Virus Norwalk

Virus Norwalk

Fotografie norwalkských virů z transmisního elektronového mikroskopu. Rozlišení 50  nm
vědecká klasifikace
Skupina:Viry [1]Oblast:RiboviriaKrálovství:OrthornaviraeTyp:PisuviricotaTřída:PisoniviricetesObjednat:PicornaviralesRodina:kaliciviryRod:Noroviry ( Norovirus )Pohled:Virus Norwalk
Mezinárodní vědecký název
Norwalk virus
Baltimorská skupina
IV: (+)ssRNA viry

Norwalk virus [2] , nebo Norfolk virus [3] ( anglicky  Norwalk virus ), je typ virů obsahujících RNA z čeledi Caliciviridae ( Caliciviridae ), jediný v rodu norovirů [2] [3] ( Norovirus ) [4] . Zhruba v 90 % případů je tento virus celosvětově příčinou epidemií nebakteriálních gastrointestinálních onemocnění [5] [6] [7] a ve Spojených státech amerických je zodpovědný za výskyt 50 % případů gastroenteritidy [8 ] . Viry Norwalk mohou postihnout lidi všech věkových kategorií. Viry se přenášejí přímým kontaktem s pacientem a mnohem méně často fekálně-orální cestou prostřednictvím kontaminovaných potravin nebo vody [9] . Norovirová infekce je často označována jako střevní nebo žaludeční chřipka.

U nemocného člověka není imunita obvykle plně vyvinuta a je dočasná [10] . Existuje vrozená predispozice k infekci. Častěji onemocní lidé s první krevní skupinou [5] [11] , zatímco třetí a čtvrtá krevní skupina jsou vůči patogenu méně náchylné.

Ohniska onemocnění způsobená viry Norwalk se pravděpodobněji vyskytnou v uzavřených nebo polouzavřených zařízeních, jako jsou zařízení pro chronickou péči, nemocnice, věznice, ubytovny a výletní lodě, kde se jakmile se virus objeví, infekce se velmi rychle šíří z člověka na člověka nebo prostřednictvím kontaminovaných potravin [12] . V mnoha případech se norovirus přenesl potravou, jakmile se ho jedna nakažená osoba dotkla [13] . Po jediném dotyku nakažené osoby vypínače nebo kliky dveří se virus obvykle během několika hodin rozšíří po budově, ale použití dezinfekčních prostředků a mytí rukou šíření infekce zastaví [14] .

Virus Norwalk lze rychle inaktivovat zahřátím nebo ošetřením chlórovými dezinfekčními prostředky . Je odolnější vůči ošetření alkoholem a detergenty díky tomu, že jeho částice nemají lipidový obal [15] .

Existuje několik genoskupin viru Norwalk a většina z těch, které infikují člověka, je klasifikována do genoskupin GI a GII [16] .

Historie

Tento druh byl od té doby pojmenován Norwalk virus z lokality Norwalk, Ohio , kde bylo v listopadu 1968 hlášeno vypuknutí akutní gastroenteritidy mezi studenty základních škol [17] [18] . V roce 1972 imunoelektronová mikroskopie konzervovaných vzorků stolice odhalila virus, který se jmenoval Norwalk virus. Od té doby bylo hlášeno mnoho onemocnění s podobnými příznaky. Klonování a sekvenování genomu viru Norwalk ukázalo, že tyto viry mají stejnou genomickou organizaci jako viry z čeledi Caliciviridae [19] . Jméno rodu Norovirus bylo schváleno Mezinárodním výborem pro taxonomii virů v roce 2002 [20] .

Mezi typická onemocnění způsobená viry Norwalk patří onemocnění trávicího traktu v období podzim-zima, jejichž jedním z příznaků je nauzea: virová gastroenteritida [9] , onemocnění spojená se zánětem žaludku.

Jiné názvy byly použity k označení viru v různých časech: SRSV (malé kulaté viry), virus typu Sapporo, virus Snow Mountain [21] .

Příznaky

Inkubační doba je od 10 do 72 hodin, ve většině případů se příznaky objeví po 1-2 dnech. Většinou jde o samoléčivé onemocnění, hlavní příznaky vymizí po 1-3 dnech. Jeho charakteristické rysy jsou nauzea [22] , zvracení, průjem , ale i bolesti břicha, v některých případech ztráta chuťové citlivosti. U dětí zpravidla převažuje zvracení, u dospělých - průjem. Může se objevit ospalost, letargie, bolest svalů a mírná horečka. Příznaky mohou trvat několik dní.

