Histon deacetyláza 9

Identifikátory

HDAC9 ; HD7; HD7b; HD9; HDAC; HDAC7; HDAC7B; HDAC9B; HDAC9FL; HDRP; MITR

Externí ID

OMIM: 606543 MGI : 1931221 HomoloGene : 128578 IUPHAR : ChEMBL : 4145 GeneCards : HDAC9 Gene

3.5.1.98

Genová ontologie
Funkce	• transkripční korepresorová aktivita • aktivita histondeacetylázy • vazba na protein kinázu C • vazba na protein • vazba transkripčního faktoru • aktivita histondeacetylázy závislá na NAD (H3-K14 specifická) • aktivita deacetylázy proteinu • vazba histondeacetylázy • vazba na kovové ionty • aktivita histondeacetylázy závislá na NAD (H3 -K9 specifické) • NAD-dependentní histondeacetylázová aktivita (H4-K16 specifická) • potlačení vazby transkripčního faktoru • NAD-dependentní histondeacetylázová aktivita (H3-K18 specifická)
buněčná složka	• histondeacetylázový komplex • jádro • nukleoplazma • komplex transkripčních faktorů • cytoplazma • komplex histon metyltransferázy
biologický proces	• negativní regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II • transkripce podle templátu DNA • zánětlivá odpověď • signální dráha Notch • vývoj srdce • deacetylace histonů • diferenciace B buněk • buněčná odpověď na inzulinový stimul • deacetylace peptidyl-lysinu • aktivace B buněk • negativní regulace transkripce podle DNA • regulace vývoj vláken kosterního svalstva • regulace diferenciace příčně pruhovaných svalových buněk • deacetylace histonu H3 • deacetylace histonu H4 • pozitivní regulace buněčné migrace podílející se na angiogenezi klíčení
Zdroje: Amigo / QuickGO

ortology

Pohled

Člověk

Myš

Entrez

RefSeq (mRNA)

RefSeq (protein)

Locus (UCSC)

Chr 7:
18,13 – 19,04 Mb

Chr 12:
34,37 – 34,53 Mb

Hledejte v PubMed

[jeden]

[2]

Histon deacetyláza 9 ( Histone deacetyláza 9 ) je enzym kódovaný u lidí genem HDAC9 [1] [2] [3] .

Funkce

Histony hrají klíčovou roli v regulaci transkripce , buněčného cyklu a vývojových procesů. Acetylace/deacetylace histonů mění strukturu chromozomů a ovlivňuje přístup transkripčních faktorů k DNA . Protein kódovaný tímto genem sdílí sekvenční homologii se členy rodiny histonových deacetyláz . Tento gen je ortologní s myšími geny Xenopus a MITR. Protein MITR postrádá katalytickou doménu histondeacetylázy. Potlačuje aktivitu MEF2 prostřednictvím náboru vícesložkových korepresorových komplexů, které zahrnují CtBP a HDAC(y). Tento kódovaný protein může hrát roli v hematopoéze. Pro tento gen bylo popsáno několik alternativních sestřihových variant , ale některé z nich nebyly plně definovány [3] .

Interakce

Ukázalo se, že HDAC9 interaguje s:

CBX5 [4] ,
HDAC3 [5] [6] ,
MEF2A [7] [8] ,
NCOR1 [5] ,
SIN3A [9] [5] a
SUV39H1 [4] .

