Aktinobakterie

Aktinobakterie
Actinomyces israelii
vědecká klasifikace
Doména:bakterieTyp:Aktinobakterie
Mezinárodní vědecký název
Actinobacteria Thrash and Coates 2012
Systematika na Wikispecies Obrázky na Wikimedia Commons TO JE   956099 NCBI   201174 EOL   7861 FW   325172

Actinobacteria ( lat.  Actinobacteria , z aktino- + bakterie bakterie ) je oddělení gram -pozitivních bakterií s vysokým obsahem guaninu a cytosinu [1] [2] , které zahrnuje jak stejnojmennou třídu, tak 5 dalších tříd [ 3] . Mohou být suchozemské nebo vodní [4] . Bylo navrženo klasifikovat aktinobakterie pomocí RNA nebo analýzou glutaminsyntetázy [5] [6] .

Stanoviště a životní styl

Aktinobakterie obývají půdy , stejně jako sladké a mořské vody. Hrají důležitou roli při rozkladu organické hmoty , jako je celulóza a chitin , a účastní se tak koloběhu organické hmoty a uhlíkového cyklu. Tím se doplní zásoba živin v půdě, která je důležitá pro tvorbu humusu. Jiné aktinobakterie žijí na rostlinách a zvířatech, včetně některých patogenů , jako jsou mykobakterie , streptomycety .

Charakteristika

Některé aktinobakterie tvoří větvená vlákna podobná myceliu . Z tohoto důvodu byly původně klasifikovány jako aktinomycety. Většina druhů je aerobních , ale několik, jako je Actinomyces israelii , může existovat za anaerobních podmínek.

Určité druhy aktinobakterií jsou zodpovědné za specifický zápach vycházející z půdy po dešti. Většinou se tento jev vyskytuje v oblastech s teplým klimatem [7] .

Klasifikace

Od prosince 2017 zahrnuje kmen Actinobacteria následující taxony až do řádu [3] :

• Třída Acidimicrobia Norris 2013
  • Řád Acidimicrobiales Stackebrandt et al. 1997 opravit. Zhi a kol. 2009
• Třída Actinobacteria Stackebrandt et al. 1997 - Actinobacteria
  • Řád Acidothermales Sen et al. 2014
  • Objednejte Actinomycetales Buchanan 1917 emend. Zhi a kol. 2009 - Actinomycetes
  • Řád Bifidobacteriales Stackebrandt et al. 1997 opravit. Zhi a kol. 2009
  • Řád Frankiales Sen et al. 2014
  • Řád Geodermatophilales Sen et al. 2014
  • Objednejte si Kineosporiales Kämpfer 2015
  • Řád Micrococcales Prévot 1940
  • Řád Nakamurellales Sen et al. 2014
  • Řád Nitriliruptorales Sorokin et al. 2009
• Třída Coriobacteriia König 2013
  • Řád Coriobacteriales Stackebrandt et al. 1997 opravit. Zhi a kol. 2009
  • Řád Eggerthellales Gupta et al. 2013
• Třída Nitriliruptoria Ludwig et al. 2013
  • Řád Egibacterales Zhang et al. 2016
  • Řád Euzebyales Kurahashi et al. 2010
• Třída Rubrobacteria Suzuki 2013
  • Řád Gaialles Albuquerque et al. 2012
  • Řád Rubrobacterales Rainey et al. 1997 opravit. Zhi a kol. 2009
  • Objednejte Solirubrobacterales Reddy a Garcia-Pichel 2009
• Třída termoleofilie Suzuki a Whitman 2013
  • Objednejte Thermoleophilales Reddy a Garcia-Pichel 2009

Lidské použití

Aktinobakterie jsou dobře známé jako producenti sekundárních metabolitů , které vyvolávají farmakologický a komerční zájem. V roce 1940 Zelman Waxman objevil, že bakterie žijící v půdě produkují aktinomycin . Od té doby byly objeveny stovky dalších přirozeně se vyskytujících antibiotik produkovaných těmito mikroorganismy .

Poznámky

1. ↑ Ventura M., Canchaya C., Tauch A., et al. Genomics of Actinobacteria: sledování evoluční historie starověkého kmene  (anglicky)  // Microbiol. Mol. Biol. Rev. : deník. - 2007. - září ( roč. 71 , č. 3 ). - str. 495-548 . - doi : 10.1128/MMBR.00005-07 . — PMID 17804669 .
2. ↑ Přednáška MB451 Actinobacteria (nepřístupný odkaz - historie ) . Staženo: 21. listopadu 2008. (neurčitý)   (nedostupný odkaz)
3. ↑ 1 2 Klasifikace domén a kmenů - Hierarchická klasifikace prokaryot (bakterií): Verze 2.0  : [ eng. ]  // LPSN. - 2016. - 2. října.
4. ↑ Servin JA,  Herbold CW, Skophammer RG, Lake JA Důkazy vylučující kořen stromu života z aktinobakterií  // Molekulární biologie a evoluce : deník. - Oxford University Press , 2008. - Leden ( vol. 25 , č. 1 ). - str. 1-4 . - doi : 10.1093/molbev/msm249 . — PMID 18003601 .
5. ↑ Hayward D., van Helden PD, Wiid IJ Vývoj sekvence glutaminsyntetázy v mykobakteriích a jejich použití jako molekulárních markerů pro speciaci Actinobacteria  //  BioMed Central : deník. - 2009. - Sv. 9 . — S. 48 . - doi : 10.1186/1471-2148-9-48 . — PMID 19245690 .
6. ↑ Santos CL, Vieira J., Tavares F., et al. O povaze evoluce kožešiny: fylogenetický přístup u Actinobacteria  //  BioMed Central : deník. - 2008. - Sv. 8 . — S. 185 . - doi : 10.1186/1471-2148-8-185 . — PMID 18578876 .
7. ↑ HowStuffWorks "Co způsobuje zápach po dešti?" . Datum přístupu: 27. října 2011. Archivováno z originálu 30. března 2010. (neurčitý)