RCOR1
Korepresor REST 1 |
---|
PDB je jako příklad reprezentován 2iw5. |
PNR |
Ortologické vyhledávání: PDBe , RCSB
|
2IW5 , 2UXN , 2UXX , 2V1D , 2X0L , 2XAF , 2XAG , 2XAH , 2XAJ , 2XAQ , 2XAS , 2Y48 , 3ZMS , 3ZNZMZMT , 3MZZMZMU , 3MZZMZMU , 3MZZMZ4 , 3 _ _ _ _ _ _ |
|
|
|
Symbol | RCOR1 ; COREST; RCOR |
---|
Externí ID | OMIM: 607675 MGI : 106340 HomoloGene : 32246 GeneCards : RCOR1 Gene |
---|
|
|
Pohled | Člověk | Myš | |
---|
Entrez | 23186 | 217864 | |
---|
Soubor | ENSG00000089902 | ENSMUSG00000037896 | |
---|
UniProt | Q9UKL0 | Q8CFE3 | |
---|
RefSeq (mRNA) | NM_015156 | NM_198023 | |
---|
RefSeq (protein) | NP_055971 | NP_932140 | |
---|
Locus (UCSC) | Chr 14: 103,06 – 103,2 Mb | Chr 12: 111,04 – 111,12 Mb | |
---|
Hledejte v PubMed | [jeden] | [2] | |
Korepresor REST 1 , také známý jako CoREST , je protein kódovaný u lidí genem RCOR1 . [1] [2]
Funkce
Tento gen kóduje protein , který je dobře konzervovaný, potlačený při narození a se specifickou úlohou při určování neuronální diferenciace. Kódovaný protein se váže na C-terminální doménu REST ( represor element-1 silencing transcription factor ). [ 2]
Interakce
Ukázalo se, že RCOR1 interaguje s:
Poznámky
- ↑ Andrés ME, Burger C., Peral-Rubio MJ, Battaglioli E., Anderson ME, Grimes J., Dallman J., Ballas N., Mandel G. CoREST: funkční korepresor potřebný pro regulaci neurální specifické genové exprese ( English) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. - 1999. - září ( roč. 96 , č. 17 ). - S. 9873-9878 . - doi : 10.1073/pnas.96.17.9873 . — PMID 10449787 .
- ↑ 1 2 Entrez Gene: Corepressor RCOR1 REST 1 . Archivováno z originálu 5. prosince 2010. (neurčitý)
- ↑ 1 2 3 4 Hakimi MA, Bochar DA, Chenoweth J., Lane WS, Mandel G., Shiekhattar R. Komplex core-BRAF35 obsahující histon deacetylázu zprostředkovává represi neuronově specifických genů (anglicky) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. - 2002. - Květen ( roč. 99 , č. 11 ). - str. 7420-7425 . - doi : 10.1073/pnas.112008599 . — PMID 12032298 .
- ↑ 1 2 You A., Tong JK, Grozinger CM, Schreiber SL CoREST je nedílnou součástí komplexu CoREST-lidská histondeacetyláza // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal . - 2001. - únor ( roč. 98 , č. 4 ). - S. 1454-1458 . - doi : 10.1073/pnas.98.4.1454 . — PMID 11171972 .
- ↑ Andrés ME, Burger C., Peral-Rubio MJ, Battaglioli E., Anderson ME, Grimes J., Dallman J., Ballas N., Mandel G. CoREST: funkční korepresor potřebný pro regulaci neurální specifické genové exprese ( English) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. - 1999. - Srpen ( roč. 96 , č. 17 ). - S. 9873-9878 . - doi : 10.1073/pnas.96.17.9873 . — PMID 10449787 .
- ↑ Iwase S., Januma A., Miyamoto K., Shono N., Honda A., Yanagisawa J., Baba T. Charakterizace BHC80 v komplexu BRAF-HDAC, zapojený do neuronové specifické genové represe // Biochemický a biofyzikální výzkum komunikace : deník. - 2004. - září ( roč. 322 , č. 2 ). - S. 601-608 . - doi : 10.1016/j.bbrc.2004.07.163 . — PMID 15325272 .
Literatura
- Nomura N., Nagase T., Miyajima N., Sazuka T., Tanaka A., Sato S., Seki N., Kawarabayasi Y., Ishikawa K., Tabata S. Predikce kódujících sekvencí neidentifikovaných lidských genů. II. Kódující sekvence 40 nových genů ( KIAA0041 -KIAA0080) odvozené analýzou cDNA klonů z lidské buněčné linie KG-1 // Výzkum DNA : deník. - 1994. - Sv. 1 , ne. 5 . - str. 223-229 . - doi : 10.1093/dnares/1.5.223 . — PMID 7584044 .
- Andersson B., Wentland MA, Ricafrente JY, Liu W., Gibbs RA Metoda „dvojitého adaptéru“ pro vylepšenou konstrukci knihovny brokovnic // Analytical Biochemistry : deník. - 1996. - Sv. 236 , č.p. 1 . - str. 107-113 . - doi : 10.1006/abio.1996.0138 . — PMID 8619474 .
- Yu W., Andersson B., Worley KC, Muzny DM, Ding Y., Liu W., Ricafrente JY, Wentland MA, Lennon G., Gibbs RA Velké zřetězení cDNA sekvenování // Genome Research : deník. - 1997. - Sv. 7 , č. 4 . - str. 353-358 . - doi : 10.1101/gr.7.4.353 . — PMID 9110174 .