Mezi rizikové skupiny patří děti, starší lidé a pacienti s oslabeným imunitním systémem . Pokud ignorujete příznaky a nebojujete s dehydratací , nemoc je plná život ohrožujících následků.

Norovirus, jakmile je v lidském těle, se replikuje v tenkém střevě [9] .

Diagnostika

Norovirus je obvykle diagnostikován polymerázovou řetězovou reakcí (PCR) nebo testy PCR v reálném čase , které ukazují výsledky během několika hodin. Tyto analýzy jsou poměrně citlivé a mohou určit koncentraci až 10 virových částic [23] .

Testy, jako je enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA) využívající protilátky proti různým kmenům noroviru, jsou komerčně dostupné, ale postrádají přesnost a citlivost [24] .

Prevence a kontrola infekcí

Imunita vůči Norwalk a noroviry obecně je dočasná a závisí na kmeni, takže každý, kdo onemocní, by měl přijmout opatření, aby zabránil dalšímu šíření viru. [25] Mytí rukou je i nadále jedním z nejúčinnějších prostředků prevence šíření patogenů (v tomto případě noroviru). Norovirus může být uvolněn do vzduchu prostřednictvím zvratků pacienta. Všechny povrchy, kde se může vyskytovat norovirus, by měly být přednostně dezinfikovány [26] .

Za účelem prevence nozokomiálních infekcí ve zdravotnických zařízeních se přijímá řada opatření, včetně každodenního mokrého čištění. Systémy NAV-CO2 se používají ve zdravotnických zařízeních, kde rozstřikování chloridů a jiných žíravých sloučenin nepříznivě ovlivňuje lékařskou elektroniku [27] .

Pravidelná dezinfekce povrchů, kterých se lidé dotýkají (vypínače, kliky dveří), snižuje pravděpodobnost infekce desetinásobně. Mytí rukou také předchází nemocem a je důležité si ruce správně mýt [14] .

Ligocyt se podílel na vývoji vakcíny, nicméně první fáze klinických studií skončila neúspěchem [28] .

Infekce potravou

Viry Norwalk se přenášejí přímým kontaktem s nakaženou osobou nebo nepřímo prostřednictvím kontaminované vody nebo jídla. Zpráva Centra pro kontrolu nemocí ( CDC ), zaměřená na 11 ohnisek ve státě New York , uvádí, že se předpokládá, že 7 případů bylo přeneseno z člověka na člověka, 2 prostřednictvím jídla, 1 prostřednictvím vody a příčina dalšího případu není známa. . Kontaminovaná voda se do lidského těla dostává několika způsoby: jako voda z vodovodu, voda ze studny, voda z otevřených veřejných nádrží, bazénů a voda ze strojů na výrobu ledu [29] .

Přísady z mořských plodů a salátů jsou potraviny, které nejčastěji vyvolávají epidemie Norwalk. Jíst syrové nebo nedostatečně tepelně upravené měkkýše a ústřice také představuje vysoké riziko infekce tímto virem. Jiné potraviny mohou být pacientem kontaminovány během přípravy jídla [30] [26] .

Incidence

Ve Spojených státech je virová gastroenteritida na druhém místě po běžném nachlazení v počtu hlášených návštěv lékaře . Ačkoli mnoho různých virů může způsobit virovou gastroenteritidu, má se za to, že asi 1/3 případů u kojenců ve věku 6 až 24 měsíců byly viry Norwalk. V rozvojových zemích je procento lidí, kteří si vyvinou imunitu v raném věku, velmi vysoké. V USA se procento v průběhu času postupně zvyšuje a dosahuje 50 % populace starší 18 let. Postinfekční imunita je však krátkodobá a nevylučuje reinfekci. Podle moderních výzkumů má třetí a čtvrtá krevní skupina částečnou ochranu před symptomatickou infekcí [31] [32] .

