dalších druhů pikornavirů [2] .

Genom

Genom viru ptačí encefalomyelitidy byl sekvenován v roce 1999 [3] . Genom viru byl prvním ptačím pikornavirovým genomem, který byl sekvenován. Genom se skládá ze 7032 nukleotidů a je kratší než jakýkoli savčí pikornavirus.

Zdá se, že otevřený čtecí rámec kóduje polyprotein o 2134 aminokyselinách . Sekvence polyproteinu je z 39 % podobná sekvenci genomu viru hepatitidy A [4] . Bylo predikováno 11 polyproteinových štěpných produktů. Virus ptačí encefalomyelitidy 5'-UTR je nejkratší ze všech sekvenovaných pikornavirových genomů a na rozdíl od viru hepatitidy A neobsahuje dlouhé polypyrimidinové oblasti.

Poznámky

  1. ↑ Taxonomie virů  na webu Mezinárodního výboru pro taxonomii virů (ICTV) .
  2. ↑ Knowlesi, Nicku. Přejmenujte 12 druhů pikornavirů  : [ eng. ] // ICTV. — Přidělen kód: 2014.016aV. - 2014. - 15:00
  3. ↑ Marvil, P., Knowles, NJ, Mockett, AMA, Britton, P., Brown, TDK a Cavanagh, D. (1999). Virus ptačí encefalomyelitidy je pikornavirus a je nejblíže příbuzný viru hepatitidy A. Journal of General Virology 80 : 653-662. doi : 10.1099/0022-1317-80-3-653 .
  4. ↑ Bakhshesh M. , Groppelli E. , Willcocks MM , Royall E. , Belsham GJ , Roberts LO Pikornavirový virus ptačí encefalomyelitidy má prvek vnitřního vstupního místa pro ribozom podobný viru hepatitidy C.  (anglicky)  // Journal of virology. - 2008. - Sv. 82, č.p. 4 . - S. 1993-2003. - doi : 10.1128/JVI.01957-07 . — PMID 18077729 .