Cytoglobin

cytoglobin

PDB se kreslí na základě 1umo.

Dostupné struktury

Ortologické vyhledávání: PDBe , RCSB

Seznam PDB ID
1UMO , 1URV , 1URY , 1UT0 , 1UX9 , 1V5H , 2DC3 , 3AG0 , 4B3W

Identifikátory

Symbol

CYGB ; HGB; STAP

Externí ID

OMIM: 608759 MGI : 2149481 HomoloGene : 12706 GeneCards : CYGB Gene

Genová ontologie
Funkce	• aktivita peroxidázy • aktivita přenašeče kyslíku • vazba iontů železa • vazba kyslíku • hemová vazba
buněčná složka	• cytoplazma • projekce neuronů • tělo neuronových buněk
biologický proces	• reakce na oxidační stres • transport kyslíku • oxidačně-redukční proces
Zdroje: Amigo / QuickGO

Profil exprese RNA

Více informací

ortology

Pohled

Člověk

Myš

Entrez

RefSeq (mRNA)

RefSeq (protein)

Locus (UCSC)

Chr 17:
74,52 – 74,55 Mb

Chr 11:
116,65 – 116,65 Mb

Hledejte v PubMed

[jeden]

[2]

Cytoglobin je produktem genu CYGB , který se nachází u lidí a jiných savců [1] .

Cytoglobin je globinový protein, který je exprimován ve všech tkáních a zvláště silně se hromadí u mořských savců . Předpokládá se, že je chrání před hypoxií . Jednou z pravděpodobných funkcí cytoglobinu je přenášet kyslík z arteriální krve do mozku [2] .

Aplikace

Exprese genu CYGB může být použita jako specifický marker pro separaci jaterních hvězdicových buněk z portálních myofibroblastů poškozených lidských jater [3] .

Poznámky

↑ Entrez Gen: CYGB cytoglobin . (neurčitý)
↑ Proč potápění mořští savci odolávají poškození mozku nízkým obsahem kyslíku . (neurčitý)
↑ Motoyama H., Komiya T., Thuy le TT, Tamori A., Enomoto M., Morikawa H., Iwai S., Uchida-Kobayashi S., Fujii H., Hagihara A., Kawamura E., Murakami Y. , Yoshizato K., Kawada N. Cytoglobin je exprimován v jaterních hvězdicových buňkách, ale ne v myofibroblastech, v normálních a fibrotických lidských játrech (anglicky) // Lab. Investovat. : deník. - 2014. - Sv. 94 , č. 2 . - S. 192-207 . - doi : 10.1038/labinvest.2013.135 . — PMID 24296877 .