Průběh onemocnění a komplikace

Virus Norwalk způsobuje akutní gastroenteritidu . Inkubační doba trvá od 24 do 48 hodin, častěji 33-36 hodin, onemocnění trvá 24-60 hodin [9] . Komplikace jsou vzácné: pacienti jsou nejčastěji léčeni na odděleních urgentní péče a prakticky nejsou posíláni do běžných nemocnic. Odhaduje se, že ve Spojených státech na tuto infekci zemře každý rok asi 300 pacientů, především malých dětí, starších osob a pacientů s oslabeným imunitním systémem.

Detekce v potravinách

Standardní testy polymerázové řetězové reakce s reverzní transkriptázou na virus Norwalk (virus RNA) v jedlých měkkýšech a ústřicích jsou vyžadovány vládními laboratořemi, jako je FDA (Food and Drug Administration) ve Spojených státech. Standardní metody pro stanovení přítomnosti viru v potravinářských produktech přitom nejsou vždy přijatelné kvůli heterogennímu původu různých produktů, který ovlivňuje koncentraci a extrakci viru, a přítomnosti faktorů, které způsobují PCR (polymeráza řetězová reakce) metody analýzy neúčinné [33] .

Klasifikace

Virus Norwalk je virus bez vnějšího obalu z čeledi Caliciviridae , jehož genom je reprezentován jednovláknovou (+)RNA, rozlišuje se několik genetických skupin [34] . Podle Mezinárodního výboru pro taxonomii virů má rod norovirů jednu odrůdu - virus Norwalk ( Norwalk virus ), zkráceně „NV“. Sérotypy, kmeny a izoláty zahrnují:

Celosvětově jsou viry Norwalk hlavní příčinou akutní gastroenteritidy, která se často projevuje klastrovými ohnisky v ústavech. Noroviry jsou vysoce nakažlivé, pouze 10 virových částic může způsobit infekci. Nemoc se přenáší kontaminovanými potravinami nebo vodou a z člověka na člověka. Mechanismus přenosu je především fekálně-orální, ale je možné se nakazit i vzdušnými kapénkami, kdy se patogeny dostávají do vzduchu kapénkami zvratků. Noroviry se dělí do 5 genoskupin: genoskupina I (GI) zahrnuje virus Norwalk, virus Desert Shield a virus South Hampton a skupina II (GII) zahrnuje virus Bristol, virus Lordsdale, virus Toronto, virus Mexico, virus Hawaii a Snow Mountain. virus.

Genoskupiny jsou rozděleny do různých shluků nebo genotypů . Například genoskupina II, nejrozšířenější „lidská“ genoskupina, k dnešnímu dni obsahuje 19 genotypů. Genoskupiny I, II a IV způsobují léze u lidí, zatímco genoskupina III infikuje skot . Genoskupina V byla nedávno objevena u myší [35] .

Noroviry genoskupiny II, genotyp 4 (zkráceně GII4) jsou zodpovědné za většinu vzplanutí gastroenteritidy u dospělých a často cestují po celé planetě. Nedávné vzorky obsahují kmen US95/96-US, který je spojen s celosvětovými ohnisky od poloviny do konce 90. let 20. století, virus Farmington Hills je spojen virus Hunters ohnisky v Evropě a Spojených státech v roce 2002 a Evropě , Japonsku a Austrálie v roce 2004. V roce 2006 byla pozorována další celosvětová vlna norovirové infekce [36] . V prosinci 2007 bylo hlášeno ohnisko v country klubu v severní Kalifornii, kde bylo nakaženo 80 až 100 lidí. Dvě nové varianty GII4 byly zodpovědné za asi 80 % propuknutí viru Norwalk. Byly pojmenovány 2006a a 2006b. Nedávné zprávy naznačují souvislost mezi krevní skupinou a náchylností k norovirové infekci [37] [38] [39] .

Vědci z lékařské fakulty Washingtonské univerzity v St. Louis navrhli, že protein MDA-5 může být primárním imunitním senzorem, který detekuje přítomnost virů Norwalk v těle [40] . Je zvláštní, že někteří lidé sdílejí variaci genu MDA-5, která je činí náchylnějšími k infekci norovirem [41] .

