Lidský koronavirus NL63

Lidský koronavirus NL63
vědecká klasifikace
Skupina:Viry [1]Oblast:RiboviriaKrálovství:OrthornaviraeTyp:PisuviricotaTřída:PisoniviricetesObjednat:NidoviralesPodřád:CornidovirineaeRodina:KoronaviryPodrodina:KoronaviryRod:AlfakoronavirusPodrod:setracovirusPohled:Lidský koronavirus NL63
Mezinárodní vědecký název
Lidský koronavirus NL63
Synonyma
  • HCoV-NL63
Baltimorská skupina
IV: (+)ssRNA viry

Human coronavirus NL63 [2] ( angl.  Human coronavirus NL63 ) je typ viru z čeledi koronavirů [3] , který byl detekován koncem roku 2004 u sedmiměsíčního dítěte s bronchiolitidou v Nizozemsku [4] . Virus je (+)jednovláknový RNA virus, který vstupuje do hostitelské buňky prostřednictvím receptoru ACE2 [5] [6] . Infekce virem byla celosvětově potvrzena a je spojena s mnoha běžnými příznaky a nemocemi. Přidružená onemocnění zahrnují mírné nebo středně těžké infekce horních cest dýchacích, těžké infekce dolních cest dýchacích, krupici a bronchiolitidu [4] .

Virus se vyskytuje především u malých dětí, starších osob a imunokompromitovaných pacientů s akutními respiračními infekcemi. Má také sezónní asociaci v mírném podnebí. Studie v Amsterdamu odhadla přítomnost HCoV-NL63 u přibližně 4,7 % běžných respiračních onemocnění [7] . Virus pochází z infikovaných palmových cibetek a netopýrů [8]

Příznaky

První případy infekce lidským koronavirem NL63 byly nalezeny u malých dětí s těžkými infekcemi dolních cest dýchacích přijatých do nemocnic. Ačkoli klinická prezentace viru může být závažná, byl nalezen také v mírných případech respirační infekce. Komorbidita HCoV-NL63 s jinými respiračními infekcemi ztěžovala určení specifických příznaků viru. Studie klinických příznaků u pacientů s HCoV-NL63 bez sekundární infekce zjistila, že nejčastějšími příznaky byly horečka, kašel, rýma, bolest v krku, chrapot, bronchitida, bronchiolitida, zápal plic a záď. První studie zaměřená na děti s onemocněním dolních cest dýchacích zjistila, že HCoV-NL63 je častější u ambulantních pacientů než u hospitalizovaných pacientů, což naznačuje, že jde o virus běžného nachlazení podobný HCoV-229E a HCoV-OC43, který obvykle způsobuje méně závažné příznaky [9]. . Vysoký výskyt krup je však specifický pro infekci HCoV-NL63.

Zdroj infekce

Předpokládá se, že HCoV-NL63 se šíří přímým přenosem z člověka na člověka v hustě obydlených oblastech. Virus může přežít až týden mimo tělo ve vodných roztocích při pokojové teplotě a tři hodiny na suchých površích [10] . Většina lidí se nakazí koronavirem během svého života, ale některé populace jsou k HCoV-NL63 náchylnější. Tato skupina zahrnuje děti do 5 let, starší osoby a osoby s oslabeným imunitním systémem. Zdá se, že virus má sezónní výskyt, nejčastěji se vyskytuje během zimních měsíců v mírném podnebí. V extrémnějších a tropických klimatech nemá virus žádnou preferenci pro konkrétní roční období. Mnoho studií uvádí společný výskyt HCoV-NL63 s jiným lidským koronavirem, virem chřipky A, lidským orthopneumovirem (RSV), virem parainfluenzy a lidským metapneumovirem (hMPV) [4] .

