Rozptýlené opakování

Dispergované repetice  jsou opakované sekvence nukleotidů v genomu. Liší se od tandemových opakování v tom, že nejsou umístěny postupně za sebou, ale ve vzdálenosti. Nachází se v eukaryotických a prokaryotických genomech. [1] Sekvence a počet repetic jsou závislé na druhu a organismu.

Dispergované repetice zahrnují retrotranspozony: dlouhé rozptýlené repetice ( LINEs , long interspersed elements ) a krátké rozptýlené repetice ( SINEs , short interspersed elements ).

Rozptýlené repetice v lidském genomu

Podle výsledků projektu Human Genome Project tvoří rozptýlené repetice asi 45 % celého lidského genomu: 21 % jsou dlouhé rozptýlené repetice, 13 % jsou krátké rozptýlené repetice, 8 % jsou LTR retro transpozony a 3 % jsou DNA transpozony. . [2] [3]

Poznámky

  1. JR Lupski, GM Weinstock.  Krátké, rozptýlené repetitivní sekvence DNA v prokaryotických genomech  // Americká společnost pro mikrobiologii. — Americká společnost pro mikrobiologii, 1992-7. — Sv. 174 , iss. 14 . - str. 4525-4529 . — ISSN 0021-9193 . Archivováno z originálu 1. září 2018.
  2. E.S. Lander, L. M. Linton, B. Birren, C. Nusbaum, M. C. Zody. Počáteční sekvenování a analýza lidského genomu   // Příroda . - 2001-02-15. — Sv. 409 , iss. 6822 . - S. 860-921 . — ISSN 0028-0836 . - doi : 10.1038/35057062 . Archivováno z originálu 15. června 2018.
  3. Retroviry: „pátý sloupec“ DNA  (ruština) , Popmech.ru . Archivováno z originálu 2. září 2018. Staženo 1. září 2018.

Literatura