Struktura viru

Genom viru Norwalk je jednovláknová (+)RNA o velikosti přibližně 7,5 kb , obsahující 3 otevřené čtecí rámce kódující nestrukturální polypeptid podstupující autoproteolýzu za vzniku 5 aktivních proteinů, hlavního strukturálního proteinu (VP1) v rozsahu 58 % 60 kDa a minoritní kapsidový protein (VP2) [42] . Při pohledu přes elektronový mikroskop vykazují virové částice amorfní povrchovou strukturu; velikost virových částic je mezi 27 a 38 nm [43] .

Viz také

Poznámky

  1. Taxonomie virů  na webu Mezinárodního výboru pro taxonomii virů (ICTV) .
  2. 1 2 Pinevich A. V. , Sirotkin A. K. , Gavrilova O. V. , Potekhin A. A. Virologie: učebnice. - Petrohrad.  : St. Petersburg University Press, 2012. - S. 355. - ISBN 978-5-288-05328-3 .
  3. 1 2 Sergeev V. A. , Nepoklonov E. A. , Aliper T. I. Viry a virové vakcíny. - M  .: Biblionics, 2007. - S. 462-463. — ISBN 5-98685-012-2 .
  4. Taxonomie virů  na webu Mezinárodního výboru pro taxonomii virů (ICTV) . (Přístup: 20. září 2021) .
  5. 1 2 Lindesmith L., Moe C., Marionneau S., et al. Lidská vnímavost a odolnost vůči infekci virem Norwalk  (anglicky)  // Nat. Med. : deník. - 2003. - Sv. 9 , č. 5 . - str. 548-553 . - doi : 10,1038/nm860 . — PMID 12692541 .
  6. Norovirus: Technický informační list . Národní centrum pro infekční nemoci, CDC. Archivováno z originálu 24. března 2012.
  7. Ahmed SM , Hall AJ , Robinson AE , Verhoef L. , Premkumar P. , Parashar UD , Koopmans M. , Lopman BA Globální prevalence noroviru v případech gastroenteritidy: systematický přehled a metaanalýza.  (anglicky)  // Infekční nemoci The Lancet. - 2014. - Sv. 14, č. 8 . - S. 725-730. - doi : 10.1016/S1473-3099(14)70767-4 . — PMID 24981041 .
  8. Widdowson MA, Sulka A., Bulens SN, et al. Norovirus and foodborne disease, Spojené státy americké, 1991-2000  //  Emerging Infect. Dis. : deník. - 2005. - Sv. 11 , č. 1 . - S. 95-102 . — PMID 15705329 .
  9. 1 2 3 4 Goodgame R. Norovirus gastroenteritis  (neurčitá)  // Curr Gastroenterol Rep. - 2006. - T. 8 , č. 5 . - S. 401-408 . - doi : 10.1007/s11894-006-0026-4 . — PMID 16968608 .
  10. Lindesmith L., Moe C., Lependu J., Frelinger JA, Treanor J., Baric RS Buněčná a humorální imunita po infekci virem Snow Mountain  //  J. Virol. : deník. - 2005. - Sv. 79 , č. 5 . - S. 2900-2909 . doi : 10.1128 / JVI.79.5.2900-2909.2005 . — PMID 15709009 .
  11. Hutson AM, Atmar RL, Graham DY, Estes MK Infekce a onemocnění virem Norwalk je spojeno s typem histo-krevní skupiny ABO  //  Journal of Infectious Diseases: journal. - 2003. - Červenec ( roč. 188 , č. 1 ). - S. 176-177 .
  12. Noda M., Fukuda S., Nishio O. Statistická analýza míry napadení v ohnisku nákazy noroviry  //  Int J Food Microbiol : journal. - 2007. - Sv. 122 . — S. 216 . - doi : 10.1016/j.ijfoodmicro.2007.11.073 . — PMID 18177970 .
  13. Koopmans M., Duizer E. Foodborne viry: objevující se problém   // Int . J. Food Microbiol.. - 2004. - Sv. 90 , č. 1 . - str. 23-41 . - doi : 10.1016/S0168-1605(03)00169-7 . — PMID 14672828 .
  14. 1 2 Viry  : O rychlosti šíření v areálu / os. z angličtiny. // Medicína založená na důkazech pro všechny. - 2021. - 19. září.
