Gene knockdown je technika , která snižuje expresi jednoho nebo více genů změnou odpovídající nukleotidové sekvence nebo použitím krátkého oligonukleotidu , který je komplementární k odpovídající molekule mRNA . Metoda genového knockdownu odkazuje na metody reverzní genetiky . Když se změní sekvence genu, říká se, že organismus je pro tento gen knockoutem . V případě použití krátkých oligonukleotidů, které jsou komplementární k odpovídající mRNA nebo se vážou na nukleotidovou sekvenci v DNA , genový knockdown vede k dočasné změně parametrů genové exprese, aniž by se změnila struktura chromozomů a sekvence DNA genu. .
V případě krátkodobého knockdownu snižuje vazba oligonukleotidu na gen nebo transkripty expresi v důsledku blokování transkripce , translace nebo degradace mRNA (například prostřednictvím RNA interference ), sestřih pre-mRNA může také být narušen . [1] [2] Vědci studují vliv vypnutí genu nebo snížení jeho exprese na fenotyp organismu a srovnávají jej s normálními jedinci. Krátkodobé vyřazení genů se často používá ve vývojové biologii, protože oligonukleotidy mohou být snadno zavedeny do zygoty a budou přeneseny do všech dceřiných buněk během embryonálního vývoje. [3]