Huntingtin
Huntingtin |
---|
Krystalografická struktura N-konce proteinu huntingtin v lidském těle s uměle připojeným proteinem vázajícím maltózu. [jeden] |
PNR |
Ortologické vyhledávání: PDBe , RCSB
|
2D3X , 2LD0 , 2LD2 , 3IO4 , 3IO6 , 3IOR , 3IOT , 3IOU , 3IOV , 3IOW , 3LRH , 4FE8 , 4FEB , 4FEC , 4FED |
|
|
|
Symbol | HTT ; HD; IT15 |
---|
Externí ID | OMIM: 613004 MGI : 96067 HomoloGene : 1593 ChEMBL : 5514 GeneCards : HTT Gene |
---|
|
|
|
Více informací |
|
Pohled | Člověk | Myš | |
---|
Entrez | 3064 | 15194 | |
---|
Soubor | ENSG00000197386 | ENSMUSG00000029104 | |
---|
UniProt | P42858 | P42859 | |
---|
RefSeq (mRNA) | NM_002111 | NM_010414 | |
---|
RefSeq (protein) | NP_002102 | NP_034544 | |
---|
Locus (UCSC) | Chr 4: 3,07 - 3,24 Mb | Chr 5: 34,76 – 34,91 Mb | |
---|
Hledejte v PubMed | [jeden] | [2] | |
Huntingtin je protein [2] kódovaný genem HTT (také HD ) . Funkce normální formy tohoto proteinu není známa. Mutace v genu způsobují Huntingtonovu chorobu .
Struktura
Struktura proteinu huntingtin může být velmi odlišná, protože v důsledku genového polymorfismu obsahuje protein různý počet glutaminových zbytků . Bývá jich mezi 6 a 35 (největší zaznamenaný počet je asi 250 [3] ). Molekulová hmotnost huntingtinu závisí především na množství glutaminových zbytků. Protein obvykle obsahuje 3144 aminokyselin .
Funkce proteinu
Hlavní funkce huntingtinu není přesně objasněna, ale je spolehlivě známo, že hraje důležitou roli v nervových buňkách . V nich se podílí na signalizaci, transportu látek, vázání proteinů a ochraně buněk před apoptózou . Je také známo, že protein zvyšuje expresi BDNF na transkripční úrovni, ale mechanismus, kterým to huntingtin dělá, nebyl stanoven [4] . Huntingtin je také nezbytný pro normální průběh embryogeneze , při pokusech na myších při absenci homologního genu embryo rychle odumřelo [5] .
Interakce s jinými proteiny
Bylo zjištěno, že huntingtin může přímo interagovat s 19 typy proteinů . Šest z nich se používá při regulaci transkripce , další čtyři při transportu látek, další tři při signalizaci a funkce zbývajících šesti je neznámá.
Huntingtonova nemoc
Huntingtonova choroba nastane, pokud se v důsledku mutace 36krát nebo více objeví kodon CAG kódující glutamin v genu , díky čemuž se polyglutaminová sekvence na N-konci v proteinu prodlouží, to znamená, že zbytky glutaminu se stanou více než normální, což je v rozmezí 6-35 zbytků. V tomto případě vzniká místo normálního proteinu Htt huntingtin jeho mutací modifikovaná varianta mHtt. Předpokládá se, že Huntingtonova choroba vzniká právě kvůli zvýšenému toxickému účinku mHtt.
Klasifikace nukleotidové sekvence a stav onemocnění, který závisí na počtu CAG kodonů
Počet CAG kodonů |
Stav exprese mutace |
Závažnost onemocnění
|
<28 |
Norma |
Norma.
|
28-35 |
středně pokročilí |
Normální, během přenosu je možné zvýšení počtu opakování.
|
36-39 |
Částečná penetrace |
Pravděpodobnost výskytu patologie je relativně malá.
|
40 a výše |
Úplná penetrace |
Pravděpodobnost vzniku onemocnění je 100%.
|
Poznámky
- ↑ PNR 3io4 ; Kim MW , Chelliah Y. , Kim SW , Otwinowski Z. , Bezprozvanny I. Sekundární struktura Huntingtinské amino-terminální oblasti. (anglicky) // Structure (Londýn, Anglie: 1993). - 2009. - Sv. 17, č. 9 . - S. 1205-1212. - doi : 10.1016/j.str.2009.08.002 . — PMID 19748341 .
- ↑ Nový gen obsahující trinukleotidovou repetici, která je expandovaná a nestabilní na chromozomech Huntingtonovy choroby. Skupina společného výzkumu Huntingtonovy choroby. (anglicky) // Cell. - 1993. - Sv. 72, č.p. 6 . - S. 971-983. — PMID 8458085 .
- ↑ Nance MA , Mathias-Hagen V. , Breningstall G. , Wick MJ , McGlennen RC Analýza velmi velké trinukleotidové repetice u pacienta s juvenilní Huntingtonovou chorobou. (anglicky) // Neurologie. - 1999. - Sv. 52, č.p. 2 . - S. 392-394. — PMID 9932964 .
- ↑ Zuccato C. , Ciammola A. , Rigamonti D. , Leavitt BR , Goffredo D. , Conti L. , MacDonald ME , Friedlander RM , Silani V. , Hayden MR , Timmusk T. , Sipione S. , Los Cattaneo E. huntingtinem zprostředkovaná transkripce genu BDNF u Huntingtonovy choroby. (anglicky) // Věda (New York, NY). - 2001. - Sv. 293, č.p. 5529 . - S. 493-498. - doi : 10.1126/science.1059581 . — PMID 11408619 .
- ↑ Nasir J. , Floresco SB , O'Kusky JR , Diewert VM , Richman JM , Zeisler J. , Borowski A. , Marth JD , Phillips AG , Hayden MR Cílené narušení genu Huntingtonovy choroby má za následek embryonální letalitu a behaviorální a morfologické vlastnosti změny u heterozygotů. (anglicky) // Cell. - 1995. - Sv. 81, č.p. 5 . - S. 811-823. — PMID 7774020 .
Odkazy