  15. Jimenez L., Chiang M. Virucidní aktivita dezinfekčního prostředku kvartérní amoniové sloučeniny proti kočičímu kaliciviru: náhrada za norovirus  //  Am J Infect Control : journal. - 2006. - Sv. 34 , č. 5 . - str. 269-273 . - doi : 10.1016/j.ajic.2005.11.009 . — PMID 16765204 .
  16. Vinjé J., Green J., Lewis DC, Gallimore CI, Brown DW, Koopmans MP Genetický polymorfismus napříč oblastmi tří otevřených čtecích rámců „virů podobných Norwalk“   // Arch . Virol. : deník. - 2000. - Sv. 145 , č.p. 2 . - str. 223-241 . — PMID 10752550 .
  17. Conly J, Johnston B (leden 2003). Norwalk virus - vypnuto a běží . Canadian Journal of Infectious Diseases . 14 (1): 11-3. DOI : 10.1155/2003/702517 . PMC2094906  . _ PMID  18159419 .
  18. ↑ Norovirus : Dokonalý patogen  . Poznatelný časopis. Získáno 26. února 2021. Archivováno z originálu dne 29. března 2020.
  19. Kapikian AZ Přehled virových gastroenteritid  (neopr.)  // Arch. Virol. Suppl.. - 1996. - T. 12 . - S. 7-19 . — PMID 9015097 .
  20. Správa ICTVdB (2006). 00.012.0.03. norovirus. In: ICTVdB - The Universal Virus Database, verze 4. Büchen-Osmond, C. (Ed), Columbia University, New York, USA
  21. Appleton H. Malé kulaté viry: klasifikace a role v infekcích přenášených potravinami  //  Ciba Found. Symp. : deník. - 1987. - Sv. 128 . - str. 108-125 . — PMID 3036438 .
  22. Norovirus u dětí v Camp Mirror Archivováno 28. října 2016 na Wayback Machine .
  23. Marshall JA, Bruggink LD Laboratorní diagnostika noroviru  (neopr.)  // Clin. Lab.. - 2006. - V. 52 , č. 11-12 . - S. 571-581 . — PMID 17175887 .
  24. Wilhelmi de Cal I., Revilla A., del Alamo JM, Román E., Moreno S., Sánchez-Fauquier A. Vyhodnocení dvou komerčních enzymových imunoanalýz pro detekci noroviru ve vzorcích stolice od hospitalizovaných dětí se sporadickou akutní gastroenteritidou  ( anglicky)  // Clin. microbiol. Infikovat. : deník. - 2007. - Sv. 13 , č. 3 . - str. 341-343 . - doi : 10.1111/j.1469-0691.2006.01594.x . — PMID 17391396 .
  25. Norfolk Virus (Norwalk) . virus-proch.ru _ Získáno 29. listopadu 2020. Archivováno z originálu dne 29. listopadu 2020.
  26. 1 2 CDC Prevence Norovirus Infection . Získáno 3. října 2017. Archivováno z originálu 9. prosince 2017.
  27. Chadwick PR, Beards G., Brown D., Caul EO, Cheesbrough J., Clarke I., Curry A., O'Brien S., Quigley K., Sellwood J., Westmoreland D. Management nemocničních ohnisek gastro -enteritida způsobená malými okrouhlými viry  (anglicky)  // J. Hosp. Infikovat. : deník. - 2000. - Sv. 45 , č. 1 . - str. 1-10 . doi : 10.1053 / jhin.2000.0662 . — PMID 10833336 .
  28. Vakcína proti noroviru společnosti Takeda v počáteční fázi nesplnila koncový bod – FierceVaccines archivováno 27. července 2014 na Wayback Machine .
  29. Hedberg CW, Osterholm MT Ohniska virové gastroenteritidy přenášené potravinami a vodou  // Recenze  mikrobiologie a molekulární biologie : deník. — Americká společnost pro mikrobiologii, 1993. - Sv. 6 , č. 3 . - S. 199-210 . — PMID 8395330 .
  30. Parashar UD, Monroe SS "Viry podobné Norwalku" jako příčina propuknutí alimentárních chorob  //  Rev. Med. Virol. : deník. - 2001. - Sv. 11 , č. 4 . - str. 243-252 . - doi : 10.1002/rmv.321 . — PMID 11479930 .
