Corarchaeotes

Corarchaeotes
vědecká klasifikace
Doména:ArchaeaTyp:Corarchaeotes
Mezinárodní vědecký název
Korarchaeota Barns a kol. 1996
Synonyma
[ 1] [ 1]
Systematika na Wikispecies Obrázky na Wikimedia Commons TO JE   951424 NCBI   51967 EOL   10556730

Korarchaeotes [2] ( lat.  Korarchaeota ) jsou druhem archaea [3] .

Analýza genových sekvencí jejich 16s rRNA ukázala, že corarchaeotes se již dlouho oddělily od zbytku archaea a nepatří do jejich hlavních skupin, crenarchaeota ( Crenarchaeota ) a euryarchaeota ( Euryarchaeota ) [4] . Analýza genomu jednoho z corarcheotů pěstovaných ve smíšené kultuře odhalila řadu znaků, které jsou podobné crenarcheotům a euryarcheotům, a potvrdily tak hypotézu o existenci dávného společného předka těchto skupin [5] .

Ekologie

Corarchaeotes byly nalezeny pouze ve vysokoteplotních hydrotermálních průduchech . Různí jedinci mají rozdíly na různých fylogenetických úrovních spojených s podmínkami, ve kterých žijí: teplota, slanost vody (čerstvá nebo mořská) a/nebo geografie místa [6] . V přírodě byly nalezeny pouze malé počty [6] [7] [8] .

Klasifikace

Od června 2017 taxon zahrnuje pouze 1 popsaný rod a druh [3] , který dosud nebyl kultivován v čisté kultuře [2] :

• Rod Candidatus Korarchaeum Elkins et al. 2008
  • Candidatus Korarchaeum cryptofilum Elkins et al. 2008

V prostředí bylo nalezeno několik genomů, které patří k typu, ale ne k výše uvedenému rodu a druhu.

Poznámky

1. ↑ 1 2 Korarchaeota  (anglicky) na webových stránkách Národního centra pro biotechnologické informace (NCBI). (Přístup: 28. července 2017) .
2. ↑ 1 2 Vorobyova L. I. Archei: učebnice pro vysoké školy. - M.  : ICC "Akademkniga", 2007. - S. 361. - 447 s. : nemocný. - ISBN 978-5-94628-277-2 .
3. ↑ 1 2 Prohlížeč taxonomie: Korarchaeota  : [ eng. ]  // NCBI.  (Přístup: 28. července 2017) .
4. ↑ Barns SM, Delwiche CF, Palmer JD, Pace NR  Pohledy na archaální diverzitu, termofilii a monofylii z environmentálních sekvencí rRNA  // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America  : journal. - 1996. - Srpen ( roč. 93 , č. 17 ). - S. 9188-9193 . - doi : 10.1073/pnas.93.17.9188 . - . — PMID 8799176 .
5. ↑ Elkins JG, Podar M., Graham DE, Makarova KS, Wolf Y., Randau L., Hedlund BP, Brochier-Armanet C., Kunin V., Anderson I., Lapidus A., Goltsman E., Barry K. , Koonin EV, Hugenholtz P., Kyrpides N., Wanner G., Richardson P., Keller M., Stetter KO Korarchaální genom odhaluje poznatky o vývoji Archaea   // Sborník Národní akademie věd Spojených států Ameriky  : deník. - 2008. - Červenec ( roč. 105 , č. 1 ). - S. 8805-8806 . - doi : 10.1073/pnas.0801980105 . - . — PMID 18535141 .
6. ↑ 1 2 Auchtung TA, Shyndriayeva G., Cavanaugh CM 16S rRNA fylogenetická analýza a kvantifikace Korarchaeota pocházející z horkých pramenů na Kamčatce, Rusko  (anglicky)  // Extremophiles : journal. - 2011. - Sv. 15 , č. 1 . - str. 105-116 . - doi : 10.1007/s00792-010-0340-5 . — PMID 21153671 .
7. ↑ Reigstad LJ, Jorgensen SL, Schleper C. Rozmanitost a hojnost Korarchaeota v suchozemských horkých pramenech Islandu a Kamčatky  // ISME  J. : deník. - 2010. - Sv. 4 , ne. 3 . - str. 346-356 . - doi : 10.1038/ismej.2009.126 . — PMID 19956276 .
8. ↑ Auchtung Thomas A. (2007). Ekologie hydrotermální kandidátní archaální divize, Korarchaeota . Disertační práce, Harvard University.

Slovníky a encyklopedie	Britannica (online)
Taxonomie	EOL NCBI ITIS TSN WoRMS