Viz také

Histonové deacetylázy

Poznámky

↑ Wang AH, Bertos NR, Vezmar M., Pelletier N., Crosato M., Heng HH, Th'ng J., Han J., Yang XJ HDAC4, lidská histonová deacetyláza příbuzná kvasinkám HDA1, je transkripční korepresor ( anglicky) // Mol Cell Biol : deník. - 1999. - Listopad ( roč. 19 , č. 11 ). - str. 7816-7827 . — PMID 10523670 .
↑ Sparrow DB, Miska EA, Langley E., Reynaud-Deonauth S., Kotecha S., Towers N., Spohr G., Kouzarides T., Mohun Funkce TJ MEF-2 je upravena novým korepresorem MITR ( anglicky) // EMBO J : deník. - 1999. - Listopad ( roč. 18 , č. 18 ). - S. 5085-5098 . doi : 10.1093 / emboj/18.18.5085 . — PMID 10487760 .
↑ 1 2 Entrez Gen: HDAC9 histon deacetyláza 9 . (neurčitý)
↑ 1 2 Zhang CL, McKinsey TA, Olson CS Asociace histonových deacetyláz třídy II s heterochromatinovým proteinem 1: potenciální úloha metylace histonů při kontrole svalové diferenciace // Mol . buňka. Biol. : deník. - 2002. - říjen ( roč. 22 , č. 20 ). - str. 7302-7312 . - doi : 10.1128/mcb.22.20.7302-7312.2002 . — PMID 12242305 .
↑ 1 2 3 Petrie K., Guidez F., Howell L., Healy L., Waxman S., Greaves M., Zelent A. Gen histon deacetylázy 9 kóduje více izoforem proteinu // J. Biol. Chem. : deník. - 2003. - Květen ( roč. 278 , č. 18 ). - S. 16059-16072 . - doi : 10.1074/jbc.M212935200 . — PMID 12590135 .
↑ Zhou X., Richon VM, Rifkind RA, Marks PA Identifikace transkripčního represoru souvisejícího s nekatalytickou doménou histonových deacetyláz 4 a 5 // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal . - 2000. - únor ( roč. 97 , č. 3 ). - S. 1056-1061 . - doi : 10.1073/pnas.97.3.1056 . — PMID 10655483 .
↑ Miska EA, Karlsson C., Langley E., Nielsen SJ, Pines J., Kouzarides T. HDAC4 deacetyláza asociuje a potlačuje transkripční faktor MEF2 // EMBO J. : deník. - 1999. - září ( roč. 18 , č. 18 ). - S. 5099-5107 . - doi : 10.1093/emboj/18.18.5099 . — PMID 10487761 .
↑ Lemercier C., Verdel A., Galloo B., Curtet S., Brocard MP, Khochbin S. mHDA1/HDAC5 histondeacetyláza interaguje s transkripční aktivitou MEF2A a potlačuje ji // J. Biol. Chem. : deník. - 2000. - Květen ( roč. 275 , č. 20 ). - S. 15594-15599 . - doi : 10.1074/jbc.M908437199 . — PMID 10748098 .
↑ Koipally J., Georgopoulos K. Interakce Ikaros-CtIP nevyžadují C-terminální vazebný protein a účastní se režimu represe nezávislého na deacetyláze // J. Biol. Chem. : deník. - 2002. - Červen ( roč. 277 , č. 26 ). - S. 23143-23149 . - doi : 10.1074/jbc.M202079200 . — PMID 11959865 .

