HMG20B

Skupina vysoké mobility 20B

PNR je založen na 2crj.

Dostupné struktury

Ortologické vyhledávání: PDBe , RCSB

Seznam PDB ID
2crj

Identifikátory

Symbol

HMG20B ; BRAF25; BRAF35; HMGX2; HMGXB2; PP7706; SMARCE1r; SOXL; pp8857

Externí ID

OMIM: 605535 MGI : 1341190 HomoloGene : 74949 GeneCards : HMG20B Gene

Genová ontologie
Funkce	• Vazba na DNA • vazba na bílkoviny • proteinová heterodimerizační aktivita
buněčná složka	• jádro • nukleoplazma • chromozom • jadérko
biologický proces	• transkripce podle templátu DNA • regulace transkripce podle DNA • buněčný cyklus • koagulace krve • modifikace chromatinu • negativní regulace sumoylace proteinů • diferenciace buněk kosterního svalstva • pozitivní regulace diferenciace neuronů
Zdroje: Amigo / QuickGO

Profil exprese RNA

Více informací

ortology

Pohled

Člověk

Myš

Entrez

RefSeq (mRNA)

RefSeq (protein)

Locus (UCSC)

Chr 19:
3,57 – 3,58 Mb

Chr 10:
81,35 – 81,35 Mb

Hledejte v PubMed

[jeden]

[2]

SWI/SNF-asociovaný, templát-asociovaný aktin-dependentní regulátor chromatinu, 1-dependentní člen podrodiny E , je protein kódovaný u lidí genem HMG20B [1] [2] .

Interakce

Bylo prokázáno, že HMG20B interaguje s KIF4A [3] , HDAC1 [4] , histondeacetylázou 2 [4] [5] , PHF21A [4] [6] , RCOR1 [4] a BRCA2 [4] [7] .

Poznámky

↑ Sumoy L., Carim L., Escarceller M., Nadal M., Gratacos M., Pujana MA, Estivil X., Peral B. HMG20A a HMG20B mapují lidské chromozomy 15q24 a 19p13.3 a tvoří samostatnou třídu HMG -box geny s všudypřítomnou expresí // Cytogenetika a výzkum genomu : deník. - 2000. - Červen ( roč. 88 , č. 1-2 ). - str. 62-7 . - doi : 10.1159/000015486 . — PMID 10773667 .
↑ Entrez Gene: HMG20B skupina s vysokou mobilitou 20B . Archivováno z originálu 5. prosince 2010. (neurčitý)
↑ Lee, Young Mi; Kim Wankee. Asociace lidského proteinu nadrodiny kinesinu 4 s faktorem 35 spojeným s BRCA2 // Biochemical Journal : deník. — Anglie, 2003. — Září ( sv. 374 , č. Pt 2 ). - str. 497-503 . - doi : 10.1042/BJ20030452 . — PMID 12809554 .
↑ 1 2 3 4 5 Hakimi, Mohamed-Ali; Bochar Daniel A; Chenoweth Josh; Lane William S; Mandel Gail; Shiekhattar Ramin. Komplex jádro-BRAF35 obsahující histondeacetylázu zprostředkovává represi neuronově specifických genů (anglicky) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. - Spojené státy americké, 2002. - Květen ( sv. 99 , č. 11 ). - str. 7420-7425 . — ISSN 0027-8424 . - doi : 10.1073/pnas.112008599 . — PMID 12032298 .
↑ Hakimi, Mohamed-Ali; Dong Yuanshu; Lane William S; Speicher David W; Shiekhattar Ramin. Kandidátní gen mentální retardace vázaný na X je součástí nové rodiny komplexů obsahujících histondeacetylázu (anglicky) // Journal of Biological Chemistry : journal. - Spojené státy americké, 2003. - Únor ( sv. 278 , č. 9 ). - str. 7234-7239 . — ISSN 0021-9258 . - doi : 10.1074/jbc.M208992200 . — PMID 12493763 .
↑ Iwase, Shigeki; Januma Aya; Mijamoto Kijoko; Shono Naomi Honda Arata; Yanagisawa Junn; Baba Tadashi. Charakterizace BHC80 v komplexu BRAF-HDAC, který se účastní neuronově specifické genové represe // Biochemical and Biophysical Research Communications : deník. - Spojené státy americké, 2004. - Září ( vol. 322 , č. 2 ). - S. 601-608 . — ISSN 0006-291X . - doi : 10.1016/j.bbrc.2004.07.163 . — PMID 15325272 .
↑ Marmorstein, LY; Kinev A.V.; Chan GK; Bochar D.A.; Beniya H; Epstein JA; Yen TJ; Shiekhattar R. Lidský komplex BRCA2 obsahující strukturní složku vázající DNA ovlivňuje průběh buněčného cyklu // Cell : journal. - United States: Cell Press , 2001. - Leden ( vol. 104 , č. 2 ). - str. 247-257 . — ISSN 0092-8674 . - doi : 10.1016/S0092-8674(01)00209-4 . — PMID 11207365 .

