I. M. Sechenov První moskevská státní lékařská univerzita

Ve struktuře univerzity je 12 ústavů, které jsou strukturálními subdivizemi Sechenovské univerzity. Mezi nimi jsou jak ústavy založené na klasických fakultách charakteristických pro lékařské univerzity v Rusku, tak ústavy jedinečné pro domácí lékařské vzdělávání, vedoucí klinické laboratoře nebo vědecké a vzdělávací aktivity:

• Ústav klinické medicíny . N. V. Sklifosovsky (ředitel - doktor lékařských věd , prof. Volel Beatrice Albertovna). Za datum počátku historie tohoto ústavu lze považovat rok 1758, kdy byla zahájena první výuka na lékařské fakultě IMU . V roce 1930 lékařská fakulta opustila 1. Moskevskou státní univerzitu, vytvořila nezávislou 1-MMI a stala se její lékařskou a preventivní fakultou. V roce 1969 byla z večerní fakulty zřízené v roce 1959 založena 2. lékařská fakulta, jejímž výsledkem se stala Lékařská a preventivní fakulta 1. lékařskou fakultou. V roce 1998 došlo ke sloučení 1. a 2. lékařské fakulty. V roce 2019 se z lékařské fakulty stal Institut klinické medicíny. V současné době IKM zahrnuje asi 50 oddělení;
• Zdravotní ústav . F. F. Erisman (ředitel - akademik Ruské akademie věd, doktor lékařských věd, prof . Nikolaj Ivanovič Briko ). V roce 1930 vznikem 1. MMI vznikla nová, sanitární a preventivní fakulta. Tato fakulta, která připravuje sanitáře (hygieniky a epidemiology), se stala první takovou fakultou v historii světového lékařského vzdělávání. V roce 1935 byl přejmenován na sanitární a hygienický a v roce 1992 na léčebně preventivní. Dne 18. února 2019 byl na základě MPF zřízen Zdravotní ústav. Nyní se IOZ skládá z 15 oddělení;
• Farmaceutický ústav . A. P. Nelyubina (ředitel - doktor farmacie , prof. Galina Vladislavovna Ramenskaya). V roce 1934 byl založen jako Moskevský farmaceutický institut (MPI). V letech 1952 až 1958 stavělo MFI budovu fyzické budovy, následně bylo získáno povolení na stavbu chemické budovy, kterou již dokončoval 1. MMI. 4. září 1958 bylo MFI sloučeno s 1. MMI a stalo se jeho Farmaceutickou fakultou. V roce 2016 byla Farmaceutická fakulta reorganizována na Institut farmacie a translační medicíny jako součást První moskevské státní lékařské univerzity. V roce 2018 byl Ústav farmacie a translační medicíny rozdělen na dva samostatné ústavy: Ústav farmacie a Ústav translační medicíny a biotechnologie, který byl součástí Vědeckotechnického parku biomedicíny. Farmaceutický ústav v současnosti zahrnuje 10 oddělení;
• Ústav zubního lékařství . E. V. Borovsky (ředitel - doktor lékařských věd, prof. Irina Mikhailovna Makeeva). Stomatologie se vyučuje od roku 1885 v oboru stomatologie na Klinice čelistní a obličejové chirurgie Lékařské fakulty IMU. V 1. MMI byl vyhlášen samostatný příjem na stomatologické oddělení lékařské a preventivní fakulty. V roce 2000 bylo rozhodnuto o otevření samostatné fakulty, v souvislosti s tím byla podána petice ministerstvu školství. Dne 27. dubna 2001 byla založena Fakulta zubního lékařství, na jejímž základě byl dne 16. listopadu 2017 zřízen Stomatologický ústav, který nyní zahrnuje 8 odborných pracovišť;
• Klinický ústav dětského zdraví . N. F. Filatova (ředitelka - členka korespondentka Ruské akademie věd, doktorka lékařských věd, prof . Ekaterina Iosifovna Alekseeva ). Byla otevřena 19. června 2010 jako dětská fakulta, v roce 2019 byla reorganizována na Ústav dětského zdraví. V současné době je v IZD 7 oddělení;
• Ústav lékařské parazitologie , tropických nemocí a nemocí přenášených vektory . E. I. Martsinovsky (ředitel - člen korespondent Ruské akademie věd, doktor lékařských věd Alexandr Nikolajevič Lukašev ). Založen 30. srpna 1920 jako Ústav protozoálních chorob a chemoterapie. V roce 1934 získal jméno svého prvního ředitele a byl přejmenován na Ústřední státní tropický institut. E. I. Martšinovský. V roce 1956 byl opět přejmenován na Ústav lékařské parazitologie a tropické medicíny. E. I. Martsinovsky, který vstoupil do MMA v roce 2000;
• Ústav urologie a lidského reprodukčního zdraví (ředitel - MD, Prof. Magomed-Salah Alkhazurovich Gazimiev ). Vzniklo v září 2010 z iniciativy rektora univerzity . Spolu s nejstarší urologickou klinikou v Rusku (založena v roce 1866) a Urologickým oddělením tvoří tento ústav unikátní výzkumnou, vzdělávací a lékařskou strukturu;
• Ústav klastrové onkologie (ředitel - akademik Ruské akademie věd, doktor lékařských věd, prof . Igor Vladimirovič Rešetov ). V roce 2017 bylo v rámci Institutu personalizované medicíny organizováno centrum personalizované onkologie. V roce 2019 vznikl samostatný Ústav klastrové onkologie;
• Institut vedení a managementu zdravotnictví (ředitel - kandidát ekonomie , doc. Igor Nikolaevich Kagramanyan ). Největší školicí středisko pro školení řídících pracovníků v oblasti veřejného zdraví, organizace, řízení a ekonomiky zdravotnictví. Od roku 2014 má Ústav statut Spolupracovního centra WHO pro vzdělávání tvůrců zdravotní politiky v oblasti prevence a kontroly nepřenosných nemocí;
• Institut digitální medicíny (ředitel - doktor technických věd , prof. Georgij Stanislavovič Lebeděv);
• Institut elektronického lékařského vzdělávání (ředitel - člen korespondent Ruské akademie věd, doktor lékařských věd, prof. Marina Arkadievna Kinkulkina );
• Ústav sociálních věd (ředitel - akademik Ruské akademie věd, doktor lékařských věd, doktor sociálních věd , prof. Andrej Veniaminovič Rešetnikov );
• Institut lingvistiky a mezikulturní komunikace (ředitel - PhD v oboru filologie , prof. Irina Yuryevna Markovina);
• Institut odborného vzdělávání (ředitel - doktor lékařských věd, prof. Shikh Evgenia Valerievna).