Převodový mechanismus

Přenos HCoV-NL63 je možný vypuzením kapének z dýchacího traktu, které se mohou šířit vzduchem nebo se šířit blízkým osobním kontaktem. Virus je schopen přežít až sedm dní v dýchacím traktu a zůstává infekční při pokojové teplotě [11] . Jakmile virus vstoupí do hostitele, váže se na buněčné receptory pomocí spike proteinů podobných těm, které se nacházejí v HIV-1 . Virus je schopen využít angiotensin-konvertující enzym 2 ( ACE2 ) jako vstupní receptor pro vazbu a vstup do cílových buněk [11] . Stanovení specifického vstupu viru do hostitelské buňky nebylo dokončeno. Buněčný vstup tedy nastává buď přímou buněčnou fúzí s plazmatickou membránou, nebo endocytózou následovanou membránovou fúzí. Vzhledem k nedostatku HCoV-NL63 cDNA klonu jsou studie replikačního cyklu omezené. Protože se jedná o pozitivní jednovláknový RNA virus, procesy replikace prostřednictvím transkripce a translace mohou probíhat v cytoplazmě infikované buňky.

Diagnostika

Je obtížné rozlišit mezi příznaky způsobenými infekcí virem HCoV-NL63 a příznaky způsobenými jinými běžnými lidskými viry, což ztěžuje diagnostiku a detekci. Reverzní transkripční polymerázová řetězová reakce vzorků odebraných výtěrem z nosohltanu je nejběžněji používanou metodou pro detekci viru [4] . K potvrzení infekce lze také použít virovou kulturu nebo testování sérových protilátek.

Prevence

Americké centrum pro kontrolu a prevenci nemocí ( CDC ) doporučuje několik opatření k prevenci infekce HCoV-NL63, včetně: častého mytí rukou mýdlem a vodou, vyhýbání se blízkému kontaktu s nemocnými lidmi a nedotýkání se očí, úst nebo nosu. [12] .

Léčba a prognóza

Léčba HCoV-NL63 závisí na závažnosti přidružených symptomů. Většina mírných až středně závažných infekcí sama odezní. Příznaky lze zmírnit užíváním léků proti bolesti nebo horečce, horkou sprchou nebo zvlhčovačem. Antivirová léčba může být nezbytná u infikovaných pacientů, kteří jsou přijati na jednotku intenzivní péče (JIP) kvůli akutní respirační infekci. Intravenózní imunoglobulin je inhibitor HCoV-NL63 schválený FDA , který se také používá k léčbě primární imunodeficience, RSV a Kawasakiho choroby [7] .

Nedávný výzkum

Nejnovější data[ kdy? ] naznačují souvislost infekce HCoV-NL63 s Kawasakiho chorobou , dětskou systémovou vaskulitidou, která může vést k aneuryzmatům koronárních tepen. Ve vyspělých zemích je Kawasakiho choroba nejčastější příčinou získané srdeční choroby u dětí [13] . Další analýza patogenity HCoV-NL63 se zdá být oprávněná, částečně kvůli nedávným důkazům, že tento virus používá stejný buněčný receptor jako SARS-CoV (ACE2) [11] . HCoV-NL63 byl také nalezen ve střevním traktu infikovaných jedinců a je spojován s gastroenteritidou [14] . Tento typ infekce je přímým důsledkem virové invaze do střevní sliznice. Role HCoV-NL63 u gastroenteritidy je nejasná kvůli typické koinfekci s jinými viry v tomto stavu. HCoV-NL63 je pravděpodobně nedostatečně detekován kvůli své roli u mnoha mírných až středně těžkých respiračních infekcí a komorbidit u jiných onemocnění. Vědci navrhli, že k určení účinků tohoto viru na systémy mimo dýchací trakt jsou zapotřebí komplexnější populační studie.

