Worden, Alexandra

Alexandra Wordenová
Angličtina  Alexandra (Alex) Z. Worden

Správce v roce 2017
Datum narození 1970
Místo narození
Země
Místo výkonu práce
Alma mater

Alexandra Warden ( angl.  Alexandra (Alex) Z. Worden , narozena 1970 , Middlesex , Massachusetts ) je mikrobioložka a genomická ekoložka známá svými znalostmi o ekologii a evoluci oceánských mikrobů a jejich vlivu na globální biogeochemické cykly .

Výzkumné příspěvky

Wordenův výzkum se zaměřuje na fyziologii a ekologii eukaryotického fytoplanktonu a jejich roli v uhlíkovém cyklu [1] [2] . Tento výzkum zahájila prostřednictvím postdoktorandského stipendia NSF v mikrobiální biologii a následně jej rozšířila přizpůsobením několika molekulárních a ohmických metod k charakterizaci evoluce a ekologických příspěvků tohoto fotosyntetického planktonu, o kterém je nyní známo, že je hlavním primárním producentem oceánu [3] [4] . Na Scrippsově oceánografickém institutudalší studie mikrobiálních interakcí provedené v laboratoři Farouka Azama, vedl k její práci, která vyvrátila myšlenku, že V. cholerae existuje primárně vázaná na veslonôžky ve vodních systémech [5] . To bylo považováno za důležité pro pochopení ekologie tohoto lidského patogenu a vektorů přenosu infekčních buněk. Během tohoto období ona a Azam představili koncept biologie ekosystému (biologie ekosystému), který tento termín vytvořili v roce 2004 [6] . Tento koncept byl přijat vědeckou komunitou v několika novějších pracích [7] [8] a v současné době je vyvíjen biologem lidského mikrobiomu Jeroenem Raesem a mikrobiálním oceánografem Edwardem DeLongem . V roce 2015 byla zahájena konference Jacquese Monoda o biologii mořských ekosystémů [9] .

Warden je také známý jako průkopník „cílené metagenomiky“ [10] [11] [12] , ve které jsou buňky zvláštního zájmu odděleny od mas pomocí průtokové cytometrie (na lodi) a poté jsou genomy sekvenovány pouze z buněk největší zájem.. Pomocí tohoto přístupu Worden a její spolupracovníci z United Genome Institute sekvenovali částečné genomy klíčové skupiny nekultivovaných eukaryotických řas, ukazující distribuci těchto fotosyntetických prvoků v oceánu. Nedávno její laboratoř upravila tyto přístupy ke studiu nekultivovaných jednobuněčných predátorů v oceánu a objevila obří viry infikující choanoflagelláty , rozšířenou skupinu predátorů příbuzných zvířatům. Je pozoruhodné, že viry přinášejí nefotosyntetickému predátorskému hostiteli kompletní fotosystémy podobné bakteriorhodopsinu , které pumpují protony [13] .

Její laboratoř také zkoumá rodové složky suchozemských rostlin [14] , evoluční biologii a distribuci nekultivovaných taxonů [15] [16] a interakce mezi viry a hostitelskými buňkami fytoplanktonu. V roce 2015 ona a spoluautoři vyzvali k „přehodnocení mořského uhlíkového cyklu“ [17] . Warden publikuje v oblasti environmentální mikrobiologie, evoluční biologie, vědy o genomu a oceánografie .

Kariéra

Worden zahájila svou laboratoř v roce 2004 jako odborná asistentka na Rosenstiel School of Marine and Atmospheric Sciences.v Miami , Florida , USA . V roce 2007 ji najala Monterey Bay Aquarium Research Institute.na americkém západním pobřeží, když ji vedla Marsha McNutt , která je nyní předsedkyní Národní akademie věd USA . Během svého působení na MBARI se Worden také prosadil a stal se mimořádným profesorem na Kalifornské univerzitě v Santa Cruz . V současné době je profesorkou a vedoucí katedry v GEOMAR Helmholtzově centru pro výzkum oceánů v Kielua na univerzitě v německém Kielu.

První Wardenovy ceny přišly jako postgraduální stipendium NASA pro postgraduální studium Země a University of Georgia Regents Postgraduate Award. V roce 2000 získala postdoktorské stipendium US National Science Foundation v oboru mikrobiální biologie na podporu svého průkopnického výzkumu pikoeukaryot. Po založení své laboratoře v roce 2004 získala ocenění Young Investigator Award [18] .

V roce 2009 byl Worden jmenován výzkumným pracovníkem Kanadského institutu pro pokročilé studium .(CIFAR) a později se stal CIFAR Senior Fellow (2011). Byla vybrána z mezinárodní skupiny předních vědců jako mořský výzkumník pro nadaci Gordona a Betty Moorových.v roce 2013 [19] za její „kreativitu, inovaci a potenciál učinit zásadní nové průlomy“ [20] . V letech 2015 a 2016 byl Worden vědeckým pracovníkem pro námořní a klimatickou vědu na HWK [21] v Německu. V roce 2016 byla zvolena členkou Americké akademie mikrobiologie, čestné vedoucí skupiny Americké společnosti pro mikrobiologii .[22] . V roce 2021 byla jmenována Max Planck Fellow na Max Planck Institute for Evolutionary Biologyv Plönu [23] a stal se vědeckým pracovníkem v Radcliffe Institute for Advanced Study Harvardská univerzita [24] . V roce 2022 byla zvolena členkou Německé národní akademie věd Leopoldina .