- Grimes JA, Nielsen SJ, Battaglioli E., Miska EA, Speh JC, Berry DL, Atouf F., Holdener BC, Mandel G., Kouzarides T. Korepresor mSin3A je funkční složkou komplexu represorů REST-CoREST ( English) // Journal of Biological Chemistry : journal. - 2000. - Sv. 275 , č.p. 13 . - S. 9461-9467 . doi : 10.1074 / jbc.275.13.9461 . — PMID 10734093 .
- Hartley JL, Temple GF, Brasch MA DNA klonování pomocí in vitro místně specifické rekombinace // Genome Research : deník. - 2000. - Sv. 10 , č. 11 . - S. 1788-1795 . - doi : 10.1101/gr.143000 . — PMID 11076863 .
- Humphrey GW, Wang Y., Russanova VR, Hirai T., Qin J., Nakatani Y., Howard BH Stabilní histondeacetylázové komplexy vyznačující se přítomností proteinů domény SANT CoREST/kiaa0071 a Mta-L1 (anglicky) // Journal of Biologická chemie : časopis. - 2001. - Sv. 276 , č.p. 9 . - str. 6817-6824 . - doi : 10.1074/jbc.M007372200 . — PMID 11102443 .
- You A., Tong JK, Grozinger CM, Schreiber SL CoREST je nedílnou součástí komplexu CoREST-human histone deacetylase complex (anglicky) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. - 2001. - Sv. 98 , č. 4 . - S. 1454-1458 . - doi : 10.1073/pnas.98.4.1454 . — PMID 11171972 .
- Ballas N., Battaglioli E., Atouf F., Andres ME, Chenoweth J., Anderson ME, Burger C., Moniwa M., Davie JR, Bowers WJ, Federoff HJ, Rose DW, Rosenfeld MG, Brehm P., Mandel G. Regulace neuronálních vlastností novým transkripčním komplexem // Neuron : deník. - Cell Press , 2001. - Vol. 31 , č. 3 . - S. 353-365 . - doi : 10.1016/S0896-6273(01)00371-3 . — PMID 11516394 .
- Hakimi MA, Bochar DA, Chenoweth J., Lane WS, Mandel G., Shiekhattar R. Komplex core-BRAF35 obsahující histondeacetylázu zprostředkovává represi neuronově specifických genů (anglicky) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United Státy americké : časopis. - 2002. - Sv. 99 , č. 11 . - str. 7420-7425 . - doi : 10.1073/pnas.112008599 . — PMID 12032298 .
- Battaglioli E., Andrés ME, Rose DW, Chenoweth JG, Rosenfeld MG, Anderson ME, Mandel G. REST represe neuronálních genů vyžaduje komponenty komplexu hSWI.SNF // Journal of Biological Chemistry : journal. - 2002. - Sv. 277 , č.p. 43 . - S. 41038-41045 . - doi : 10.1074/jbc.M205691200 . — PMID 12192000 .
- Lunyak VV, Burgess R., Prefontaine GG, Nelson C., Sze SH, Chenoweth J., Schwartz P., Pevzner PA, Glass C., Mandel G., Rosenfeld MG Corepressor-dependent umlčování chromozomálních oblastí kódujících neuronové geny .) // Věda: časopis. - 2002. - Sv. 298 , č.p. 5599 . - S. 1747-1752 . - doi : 10.1126/science.1076469 . — PMID 12399542 .
- Hakimi MA, Dong Y., Lane WS, Speicher DW, Shiekhattar R. Kandidátní gen mentální retardace vázaný na X je součástí nové rodiny komplexů obsahujících histondeacetylázu (anglicky) // Journal of Biological Chemistry : journal. - 2003. - Sv. 278 , č.p. 9 . - str. 7234-7239 . - doi : 10.1074/jbc.M208992200 . — PMID 12493763 .
- Iwase S., Januma A., Miyamoto K., Shono N., Honda A., Yanagisawa J., Baba T. Charakterizace BHC80 v komplexu BRAF-HDAC, zapojený do neuronové specifické genové represe (anglicky) // Biochemical and Biofyzikální výzkum komunikace : deník. - 2004. - Sv. 322 , č.p. 2 . - S. 601-608 . - doi : 10.1016/j.bbrc.2004.07.163 . — PMID 15325272 .
- Gu H., Liang Y., Mandel G., Roizman B. Komponenty komplexu REST/CoREST/histonedeacetylázový represor jsou narušeny, modifikovány a translokovány v buňkách infikovaných HSV-1 (anglicky) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. - 2005. - Sv. 102 , č. 21 . - str. 7571-7576 . - doi : 10.1073/pnas.0502658102 . — PMID 15897453 .
- Lee MG, Wynder C., Cooch N., Shiekhattar R. Zásadní role pro CoREST při demetylaci nukleozomálního histonu 3 lysinu 4 // Nature: journal. - 2005. - Sv. 437 , č.p. 7057 . - str. 432-435 . - doi : 10.1038/nature04021 . — PMID 16079794 .
- Shi YJ, Matson C., Lan F., Iwase S., Baba T., Shi Y. Regulace aktivity histondemethylázy LSD1 jejími přidruženými faktory // Molecular Cell : deník. - 2005. - Sv. 19 , č. 6 . - S. 857-864 . - doi : 10.1016/j.molcel.2005.08.027 . — PMID 16140033 .
- Nousiainen M., Silljé HH, Sauer G., Nigg EA, Körner R. Fosfoproteomová analýza lidského mitotického vřeténka (anglicky) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. - 2006. - Sv. 103 , č. 14 . - str. 5391-5396 . - doi : 10.1073/pnas.0507066103 . — PMID 16565220 .