Další čtení

Kawada N., Kristensen DB, Asahina K. a kol. Charakterizace proteinu asociovaného s aktivací hvězdicových buněk (STAP) s peroxidázovou aktivitou nacházející se v krysích jaterních hvězdicových buňkách. (anglicky) // J. Biol. Chem. : deník. - 2001. - Sv. 276 , č.p. 27 . - S. 25318-25323 . - doi : 10.1074/jbc.M102630200 . — PMID 11320098 .
Trent JT, Hargrove MS Všudypřítomně exprimovaný lidský hexakoordinační hemoglobin. (anglicky) // J. Biol. Chem. : deník. - 2002. - Sv. 277 , č.p. 22 . - S. 19538-19545 . - doi : 10.1074/jbc.M201934200 . — PMID 11893755 .
Burmester T., Ebner B., Weich B., Hankeln T. Cytoglobin: nový typ globinu všudypřítomně exprimovaný v tkáních obratlovců. (anglicky) // Molekulární biologie a evoluce : deník. - Oxford University Press , 2002. - Sv. 19 , č. 4 . - str. 416-421 . - doi : 10.1093/oxfordjournals.molbev.a004096 . — PMID 11919282 .
Asahina K., Kawada N., Kristensen DB a kol. Charakterizace proteinu spojeného s aktivací lidských hvězdicových buněk a jeho exprese v lidských játrech. (anglicky) // Biochim. Biophys. Acta : deník. - 2002. - Sv. 1577 , č.p. 3 . - str. 471-475 . - doi : 10.1016/s0167-4781(02)00477-3 . — PMID 12359339 .
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších sekvencí cDNA v plné délce // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal . - 2003. - Sv. 99 , č. 26 . - S. 16899-16903 . - doi : 10.1073/pnas.242603899 . — PMID 12477932 .
Sawai H., Kawada N., Yoshizato K. a kol. Charakterizace hemové environmentální struktury cytoglobinu, čtvrtého globinu u lidí (anglicky) // Biochemistry : journal. - 2003. - Sv. 42 , č. 17 . - S. 5133-5142 . - doi : 10.1021/bi027067e . — PMID 12718557 .
Geuens E., Brouns I., Flamez D. a kol. Globin v jádře! (anglicky) // J. Biol. Chem. : deník. - 2003. - Sv. 278 , č.p. 33 . - S. 30417-30420 . - doi : 10.1074/jbc.C300203200 . — PMID 12796507 .
Hamdane D., Kiger L., Dewilde S. a kol. Redoxní stav buňky reguluje vazebnou afinitu lidského neuroglobinu a cytoglobinu k ligandu (anglicky) // J. Biol. Chem. : deník. - 2004. - Sv. 278 , č.p. 51 . - S. 51713-51721 . - doi : 10.1074/jbc.M309396200 . — PMID 14530264 .
Schmidt M., Gerlach F., Avivi A., et al. Cytoglobin je respirační protein v pojivové tkáni a neuronech, který je up-regulován hypoxií // J. Biol. Chem. : deník. - 2004. - Sv. 279 , č.p. 9 . - S. 8063-8069 . - doi : 10.1074/jbc.M310540200 . — PMID 14660570 .
Ota T., Suzuki Y., Nishikawa T. a kol. Kompletní sekvenování a charakterizace 21 243 lidských cDNA plné délky // Nat . Genet. : deník. - 2004. - Sv. 36 , č. 1 . - str. 40-5 . - doi : 10.1038/ng1285 . — PMID 14702039 .
Hünermund G., Schirmacher A., Ringelstein B. a kol. Genomická organizace a analýza mutací tří kandidátních genů pro dědičnou neuralgickou amyotrofii // Svalový nerv : deník. - 2004. - Sv. 29 , č. 4 . - S. 601-604 . - doi : 10.1002/mus.20009 . — PMID 15052627 .
de Sanctis D., Dewilde S., Pesce A. a kol. Krystalová struktura cytoglobinu: čtvrtý typ globinu objevený u člověka vykazuje hexakoordinaci hemu // J. Mol. Biol. : deník. - 2004. - Sv. 336 , č.p. 4 . - S. 917-927 . - doi : 10.1016/j.jmb.2003.12.063 . — PMID 15095869 .
Sugimoto H., Makino M., Sawai H. a kol. Strukturální základ lidského cytoglobinu pro vazbu ligandu (anglicky) // J. Mol. Biol. : deník. - 2004. - Sv. 339 , č.p. 4 . - S. 873-885 . - doi : 10.1016/j.jmb.2004.04.024 . — PMID 15165856 .
Fago A., Hundahl C., Dewilde S. a kol. Alosterická regulace a teplotní závislost vazby kyslíku v lidském neuroglobinu a cytoglobinu. Molekulární mechanismy a fyziologický význam (anglicky) // J. Biol. Chem. : deník. - 2004. - Sv. 279 , č.p. 43 . - S. 44417-44426 . - doi : 10.1074/jbc.M407126200 . — PMID 15299006 .
Gerhard DS, Wagner L., Feingold EA a kol. Stav, kvalita a expanze projektu NIH Full-Length cDNA: The Savmalian Gene Collection (MGC ) // Genome Res. : deník. - 2004. - Sv. 14 , č. 10B . - S. 2121-2127 . - doi : 10.1101/gr.2596504 . — PMID 15489334 .
Hamdane D., Kiger L., Dewilde S. a kol. Hypertermální stabilita neuroglobinu a cytoglobinu (anglicky) // FEBS J. : deník. - 2005. - Sv. 272 , č.p. 8 . - S. 2076-2084 . - doi : 10.1111/j.1742-4658.2005.04635.x . — PMID 15819897 .
Sawai H., Makino M., Mizutani Y. a kol. Strukturální charakterizace proximálního a distálního histidinového prostředí cytoglobinu a neuroglobinu (anglicky) // Biochemistry : journal. - 2006. - Sv. 44 , č. 40 . - S. 13257-13265 . - doi : 10.1021/bi050997o . — PMID 16201751 .
Shaw RJ, Liloglou T., Rogers SN a kol. Methylace promotoru P16, RARβ, E-cadherinu, cyklinu A1 a cytoglobinu u rakoviny dutiny ústní: kvantitativní hodnocení pomocí pyrosekvenování // Br . J. Cancer : deník. - 2006. - Sv. 94 , č. 4 . - str. 561-568 . - doi : 10.1038/sj.bjc.6602972 . — PMID 16449996 .
McRonald FE, Liloglou T., Xinarianos G. a kol. Down-regulace genu pro cytoglobin, který se nachází na 17q25, u tylózy s rakovinou jícnu (TOC): důkaz represe transalel // Human Molecular Genetics : deník. - Oxford University Press , 2006. - Sv. 15 , č. 8 . - S. 1271-1277 . - doi : 10.1093/hmg/ddl042 . — PMID 16510494 .
Xinarianos G., McRonald FE, Risk JM a kol. Časté genetické a epigenetické abnormality přispívají k deregulaci cytoglobinu u nemalobuněčného karcinomu plic // Human Molecular Genetics : deník. - Oxford University Press , 2006. - Sv. 15 , č. 13 . - str. 2038-2044 . doi : 10.1093 / hmg/ddl128 . — PMID 16698880 .

Externí odkazy

MeSH cytoglobin