Worden je zastáncem vzdělávání a inovací STEM a zdůrazňuje potřebu vhodných „...vzorů, které inspirují větší rozmanitost a kreativitu“ ve vědě [25] .

Vzdělávání

Worden navštěvovala Wellesley College , kde získala bakalářský titul v oboru historie a dokončila kurz v oboru Země, atmosfér a planetární vědy na Massachusetts Institute of Technology . Během svého působení na MIT pracovala v laboratořích mořského geochemika a paleo-oceánografa Johna M. Edmonda [26] , klimatologa Reginalda Newella [27] a oceánografické bioložky Sally W. Chisholmové . Získala doktorát z ekologie na Odum School of Ecology University of Georgia v Aténách , Georgia , USA v roce 2000.

Její raná zkušenost s inženýrstvím přišla díky počítačovému programování v BBN Technologies a poté šla na univerzitu a účastnila se projektu solárního elektrického vozidla MIT . V té době se tým oceněný MIT Solar Electric Vehicle [28] skládal z několika jednotlivců, kteří se stali předními inovátory ve světě technologií, včetně Gill Pratt [29] a Megan Smith ; tým založil Wardenův bratr, James Warden [30] [31] [32] . Inženýrské a technologické inovace zůstaly stálou součástí jejího oceánografického výzkumu.

Rodina

Warden má partnera a dvě děti [33] [34] .

