Termín "kožní mikrobiota" se týká mikroorganismů, které žijí na kůži, typicky lidské kůži.
Mnohé z mikroorganismů, které žijí na lidské kůži, jsou bakterie asi 1000 druhů devatenácti typů [1] [2] . Většina mikroflóry obývá povrchové vrstvy epidermis a horní části vlasových folikulů.
Kožní mikroflóra je obvykle nepatogenní a buď komenzální (neškodí hostiteli) nebo mutualistická (prospěšná). Mezi výhody, které mohou bakterie nabídnout, patří zabránění kolonizaci, když se oportunní nebo patogenní organismy usadí na povrchu kůže tím, že soutěží o živiny, uvolňují proti nim chemikálie nebo stimulují imunitní systém kůže [3] .
Odhad počtu druhů přítomných na kůži byl radikálně změněn použitím 16S ribozomální RNA k identifikaci bakteriálních druhů přítomných ve vzorcích kůže přímo z jejich genetického materiálu. Dříve taková identifikace závisela na kulturní diagnostice , ve které mnoho odrůd bakterií nerostlo, a proto byly vědě skryty [1] .
Podle výsledků studií založených na kulturní diagnostice byly za převažující považovány Staphylococcus epidermidis a Staphylococcus aureus . Studie na 16S ribozomální RNA však ukazují, že ačkoli jsou tyto druhy běžné, tvoří pouze 5 % kožních bakterií [4] .
Rozmanitost podmínek na povrchu kůže však poskytuje bohaté a rozmanité prostředí pro více bakterií. Dominují zástupci čtyř typů: Actinobacteria (51,8 %), Firmicutes (24,4 %), Proteobacteria (16,5 %) a Bacteroidetes (6,3 %).
Existují tři hlavní typy oblastí pokožky: mokrá, mastná (mazová) a suchá. V mazových zónách byly hlavními druhy propionibakterie a stafylokoky. Ve vlhkých oblastech těla převládají korynebakterie spolu se stafylokoky. V „suchých oblastech“ je směs druhů, ale převažují b-proteobakterie a flavobakterie. Mikrobiomy mastných oblastí měly větší druhovou diverzitu než ty vlhké a suché. Oblasti s nejmenší podobností mezi jedinci různých druhů jsou prostory mezi prsty, prostory mezi prsty, podpaží a oblast pupku. Největší podobnost má křídla nosu, nozdry (uvnitř nosních dírek) a na horní třetině zad [1] .
| Mikroorganismus | Pozorování | patogenita |
|---|---|---|
| Staphylococcus epidermidis | všudypřítomný | Zřídka |
| Staphylococcus aureus | Zřídka | Patogenní |
| Staphylococcus varující | Zřídka | Zřídka |
| Streptococcus pyogenes | Zřídka | Patogenní |
| Streptococcus mitis | Často | Zřídka |
| Cutibacterium acnes | Často | Zřídka |
| Corynebacterium spp. | Často | Zřídka |
| Acinetobacter johnsonii | Často | Zřídka |
| Pseudomonas aeruginosa | Zřídka | Patogenní |
Studie oblasti mezi prsty 100 mladých lidí odhalila 14 různých rodů hub. Patří sem kvasinky, jako jsou Candida Albicans , Rhodotorula rubra, Torulopsis a Trichosporon cutaneum, dermatofyty (kůže živých hub), jako jsou Microsporum gypseum a Trichophyton rubrum a nedermatofytické houby (patogenní houby, které mohou žít v kůži), jako jsou Rhizopus stolonifer, Trichosporon cutaneum , Fusarium , Scopulariopsis brevicaulis , Curvularia , Alternaria alternata , Paecilomyces , Aspergillus flavus a druhy Penicillium [5] .
