Metanokoky
Methanococcales (lat.) — řád archaea produkujících metan , k červnu 2017, jediný ve třídě Methanococci Boone 2002 [1] [2] (synonymum Methanothermea Cavalier-Smith 2002 [3] ).
Klasifikace
Moderní klasifikace je založena na List of Prokaryotic Names with Standing in Nomenclature (LPSN) [1] , stejně jako National Center for Biotechnology Information (NCBI) [2] . Od července 2017, řád zahrnuje následující rodiny a rody:
Fylogeneze
Podrobnější vztahy mezi taxony jsou uvedeny ve studiích 16s rRNA , vydání 106 projektu „The All-Species Living Tree“ [15] :
metanokoky
|
Metanocaldococcus
|
|
|
|
Metanotorris
|
M. formicicus (typový druh)
|
|
|
|
Methanothermococcus thermolithotrophicus (druh druhu)
|
|
|
|
Methanococcus vannielii (typový druh)
|
|
|
|
Methanothermococcus okinawensis
|
|
|
Methanococcus aeolicus
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
Poznámky
- ↑ 1 2 Klasifikace domén a kmenů - Hierarchická klasifikace prokaryot (bakterií): Verze 2.0 : [ eng. ] // LPSN. - 2016. - 2. října.
- ↑ 1 2 Prohlížeč taxonomie: Methanococci : [ eng. ] // NCBI. (Přístup: 22. července 2017) .
- ↑ Třída Methanothermea : [ ang. ] // LPSN. (Přístup: 22. července 2017) .
- ↑ Balch WE, Fox GE, Magrum LJ, Woses ČR a Wolfe RS 1979. Metanogeny: přehodnocení jedinečné biologické skupiny . microbiol. Rev. 43 : 260-296.
- ↑ Kluyver AJ a van Niel CB 1936. Vyhlídky na přirozený systém klasifikace bakterií. Zentralbl. Bakterol. Parasitenkd. Infectinskr. Hyg., Abt. II 94 : 369-403.
- ↑ Barker HA 1936. Studie o bakteriích produkujících metan (odkaz není k dispozici) . Oblouk. Microbiol. 7 : 420-438.
- ↑ Mah RA, a Kuhn DA 1984. Přenos typového druhu rodu Methanococcus do rodu Methanosarcina pojmenováním Methanosarcina mazei (Barker 1936) comb. listopad. et emend. a zachování rodu Methanococcus (Approved Lists, 1980) s Methanococcus vannielii (Approved Lists, 1980) jako typovým druhem. Žádost o stanovisko . Int. J. Syst. Bacteriol. 34 : 263-265.
- ↑ Wayne LG 1986. Akce Soudní komise Mezinárodního výboru pro systematickou bakteriologii na žádosti o stanoviska publikované v letech 1983 a 1984 . Int. J. Syst. Bacteriol. 36 : 357-358.
- ↑ Keswani J., Orkand S., Premachandran U., Mandelco L., Franklin MJ a Whitman WB 1996. Fylogeneze a taxonomie mezofilních Methanococcus spp. a srovnání rRNA, hybridizace DNA a fenotypových metod . Int. J. Syst. Bacteriol. 46 : 727-735. PubMed .
- ↑ Mezinárodní unie mikrobiologických společností. 1986. Stanovisko 62. Soudní komise Mezinárodního výboru pro systematiku prokaryot: Přenos typového druhu rodu Methanococcus do rodu Methanosarcina jako Methanosarcina mazei (Barker 1936) comb. listopad. et emend. Mah a Kuhn 1984 a zachování rodu Methanococcus (Approved Lists, 1980) emend. Mah a Kuhn 1984 s Methanococcus vannielii (Approved Lists, 1980) jako typovým druhem . Int. J. Syst. Bacteriol. 36 :491.
- ↑ Jeanthon C., L'Haridon S., Pradel N. a Prieur D. 1999. Rychlá identifikace hypertermofilních metanokoků izolovaných z hlubokomořských hydrotermálních průduchů . Int. J. Syst. Bacteriol. 49 : 591-594.
- ↑ Whitman WB 2001. Rod II. Metanotermokok gen. listopad. In: Bergey's Manual of Systematic Bacteriology, 2. vyd., sv. 1 (DR Boone a RW Castenholz, eds.), Springer-Verlag, New York. str. 241-242.
- ↑ Koga Y., Morii H., Akagawa-Matsushita M. a Ohga I. 1998. Korelace složení polárních lipidů s fylogenezí 16S rRNA v methanogenech. Další analýza složek lipidových složek. biosci. Biotechnol. Biochem. 62 : 230-236.
- ↑ 1 2 3 Whitman WB, Boone DR a Koga Y. 2001. Rodina II. Methanocaldococcaceae fam. listopad. In: Bergey's Manual of Systematic Bacteriology, 2. vyd., sv. 1 (Archea a hluboce se rozvětvující a fototrofní bakterie) (DR Boone a RW Castenholz, eds.), Springer-Verlag, New York. str. 242-246.
- ↑ The All-Species Living Tree (Release LTPs106) : [PDF] : [ eng. ] // Komplexní databáze ribozomální RNA Silva . - 2011. - Srpen. — Datum přístupu: 17. 11. 2011. - Archivovaná kopie . Získáno 5. srpna 2012. Archivováno z originálu 11. srpna 2012. (neurčitý)
Archeální klasifikace |
---|
Euryarchaeota |
|
---|
TACK |
|
---|
Asgard |
|
---|
DPANN |
- Aenigmarchaeota
- Diaferotrity
- Micraarchaeota
- Nanoarchaeota
- Nanohaloarchaeota
- Pacearchaeota
- Parvarchaeota
- Undinarchaeota
- Woesearchaeota
|
---|
|