Viz také

Poznámky

  1. ↑ Evropská komise: CORDIS: Novinky a události: Zelené geny poskytují pohled na změnu klimatu . cordis.europa.eu .
  2. ↑ DOE Joint Genome Institute JGI Community Faces: Alexandra Z. Worden (16. října 2008).
  3. ↑ Worden Alexandra Z (2004). „Posouzení dynamiky a ekologie mořského pikofytoplanktonu: Význam eukaryotické složky“. Limnologie a oceánografie . 49 (1): 168-179. Bibcode : 2004LimOc..49..168W . CiteSeerX  10.1.1.527.5206 . DOI : 10.4319/lo.2004.49.1.0168 .
  4. ↑ Martin, Cyrus (duben 2015). Temná hmota biologie. Současná biologie . 25 (8): R301-R307. DOI : 10.1016/j.cub.2015.03.010 . PMID26082952  . _
  5. ↑ Worden AZ, Seidel M, Smriga S, Wick A, Malfatti F, Bartlett D, Azam F (2006). „Trofická regulace Vibrio cholerae v pobřežních mořských vodách“. environmentální mikrobiologie . 8 (1): 21&ndash, 29. DOI : 10.1111/j.1462-2920.2005.00863.x . PMID  16343318 .
  6. ↑ Azam, F; Worden, A-Z (2004). "Oceánografie. Mikroby, molekuly a mořské ekosystémy“. věda . 303 (5664): 1622-4. DOI : 10.1126/science.1093892 . PMID  15016987 .
  7. ↑ Raes, J; Bork, P (2008). „Biologie molekulárních ekosystémů: K pochopení funkce komunity“ (PDF) . Recenze přírody Mikrobiologie . 6 (9): 693-9. DOI : 10.1038/nrmicro1935 . PMID  18587409 .
  8. ↑ Karsenti, E; Acinas, S.G.; Bork, P; Bowler, C; DeVargas, C; Raes, J; Sullivan, M; Arendt, D; Benzoni, F; Claverie, JM; Následuje, M; Gorsky, G; Hingamp, P; Judicone, D; Jaillon, O; Kandels-Lewis, S; Krzic, U; Ne, F; Ogata, H; Pešant, S; Reynaud, E.G.; Sardet, C; Sieracki, M.E.; Speich, S; Velayoudon, D; Weissenbach, J; Wincker, P; Oceány Tara, konsorcium (2011). „Holistický přístup k biologii mořských ekosystémů“ . Biologie PLOS . 9 (10): e1001177. doi : 10.1371/journal.pbio.1001177 . PMC  3196472 . PMID22028628  . _
  9. ↑ CNRS - Konference Jacques Monod 2015 . www.cnrs.fr. _
  10. ↑ Cuvelier, Marie L.; Allen, Andrew E.; Monier, Adam; McCrow, John P.; Messié, Monique; Tringe, Susannah G.; Woyke, Tanja; Welsh, Rory M.; Ishoey, Thomas; Lee, Jae Hyeok; Binder, Brian J.; DuPont, Chris L.; Latasa, Mikel; Guigand, Cedric; Buck, Kurt R.; Hilton, Jason; Thiagarajan, Mathangi; Caler, Elisabet; Čti, Betsy; Lasken, Roger S.; Chavez, Francisco P.; Worden, Alexandra Z. (2010-08-17). „Cílená metagenomika a ekologie celosvětově významného nekultivovaného eukaryotického fytoplanktonu“ . Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America . 107 (33): 14679-14684. Bibcode : 2010PNAS..10714679C . DOI : 10.1073/pnas.1001665107 . PMC2930470  . _ PMID20668244  . _
  11. ↑ Raven JA (2012). "Biogeografie řas: metagenomika ukazuje distribuci pikoplanktonických pelagofytů." Současná biologie . 22 (17): R675&ndash, 7. DOI : 10.1016/j.cub.2012.07.030 . PMID  22974994 .
  12. ↑ Martin, Cyrus (2015-04-20). Temná hmota biologie. Současná biologie . 25 (8): R301-R307. DOI : 10.1016/j.cub.2015.03.010 . PMID26082952  . _
  13. ↑ Needham, David M.; Yoshizawa, Susumu; Hosaka, Toshiaki; Poirier, Camille; Choi, Chang Jae; Hehenberger, Elisabeth; Irwin, Nicholas A.T.; Wilken, Susanne; Yung, Cheuk-Man; Bachy, Charles; Kurihara, Rika; Nakajima, Yu; Kojima, Keiichi; Kimura-Someya, Tomomi; Leonard, Guy; Malmström, Rex R.; Mende, Daniel R.; Olson, Daniel K.; sudo, Yuki; Sudek, Sebastián; Richards, Thomas A.; Delong, Edward F.; Keeling, Patrick J.; Santoro, Alyson E.; Shirouzu, Mikako; Iwasaki, Wataru; Worden, Alexandra Z. (2019-10-08). "Odlišná linie obřích virů přináší fotosystém rodopsinu jednobuněčným mořským predátorům . " Proceedings of the National Academy of Sciences . 116 (41): 20574-20583. Bibcode : 2019PNAS..11620574N . DOI : 10.1073/pnas.1907517116 . PMC  6789865 . PMID  31548428 .
  14. ↑ Archibald JM (2009). „Zelená evoluce, zelená revoluce“. věda . 324 (5924): 191&ndash, 192. Bibcode : 2009Sci...324..191A . DOI : 10.1126/science.1172972 . PMID  19359572 .
  15. ↑ redOrbit Biologové našli novou skupinu řas žijících ve sladké a slané vodě - Redorbit . redorbit.com (21. ledna 2011).
  16. ↑ http://www.sea-technology.com/news/archives/2011/mar_resources/mar_resources0311.php Archivováno z originálu 24. ledna 2012. SeaTechnology Magazine Článek o nově objevených řasách
  17. ↑ Worden, AZ; Sleduje, MJ; Giovannoni, SJ; Wilken, S; Zimmerman, AE; Keeling, PJ (2015). "Věda o životním prostředí. Přehodnocení mořského uhlíkového cyklu: Začlenění do rozmanitého životního stylu mikrobů“. věda . 347 (6223): 1257594. doi : 10.1126 /věda.1257594 . PMID25678667  . _
  18. ↑ Mitchum, Gary T. (prosinec 2004). KNIŽNÍ RECENZE. Bulletin limnologie a oceánografie . 13 (4): 73-74. doi : 10.1002/ lob.200413473 .
  19. ↑ Nadace Gordona a Betty Mooreových identifikuje 16 předních vědců, kteří se zabývají vysoce rizikovým výzkumem mořské mikrobiální ekologie .
  20. ↑ Mini mikrobi dělají velký šplouch - Dobré časy Santa Cruz . goodtimes.sc (13. února 2013).
  21. ↑ Hanse-Wissenschaftskolleg - Institut pro pokročilé studium: Home .
  22. ↑ Urban, Joanna 78 členů zvoleno do Americké akademie mikrobiologie . www.asm.org . Získáno 3. září 2016. Archivováno z originálu 11. září 2016.
  23. ↑ Alexandra Worden jmenovala Max Planck Fellow .
  24. ↑ Harvard Radcliffe Institute oznamuje 2021–2022 Fellows .
  25. ↑ "Alexandra Z. Worden": 252.v „Autobiografických náčrtech“ . oceánografie . 27 (4): 49-258. prosince 2014.
  26. ↑ JOHN EDMOND . web.mit.edu _
  27. ↑ Profesor Reginald Newell umírá ve věku 71 let; studovaný klimatický systém, znečištění ovzduší .
  28. ↑ Ahoj světe .
  29. ↑ Gill Pratt diskutuje o plánech Toyoty v oblasti umělé inteligence a budoucnosti robotů a automobilů . IEEE Spectrum: Technology, Engineering, and Science News (2015).
  30. ↑ Wald, Matthew L. . profil; V Quest for Electric Cars, On Added the Power of Faith  (6. března 1994).
  31. ↑ Solectria – dosahování cílů jejich snižováním . wordpress.com (28. července 2014).
  32. ↑ Solární auto vytvořilo světový rekord – The Tech . tech.mit.edu .
  33. ↑ Alexandra Worden a eukaryotní strom života . aaas.org (10. června 2016).
  34. ↑ Rodák z Arlingtonu jmenovaný členem Americké akademie mikrobiologie . arlington.wickedlocal.com .

Odkazy

  Přejděte na položku Wikidata  Tematické stránky