Literatura

Marks PA, Richon VM, Rifkind RA Inhibitory histonové deacetylázy: induktory diferenciace nebo apoptózy transformovaných buněk. (anglicky) // J. Natl. Cancer Inst. : deník. - 2000. - Sv. 92 , č. 15 . - S. 1210-1216 . doi : 10.1093 / jnci/92.15.1210 . — PMID 10922406 .
Verdin E., Dequiedt F., Kasler HG Histon deacetylázy třídy II: všestranné regulátory. (anglicky) // Trends Genet. : deník. - 2003. - Sv. 19 , č. 5 . - str. 286-293 . - doi : 10.1016/S0168-9525(03)00073-8 . — PMID 12711221 .
Směrem k úplné sekvenci lidského genomu. (anglicky) // Genome Res. : deník. - 1999. - Sv. 8 , č. 11 . - S. 1097-1108 . - doi : 10.1101/gr.8.11.1097 . — PMID 9847074 .
Nagase T., Ishikawa K., Suyama M., Kikuno R., Miyajima N., Tanaka A., Kotani H., Nomura N., Ohara O. Predikce kódujících sekvencí neidentifikovaných lidských genů. XI. Kompletní sekvence 100 nových cDNA klonů z mozku, které kódují velké proteiny in vitro. (anglicky) // DNA Res. : deník. - 1999. - Sv. 5 , č. 5 . - str. 277-286 . - doi : 10.1093/dnares/5.5.277 . — PMID 9872452 .
Miska EA, Karlsson C., Langley E., Nielsen SJ, Pines J., Kouzarides T. HDAC4 deacetyláza asociuje a potlačuje transkripční faktor MEF2. (anglicky) // EMBO J. : deník. - 1999. - Sv. 18 , č. 18 . - S. 5099-5107 . - doi : 10.1093/emboj/18.18.5099 . — PMID 10487761 .
Zhou X., Richon VM, Rifkind RA, Marks PA Identifikace transkripčního represoru souvisejícího s nekatalytickou doménou histonových deacetyláz 4 a 5. // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal . - 2000. - Sv. 97 , č. 3 . - S. 1056-1061 . - doi : 10.1073/pnas.97.3.1056 . — PMID 10655483 .
Youn HD, Grozinger CM, Liu JO Vápník reguluje transkripční represi myocytového zesilovače faktoru 2 histondeacetylázou 4. // J. Biol. Chem. : deník. - 2000. - Sv. 275 , č.p. 29 . - S. 22563-22567 . - doi : 10.1074/jbc.C000304200 . — PMID 10825153 .
Zhang CL, McKinsey TA, Lu JR, Olson EN Asociace COOH-terminálního vazebného proteinu (CtBP) a MEF2-interagujícího transkripčního represoru (MITR) přispívá k transkripční represi transkripčního faktoru MEF2. (anglicky) // J. Biol. Chem. : deník. - 2001. - Sv. 276 , č.p. 1 . - S. 35-9 . - doi : 10.1074/jbc.M007364200 . — PMID 11022042 .
Fischle W., Dequiedt F., Fillion M., Hendzel MJ, Voelter W., Verdin E. Aktivita lidské HDAC7 histon deacetylázy je spojena s HDAC3 in vivo. (anglicky) // J. Biol. Chem. : deník. - 2001. - Sv. 276 , č.p. 38 . - S. 35826-35835 . - doi : 10.1074/jbc.M104935200 . — PMID 11466315 .
Zhou X., Marks PA, Rifkind RA, Richon VM Klonování a charakterizace histondeacetylázy, HDAC9. (anglicky) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. - 2001. - Sv. 98 , č. 19 . - S. 10572-10577 . - doi : 10.1073/pnas.191375098 . — PMID 11535832 .
Koipally J., Georgopoulos K. Interakce Ikaros-CtIP nevyžadují C-terminální vazebný protein a účastní se režimu represe nezávislého na deacetyláze. (anglicky) // J. Biol. Chem. : deník. - 2002. - Sv. 277 , č.p. 26 . - S. 23143-23149 . - doi : 10.1074/jbc.M202079200 . — PMID 11959865 .
Kirsh O., Seeler JS, Pichler A., Gast A., Müller S., Miska E., Mathieu M., Harel-Bellan A., Kouzarides T., Melchior F., Dejean A. Ligáza SUMO E3 RanBP2 podporuje modifikaci HDAC4 deacetylázy. (anglicky) // EMBO J. : deník. - 2002. - Sv. 21 , č. 11 . - S. 2682-2691 . - doi : 10.1093/emboj/21.11.2682 . — PMID 12032081 .
Mahlknecht U., Schnittger S., Will J., Cicek N., Hoelzer D. Chromozomální organizace a lokalizace genu lidské histondeacetylázy 9 (HDAC9). (anglicky) // Biochem. Biophys. Res. komunální. : deník. - 2002. - Sv. 293 , č.p. 1 . - S. 182-191 . - doi : 10.1016/S0006-291X(02)00193-6 . — PMID 12054582 .
Zhang CL, McKinsey TA, Olson EN Asociace histonových deacetyláz třídy II s heterochromatinovým proteinem 1: potenciální úloha metylace histonů při kontrole svalové diferenciace. (anglicky) // Mol. buňka. Biol. : deník. - 2002. - Sv. 22 , č. 20 . - str. 7302-7312 . - doi : 10.1128/MCB.22.20.7302-7312.2002 . — PMID 12242305 .
Hoogeveen AT, Rossetti S., Stoyanova V., Schonkeren J., Fenaroli A., Schiaffonati L., van Unen L., Sacchi N. Transkripční korepresor MTG16a obsahuje novou nukleolární zaměřovací sekvenci narušenou v t (16; 21)- pozitivní myeloidní malignity. (anglicky) // Oncogene : deník. - 2002. - Sv. 21 , č. 43 . - S. 6703-6712 . - doi : 10.1038/sj.onc.1205882 . — PMID 12242670 .
Petrie K., Guidez F., Howell L., Healy L., Waxman S., Greaves M., Zelent A. Gen histon deacetylázy 9 kóduje více izoforem proteinu. (anglicky) // J. Biol. Chem. : deník. - 2003. - Sv. 278 , č.p. 18 . - S. 16059-16072 . - doi : 10.1074/jbc.M212935200 . — PMID 12590135 .

Odkazy

MeSH HDAC9+protein,+člověk