Literatura

Wattler F., Wattler S., Kelly M. a kol. Klonování, chromozomální umístění a analýza exprese myších příbuzných Smarce1, nového člena vysoce pohyblivé skupiny genů skupiny 365 // Genomics: journal. - 1999. - Sv. 60 , č. 2 . - S. 172-178 . - doi : 10.1006/geno.1999.5913 . — PMID 10486208 .
Marmorstein LY, Kinev AV, Chan GK a kol. Lidský komplex BRCA2 obsahující strukturní složku vázající DNA ovlivňuje průběh buněčného cyklu // Cell : journal. - Cell Press , 2001. - Vol. 104 , č. 2 . - str. 247-257 . - doi : 10.1016/S0092-8674(01)00209-4 . — PMID 11207365 .
Lee YM, Shin H., Choi W., a kol. Charakterizace lidského proteinu SMARCE1r s vysokou pohyblivostí (anglicky) // Biochimica et Biophysica Acta : deník. - 2002. - Sv. 1574 , č.p. 3 . - str. 269-276 . - doi : 10.1016/s0167-4781(01)00373-6 . — PMID 11997092 .
Hakimi MA, Bochar DA, Chenoweth J. a kol. Komplex jádro-BRAF35 obsahující histondeacetylázu zprostředkovává represi neuronově specifických genů (anglicky) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. - 2002. - Sv. 99 , č. 11 . - str. 7420-7425 . - doi : 10.1073/pnas.112008599 . — PMID 12032298 .
Wang C., McCarty IM, Balazs L. a kol. Klonování cDNA kódující alternativně sestřižený protein faktoru 35 asociovaného s BRCA2 // Biochemical and Biophysical Research Communications : deník. - 2002. - Sv. 295 , č.p. 1 . - S. 129-135 . - doi : 10.1016/S0006-291X(02)00624-1 . — PMID 12083779 .
Wang C., McCarty IM, Balazs L. a kol. Imunohistologická detekce BRAF25 ve vzorcích lidského nádoru prostaty a rakoviny // Biochemical and Biophysical Research Communications : deník. - 2002. - Sv. 295 , č.p. 1 . - S. 136-141 . - doi : 10.1016/S0006-291X(02)00625-3 . — PMID 12083780 .
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších sekvencí cDNA v plné délce // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal . - 2003. - Sv. 99 , č. 26 . - S. 16899-16903 . - doi : 10.1073/pnas.242603899 . — PMID 12477932 .
Hakimi MA, Dong Y., Lane WS, a kol. Kandidátní gen mentální retardace vázaný na X je součástí nové rodiny komplexů obsahujících histondeacetylázu (anglicky) // Journal of Biological Chemistry : journal. - 2003. - Sv. 278 , č.p. 9 . - str. 7234-7239 . - doi : 10.1074/jbc.M208992200 . — PMID 12493763 .
Lee YM, Kim W. Asociace lidského proteinu nadrodiny kinesinu 4 s faktorem 35 spojeným s BRCA2 // Biochemical Journal : deník. - 2003. - Sv. 374 , č.p. Pt 2 . - str. 497-503 . - doi : 10.1042/BJ20030452 . — PMID 12809554 .
Ota T., Suzuki Y., Nishikawa T. a kol. Kompletní sekvenování a charakterizace 21 243 lidských cDNA plné délky // Nature Genetics : časopis . - 2004. - Sv. 36 , č. 1 . - str. 40-5 . - doi : 10.1038/ng1285 . — PMID 14702039 .
Grimwood J., Gordon LA, Olsen A. a kol. Sekvence DNA a biologie lidského chromozomu 19 (anglicky) // Nature : journal. - 2004. - Sv. 428 , č.p. 6982 . - str. 529-535 . - doi : 10.1038/nature02399 . — PMID 15057824 .
Iwase S., Januma A., Miyamoto K., et al. Charakterizace BHC80 v komplexu BRAF-HDAC, který se účastní neuronově specifické genové represe // Biochemical and Biophysical Research Communications : deník. - 2004. - Sv. 322 , č.p. 2 . - S. 601-608 . - doi : 10.1016/j.bbrc.2004.07.163 . — PMID 15325272 .
Gerhard DS, Wagner L., Feingold EA a kol. Stav, kvalita a rozšíření projektu NIH plné délky cDNA: sbírka savčích genů (MGC ) // Genome Research : deník. - 2004. - Sv. 14 , č. 10B . - S. 2121-2127 . - doi : 10.1101/gr.2596504 . — PMID 15489334 .
Rual JF, Venkatesan K., Hao T. a kol. Směrem k proteomové mapě interakční sítě mezi lidskými proteiny a proteiny (anglicky) // Nature : journal. - 2005. - Sv. 437 , č.p. 7062 . - S. 1173-1178 . - doi : 10.1038/nature04209 . — PMID 16189514 .