  31. Infekce a onemocnění virem Norwalk je spojeno s typem histo-krevní skupiny ABO , The Journal of Infectious Diseases . Staženo 5. února 2007.  (nepřístupný odkaz)
  32. Harrington PR , Lindesmith L. , Yount B. , Moe CL , Baric RS Vazba částic podobných viru Norwalk na antigeny histo-krevní skupiny ABH je blokována antiséry infikovaných lidských dobrovolníků nebo experimentálně očkovaných myší.  (anglicky)  // Journal of virology. - 2002. - Sv. 76, č.p. 23 . - S. 12335-12343. — PMID 12414974 .
  33. Shieh Y., Monroe SS, Fankhauser RL, Langlois GW, Burkhardt W., Baric RS Detekce norwalk-like viru u měkkýšů implikovaných v nemoci  //  J. Infect. Dis. : deník. - 2000. - Sv. 181 Pružný 2 . -P.S360 - S366 . — PMID 10804149 .
  34. Ústav zdraví a stárnutí Archivováno 1. května 2008 v laboratoři Wayback Machine Norovirus, definice případu.
  35. Ramirez S., Giammanco GM, De Grazia S., Colomba C., Martella V., Arista S. Genotypizace amplikonů GII.4 a GIIb noroviru RT-PCR analýzou RFLP  //  J. Virol. Metody: deník. - 2008. - Sv. 147 , č. 2 . - S. 250-256 . - doi : 10.1016/j.jviromet.2007.09.005 . — PMID 17953996 .
  36. Tu ET, Bull RA, Greening GE, Hewitt J., Lyon MJ, Marshall JA, McIver CJ, Rawlinson WD, White PA Epidemie gastroenteritidy v roce 2006 byly spojeny s šířením noroviru GII.4 varianty 2006a a  2006b )  // Klinika. Infikovat. Dis. : deník. - 2008. - Sv. 46 , č. 3 . - str. 413-420 . - doi : 10.1086/525259 . — PMID 18177226 .
  37. Huang P., Farkas T., Marionneau S., Zhong W., Ruvoën-Clouet N., Morrow AL, Altaye M., Pickering LK, Newburg DS, LePendu J., Jiang X. Noroviry se vážou na lidský ABO, Lewis a sekretorové histo-antigeny krevní skupiny: identifikace 4 odlišných kmenově specifických vzorů  //  J. Infect. Dis. : deník. - 2003. - Sv. 188 , č.p. 1 . - S. 19-31 . - doi : 10.1086/375742 . — PMID 12825167 .
  38. Huang P., Farkas T., Zhong W., Tan M., Thornton S., Morrow AL, Jiang X. Norovirus a antigeny histo-krevní skupiny: demonstrace širokého spektra kmenových specifičností a klasifikace dvou hlavních vazebných skupin mezi více vzory vazby  (anglicky)  // J. Virol. : deník. - 2005. - Sv. 79 , č. 11 . - str. 6714-6722 . - doi : 10.1128/JVI.79.11.6714-6722.2005 . — PMID 15890909 .
  39. Rockx BH, Vennema H., Hoebe CJ, Duizer E., Koopmans MP Asociace antigenů histo-krevní skupiny a citlivosti k norovirovým infekcím  //  J. Infect. Dis. : deník. - 2005. - Sv. 191 , č.p. 5 . - str. 749-754 . - doi : 10.1086/427779 . — PMID 15688291 .
  40. McCartney SA, Thackray LB, Gitlin L., Gilfillan S., Virgin Iv HW, Colonna M. MDA-5 rozpoznání myšího noroviru. (neopr.)  // PLoS Pathog. - 2008. - 18. července. — PMID 18636103 .
  41. Výzkumníci objevili primární senzor, který detekuje žaludeční viry Archivováno 2. února 2009 na Wayback Machine Newswise, staženo 20. července 2008.
  42. Clarke IN, Lambden PR Organizace a exprese genů pro kaliciviry  (neurčeno)  // J. Infect. Dis.. - 2000. - T. 181 Suppl 2 . - S. S309-S316 . — PMID 10804143 .
  43. Prasad BV, Crawford S., Lawton JA, Pesavento J., Hardy M., Estes MK Strukturální studie virů gastroenteritidy  (neopr.)  // Novartis Found. Symp.. - 2001. - T. 238 . - S. 26-37; diskuse 37-46 . — PMID 11444031 .

Literatura

Odkazy