Studie Národního institutu pro výzkum lidského genomu v Bethesdě zkoumala DNA lidských kožních hub ve 14 různých částech těla. Jednalo se o zvukovod, mezi obočím, zadní část hlavy, za uchem, pata, nehty, mezi prsty, předloktí, záda, třísla, nosní dírky, hrudník, dlaň a loket. Studie prokázala širokou škálu hub po celém těle, nejbohatším biotopem je patka, která je domovem asi 80 druhů hub. Pro srovnání, pod nehty na nohou je asi 60 druhů a mezi prsty 40 druhů. Dalšími bohatými oblastmi jsou dlaň, předloktí a vnitřní strana lokte, vyskytuje se zde 18 až 32 druhů [6] .
Mikroflóra kůže může být komenzální , vzájemná nebo patogenní. Často mohou být všechny tři, v závislosti na síle imunitního systému dané osoby [3] .
Pseudomonas aeruginosa je příkladem mutualistické bakterie, která se může změnit v patogena a způsobit onemocnění: pokud se dostane do oběhového systému, může vést k infekcím kostí, kloubů, gastrointestinálního traktu a dýchacích cest. Může také způsobit dermatitidu . Pseudomonas aeruginosa však produkuje antimikrobiální činidla, jako je kyselina pseudomonová (která se komerčně používá ve farmaceutickém průmyslu, jako je mupirocin ). Má antimikrobiální aktivitu proti stafylokokovým a streptokokovým infekcím. Pseudomonas aeruginosa také produkuje látky, které inhibují růst druhů hub, jako jsou Candida krusei , Candida albicans , Torulopsis glabrata , Saccharomyces cerevisiae a Aspergillus fumigatus [7] . Jeho antimikrobiální aktivita je tak důležitá, že bylo zaznamenáno, že „odstranění P. aeruginosa z kůže perorálními nebo lokálními antibiotiky může naopak podporovat aberantní kvasinkovou kolonizaci a infekci“ [3] .
Kůže produkuje antimikrobiální peptidy, jako jsou katelicidiny, které kontrolují šíření kožních choroboplodných zárodků. Kathelicidiny nejen přímo snižují počet mikrobů, ale také indukují sekreci cytokinů, které vyvolávají zánět, angiogenezi a reepitelizaci. Stavy jako atopická dermatitida jsou spojovány se supresí produkce katelicidinu [8] .
U rosacey způsobuje nesprávné zpracování katelicidinu zánět . Psoriáza je spojena s produkcí katelicidinových peptidů, které mohou vyvolat autoinflamaci. Hlavním faktorem řídícím katelicidin je vitamín D3
Povrchové vrstvy kůže jsou přirozeně kyselé (pH 4–4,5) díky kyselině mléčné, která se nachází v potu a je produkována kožními bakteriemi [9] .
Mutualistické bakterie, jako jsou Staphylococcus, Micrococcus, Corynebacterium a Propionibacterium rostou při tomto pH, ale ne přechodné bakterie, jako jsou gramnegativní bakterie, jako jsou Escherichia a Pseudomonas nebo grampozitivní bakterie, jako je Staphylococcus aureus. Další faktor ovlivňující růst patologických bakterií. spočívá v tom, že antimikrobiální látky vylučované kůží jsou zesíleny v kyselém prostředí [9] . V alkalických podmínkách se bakterie přestanou uchycovat na kůži a jsou snadněji odstraněny. Bylo pozorováno, že kůže také bobtná v alkalických podmínkách a otevírá póry, což umožňuje sekreci mazových žláz vystupovat na povrch.
Když je aktivován, imunitní systém kůže vyvine buněčnou imunitu proti mikrobům, jako jsou dermatofyty (kožní houby) [10] . Jednou z reakcí je zvýšení obratu stratum corneum a tím odstranění plísně z povrchu kůže.
Kožní houby jako Trichophyton rubrum se vyvinuly tak, aby vytvořily látky, které na ně omezují imunitní odpověď [10] . Exfoliace pokožky je hlavním prostředkem v boji proti hromadění flóry na povrchu pokožky.