Poznámky

  1. Taxonomie virů  na webu Mezinárodního výboru pro taxonomii virů (ICTV) .
  2. Shchelkanov M. Yu., Popova A. Yu., Dedkov V. G., Akimkin V. G., Maleev V. V. Historie studia a moderní klasifikace koronavirů (Nidovirales: Coronaviridae)  // Infekce a imunita  : časopis. - 2020. - T. 10 , č. 2 . - S. 221-246 . Archivováno z originálu 25. června 2020.
  3. Taxonomie virů  na webu Mezinárodního výboru pro taxonomii virů (ICTV) . (Přístup: 21. února 2020)
  4. 1 2 3 4 Abdul-Rasool S., Fielding BC Understanding Human Coronavirus HCoV-NL63 // The Open Virology Journal. - 2010. - Květen ( díl 4 ). - S. 76-84 . - doi : 10.2174/1874357901004010076 . — PMID 20700397 .
  5. ACE2 angiotenzin I konvertující enzym 2 - gen . NCBI (28. února 2020). — „Protein kódovaný tímto genem patří do rodiny enzymů konvertujících angiotenzin dipeptidylkarboxydipeptidáz a má značnou homologii s lidským enzymem konvertujícím angiotensin 1. Tento vylučovaný protein katalyzuje štěpení angiotensinu I na angiotenzin 1-9 a angiotenzinu II na vazodilatační angiotensin 1-7. Orgánově a buněčně specifická exprese tohoto genu naznačuje, že může hrát roli v regulaci kardiovaskulárních a renálních funkcí a také plodnosti. Kromě toho je kódovaný protein funkčním receptorem pro spike glykoprotein lidského koronaviru HCoV-NL63 a koronavirů lidského těžkého akutního respiračního syndromu, SARS-CoV a SARS-CoV-2 (virus COVID-19).“ Získáno 21. března 2020. Archivováno z originálu dne 24. prosince 2014.
  6. Fehr AR, Perlman S. Koronaviry: přehled jejich replikace a patogeneze   // Methods in Molecular Biology : deník. - Springer, 2015. - Sv. 1282 . - str. 1-23 . — ISBN 978-1-4939-2438-7 . - doi : 10.1007/978-1-4939-2438-7_1 . — PMID 25720466 .
  7. 1 2 van der Hoek L., Pyrc K., Berkhout B. Lidský koronavirus NL63, nový respirační virus  // Recenze mikrobiologie  FEMS. - 2006. - září ( roč. 30 , č. 5 ). - str. 760-773 . - doi : 10.1111/j.1574-6976.2006.00032.x . — PMID 16911043 .
  8. Lim, Yvonne Xinyi; Ng, Yan Ling; Tam, James P.; Liu, Ding Xiang. Human Coronaviruses: A Review of Virus-Host Interactions  (anglicky)  // Diseases: journal. - 2016. - 25. července ( díl 4 , č. 3 ). — S. 26 . — ISSN 2079-9721 . - doi : 10.3390/nemoci4030026 . — PMID 28933406 . . — Viz tabulka 1.
  9. van der Hoek L., Berkhout B. Otázky týkající se koronaviru New Haven  // The  Journal of Infectious Diseases . - 2005. - Červenec ( roč. 192 , č. 2 ). — S. 350–1; odpověď autora 353–4 . - doi : 10.1086/430795 . — PMID 15962232 .
  10. Lidský koronavirus . Agentura veřejného zdraví Kanady (19. srpna 2011). Získáno 22. července 2015. Archivováno z originálu 3. července 2017.
  11. 1 2 3 Hofmann H., Pyrc K., van der Hoek L., Geier M., Berkhout B., Pöhlmann S.  Lidský koronavirus NL63 využívá receptor koronaviru těžkého akutního respiračního syndromu pro buněčný vstup  // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America  : journal. - 2005. - Květen ( roč. 102 , č. 22 ). - str. 7988-7993 . - doi : 10.1073/pnas.0409465102 . - . — PMID 15897467 .
  12. O koronaviru . Centrum pro kontrolu nemocí . Získáno 22. července 2015. Archivováno z originálu dne 27. července 2015.
  13. Kawasakiho nemoc . Klinika Mayo . Získáno 22. července 2015. Archivováno z originálu 13. srpna 2015.
  14. Fielding BC Lidský koronavirus NL63: klinicky významný virus? (anglicky)  // Budoucí mikrobiologie : deník. - 2011. - únor ( roč. 6 , č. 2 ). - S. 153-159 . - doi : 10.2217/fmb.10.166 . — PMID 21366416 .