mikrokoky | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ||||||||||
vědecká klasifikace | ||||||||||
Doména:bakterieTyp:AktinobakterieTřída:AktinobakterieObjednat:MikrokokyRodina:MicrococcaceaeRod:mikrokoky | ||||||||||
Mezinárodní vědecký název | ||||||||||
Micrococcus Cohn 1872 emend. Wieser a kol. 2002 |
||||||||||
typ zobrazení | ||||||||||
Micrococcus luteus (Schroeter 1872) Cohn 1872 |
||||||||||
|
Mikrokoky [1] ( lat. Micrococcus ) je rod malých grampozitivních kulovitých bakterií z čeledi Micrococcaceae , které se nacházejí jednotlivě nebo v nepravidelných shlucích. Na hustých živných půdách tvoří kulaté hladké kolonie bílé, žluté nebo červené barvy. Jasná barva je způsobena uvolňováním barevného produktu do prostředí nebo pigmentací samotné buňky (barvu lze použít jako charakteristický znak).
Mikrokoky jsou obligátní aerobové , saprofyti nebo fakultativní parazité , neexistují žádné patogenní druhy. Všechny rostou dobře na živném agaru . Pigmenty tvořené mikrokoky nedifundují do média a jsou nerozpustné ve vodě. K dělení buněk dochází v libovolném směru. Obecně jsou mikrokoky nepohyblivé a netvoří endospory . Všechny mikrokoky obsahují "živočišný škrob" glykogen , který funguje jako zásobní buněčný materiál. U většiny druhů je optimální teplota růstu 25–30 °C. Mnoho druhů mikrokoků se může vyvinout při 5-8 °C. Některé druhy snesou zahřátí až na 63-65 °C po dobu 30 minut a krátkodobou pasterizaci při vysoké teplotě. Mikrokoky se mohou nacházet na kůži, v dutině ústní, dýchacích cestách lidí a zvířat, někdy na spojivkách a genitáliích. V přírodě jsou všudypřítomné - v půdě, vzduchu, sladkých a slaných vodách, stejně jako v potravinách.
První druh Micrococcus luteus byl poprvé popsán v roce 1872 německým mikrobiologem Ferdinandem Juliem Kohnem . M. luteus se stal typovým druhem pro rod Micrococcus.
Velkým přínosem do taxonomie koků byl anglický mikrobiolog Baird Parker , který studoval přes tisíc kultur koků izolovaných z různých zdrojů - půdy, vzduchu, mléka, povrchů rostlin, lidských a zvířecích těl. Nejprve všechny studované kultury koků zařadil do tří rodů - Staphylococcus , Micrococcus a Sarcina ; každý rod byl dále rozdělen do několika skupin na základě fyzikálně-biochemických vlastností. V roce 1964 subkomise pro taxonomii Micrococcaceae oficiálně přijala rozlišení mezi rody Staphylococcus a Micrococcus na základě anaerobní fermentace glukózy : členové rodu Staphylococcus jsou schopni fermentovat glukózu za anaerobních podmínek za vzniku kyseliny, zatímco kultury rod Micrococcus tuto vlastnost nemají. Příslušnost kultur k rodu Sarcina byla založena na schopnosti koků tvořit pravidelné balíčky buněk. Baird Parker i další autoři však odmítli oddělit aerobní pakotvorné koky do samostatného rodu Sarcina .
Pozdější studie ukázaly, že anaerobní fermentace glukózy není spolehlivým markerem pro rozlišení mezi mikrokoky a stafylokoky. Díky studiu nukleotidového složení DNA českými vědci (Kotsur, Martínek, Mazánek a další) bylo možné prokázat, že u zástupců rodu Staphylococcus se molární procento HC ( guanin + cytosin ) v DNA pohybuje v rozmezí z 30,7 na 36,4, zatímco u zástupců rodu Micrococcus - z 65 na 75. Následně bylo navrženo rozšířit rozsah kolísání hodnoty HC pro mikrokoky z 57 na 75 mol. %. Kultury koků, ve kterých byl obsah HC výrazně pod limitem pro něj stanoveným (39-51 mol. %), bylo navrženo zařadit do speciálního rodu - Planococcus .
Podle fyziologických a kulturních charakteristik a nukleotidového složení DNA se aerobní sarciny neliší od mikrokoků. Na základě toho bylo navrženo vyloučit aerobní pakotvorné koky z rodu Sarcina a převést je do rodu Micrococcus . Rodový název Sarcina je v tomto případě vyhrazen pro anaerobní druhy sarcin, které stabilně tvoří pakety a mají 28–30 mol. % GC ve složení bází DNA.
Na základě všech výše uvedených znaků byl od sarcin a stafylokoků oddělen rod Micrococcus . Pro posouzení, zda kmen v kontroverzních situacích patří k určitému rodu koků, se používá analýza složení buněčné stěny a obsahu menachinonů ( vitamin K2 ) v buňce.
V roce 1995 provedli taxonomové Stackebrandt et al . Pro její odstranění byly z rodu mikrokoků izolovány 4 nové rody: Kocuria , Nesterenkonia , Kytococcus a Dermacoccus [2] .
Ke květnu 2015 je do rodu Micrococcus zařazeno 10 druhů [3] .
Níže uvedená tabulka uvádí druhy, které byly zahrnuty do rodu před jeho oddělením v roce 1995, protože v mikrobiologických pracích mohou být stále popsány jako zástupci rodu Micrococci [3] :
Postavení druhu v rodu Micrococcus | Aktuální pozice |
---|---|
Micrococcus agilis Ali-Cohen 1889 | Arthrobacter agilis (Ali-Cohen 1889) Koch et al. 1995 |
Micrococcus halobius Onishi a Kamekura 1972 | Nesterenkonia halobia (Onishi a Kamekura 1972) Stackebrandt et al. 1995 |
Micrococcus kristinae Kloos a kol. 1974 | Kocuria kristinae (Kloos a kol. 1974) Stackebrandt a kol. 1995 |
Micrococcus nishinomiyaensis Oda 1935 | Dermacoccus nishinomiyaensis (Oda 1935) Stackebrandt a kol. 1995 |
Micrococcus roseus Flugge 1886 | Kocuria rosea (Flügge 1886) Stackebrandt et al. 1995 |
Micrococcus sedentarius ZoBell a Upham 1944 | Kytococcus sedentarius (ZoBell a Upham 1944) Stackebrandt et al. 1995 |
Micrococcus varis Migula 1900 | Kocuria varians (Migula 1900) Stackebrandt et al. 1995 |