Ku

Ku  je protein , který se váže na dvouvláknové zlomy ve struktuře DNA . Ku je nutný pro opravu DNA cestou nehomologického spojování konců (NHEJ). Ku je evolučně konzervativní od bakterií k lidem. Starověký bakteriální Ku je homodimer, [2] eukaryotický homolog Ku je heterodimer skládající se ze dvou polypeptidů Ku70 (produkt genu XRCC6) a Ku80 (kódovaný genem XRCC5), molekulová hmotnost těchto polypeptidů je 70 a 80 kDa , v daném pořadí. Ku podjednotky tvoří košíkovitou strukturu připojenou ke konci molekuly DNA. [3]Po navázání může Ku klouzat po řetězci DNA, na jehož konci mohou být navlečeny nové molekuly Ku. U vyšších eukaryot tvoří Ku komplex s katalytickou podjednotkou DNA-dependentní proteinkinázy ( DNA-PKcs) a tvoří kompletní DNA-dependentní proteinkinázu, DNA-PK. [4] Zdá se, že Ku funguje jako molekulární páteř , ke které se připojují další proteiny zapojené do procesu NHEJ.

Obě Ku podjednotky byly experimentálně odstraněny z myšího genomu. Tyto myši měly různé chromozomální přeuspořádání , což ukazuje na potřebu NHEJ k udržení integrity genomu . [5] [6]

V mnoha organismech má Ku další funkce udržování telomerové struktury . [7]

Zdá se, že hojnost Ku80 ovlivňuje životnost organismů. [osm]

Poznámky

1. ↑ PDB 1JEY ; Walker JR, Corpina RA, Goldberg J. Struktura heterodimeru Ku vázaného na DNA a její důsledky pro opravu dvouřetězcových zlomů  //  Nature : journal. - 2001. - srpen ( roč. 412 , č. 6847 ). - S. 607-614 . - doi : 10.1038/35088000 . — PMID 11493912 .
2. ↑ Doherty AJ, Jackson SP, Weller GR Identifikace bakteriálních homologů opravných proteinů Ku DNA  //  FEBS Letters : deník. - 2001. - Červenec ( roč. 500 , č. 3 ). - S. 186-188 . - doi : 10.1016/S0014-5793(01)02589-3 . — PMID 11445083 .
3. ↑ Walker JR, Corpina RA, Goldberg J. Struktura heterodimeru Ku vázaného na DNA a její důsledky pro opravu dvouřetězcových zlomů  //  Nature : journal. - 2001. - srpen ( roč. 412 , č. 6847 ). - S. 607-614 . - doi : 10.1038/35088000 . — PMID 11493912 .
4. ↑ Carter T., Vancurová I., Sun I., Lou W., DeLeon S. A DNA-activated protein kinase from HeLa cell nuclei  //  Molecular and Cellular Biology : deník. - 1990. - prosinec ( roč. 10 , č. 12 ). - S. 6460-6471 . — PMID 2247066 .
5. ↑ Difilippantonio MJ, Zhu J., Chen HT, Meffre E., Nussenzweig MC, Max EE, Ried T., Nussenzweig A. DNA repair protein Ku80 potlačuje chromozomální aberace a maligní transformaci  //  Nature : journal. - 2000. - březen ( roč. 404 , č. 6777 ). - str. 510-514 . - doi : 10.1038/35006670 . — PMID 10761921 .
6. ↑ Ferguson DO, Sekiguchi JM, Chang S., Frank KM, Gao Y., DePinho RA, Alt FW Pro genomickou stabilitu a potlačení translokací je vyžadována nehomologní end-joining cesta opravy DNA   // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America  : journal. - 2000. - Červen ( roč. 97 , č. 12 ). - str. 6630-6633 . - doi : 10.1073/pnas.110152897 . — PMID 10823907 .
7. ↑ Boulton SJ, Jackson SP Komponenty nehomologické dráhy spojování konců závislé na Ku se podílejí na udržování telomerické délky a umlčování telomer  //  The EMBO Journal : deník. - 1998. - březen ( roč. 17 , č. 6 ). - S. 1819-1828 . - doi : 10.1093/emboj/17.6.1819 . — PMID 9501103 .
8. ↑ Lorenzini A., Johnson FB, Oliver A., ​​​​Tresini M., Smith JS, Hdeib M., Sell C., Cristofalo VJ, Stamato TD Významná korelace délky života druhů s rozpoznáním dvouřetězcových zlomů DNA, ale ne s délkou telomer  .)  // Mech Aging Dev. : deník. - 2009. - Listopad-Prosinec ( roč. 130 , č. 11-12 ). - str. 784-792 . - doi : 10.1016/j.mad.2009.10.004 . — PMID 19896964 .