MBD2

Methyl-CpG-vazebná doména proteinu 2  je protein kódovaný u lidí genem MBD2 [1] [2] .

Funkce

Methylace DNA je hlavním typem modifikace eukaryotických genomů a hraje důležitou roli ve vývoji savců. Lidské proteiny MECP2, MBD1, MBD2, MBD3 a MBD4 jsou rodinou jaderných proteinů seskupených dohromady na základě přítomnosti vazebné domény methyl CpG (MBD) v každém z nich. Každý z těchto proteinů, s výjimkou MBD3, je schopen se specificky vázat na methylovanou DNA . MECP2, MBD1 a MBD2 mohou také potlačit transkripci z methylovaných promotorů . Protein kódovaný tímto genem může hrát zprostředkující roli v biologické odpovědi na methylační signál. Bylo také popsáno, že tento protein funguje jako demetyláza aktivující transkripci, protože methylace v promotorových oblastech DNA způsobuje umlčení genu [3] .

Interakce

Bylo zjištěno, že MBD2 interaguje s:

• GATAD2B [4] [5] ,
• HDAC1 [4] [6] [7] ,
• Histondeacetyláza 2 [4] [6] [7] ,
• MBD3 [7] [8]
• MIZF , [9] a
• SIN3A [10] .

Poznámky

1. ↑ Hendrich B., Bird A. Identifikace a charakterizace rodiny savčích methyl-CpG vazebných proteinů  //  Mol Cell Biol : deník. - 1998. - Listopad ( roč. 18 , č. 11 ). - S. 6538-6547 . — PMID 9774669 .
2. ↑ Hendrich B., Abbott C., McQueen H., Chambers D., Cross S., Bird A. Genomová struktura a chromozomální mapování myších a lidských genů Mbd1, Mbd2,  Mbd3 a Mbd4  // Mamm Genom : deník. - 1999. - září ( roč. 10 , č. 9 ). - S. 906-912 . - doi : 10.1007/s003359901112 . — PMID 10441743 .
3. ↑ Entrez Gen: MBD2 methyl-CpG vazebný doménový protein 2 . (neurčitý)
4. ↑ 1 2 3 Brackertz M., Boeke J., Zhang R., Renkawitz R. Dva vysoce příbuzné proteiny p66 tvoří novou rodinu účinných transkripčních represorů interagujících s MBD2 a MBD3  //  J. Biol. Chem.  : deník. - 2002. - říjen ( roč. 277 , č. 43 ). - S. 40958-40966 . - doi : 10.1074/jbc.M207467200 . — PMID 12183469 .
5. ↑ Feng Q., Cao R., Xia L., Erdjument-Bromage H., Tempst P., Zhang Y. Identifikace a funkční charakterizace složek p66/p68 komplexu MeCP1   // Mol . buňka. Biol. : deník. - 2002. - Leden ( roč. 22 , č. 2 ). - str. 536-546 . - doi : 10.1128/mcb.22.2.536-546.2002 . — PMID 11756549 .
6. ↑ 1 2 Ng HH, Zhang Y., Hendrich B., Johnson CA, Turner BM, Erdjument-Bromage H., Tempst P., Reinberg D., Bird A. MBD2 je transkripční represor patřící do komplexu histon deacetylázy MeCP1  ( anglicky)  // Nat. Genet.  : deník. - 1999. - září ( roč. 23 , č. 1 ). - str. 58-61 . - doi : 10.1038/12659 . — PMID 10471499 .
7. ↑ 1 2 3 Zhang Y., Ng HH, Erdjument-Bromage H., Tempst P., Bird A., Reinberg D. Analýza podjednotek NuRD odhaluje komplex jádra histon deacetylázy  a /spojení s metylací DNA  Genes Dev.  : deník. - 1999. - Srpen ( roč. 13 , č. 15 ). - S. 1924-1935 . - doi : 10.1101/gad.13.15.1924 . — PMID 10444591 .
8. ↑ Jiang CL, Jin SG, Pfeifer GP MBD3L1 je transkripční represor, který interaguje s methyl-CpG-vazebným proteinem 2 (MBD2) a složkami komplexu NuRD  //  J. Biol. Chem.  : deník. - 2004. - prosinec ( roč. 279 , č. 50 ). - S. 52456-52464 . - doi : 10.1074/jbc.M409149200 . — PMID 15456747 .
9. ↑ Sekimata M., Takahashi A., Murakami-Sekimata A., Homma Y. Zapojení nového proteinu se zinkovým prstem, MIZF, do transkripční represe interakcí s proteinem vázajícím methyl-CpG,   MBD2 // J Biol. Chem.  : deník. - 2001. - Listopad ( roč. 276 , č. 46 ). - S. 42632-42638 . - doi : 10.1074/jbc.M107048200 . — PMID 11553631 .
10. ↑ Boeke J., Ammerpohl O., Kegel S., Moehren U., Renkawitz R. Minimální represní doména MBD2b se překrývá s methyl-CpG-vazebnou doménou a váže se přímo na Sin3A  //  J. Biol. Chem.  : deník. - 2000. - Listopad ( roč. 275 , č. 45 ). - S. 34963-34967 . - doi : 10.1074/jbc.M005929200 . — PMID 10950960 .

Literatura

• Scanlan MJ, Chen YT, Williamson B., Gure AO, Stockert E., Gordan JD, Türeci O., Sahin U., Pfreundschuh M., Old LJ Charakterizace lidských antigenů rakoviny tlustého střeva rozpoznávaných autologními  protilátkami  // Int. J. Cancer : deník. - 1998. - Sv. 76 , č. 5 . - S. 652-658 . - doi : 10.1002/(SICI)1097-0215(19980529)76:5<652::AID-IJC7>3.0.CO;2-P . — PMID 9610721 .
• Zhang Y., LeRoy G., Seelig HP, Lane WS, Reinberg D. Autoantigen Mi2 specifický pro dermatomyozitidu je složkou komplexu obsahujícího aktivity histonové deacetylázy a remodelace nukleozomů  (anglicky)  // Cell  : journal. - Cell Press , 1998. - Sv. 95 , č. 2 . - str. 279-289 . - doi : 10.1016/S0092-8674(00)81758-4 . — PMID 9790534 .
• Tong JK, Hassig CA, Schnitzler GR, Kingston RE, Schreiber SL Deacetylace chromatinu komplexem remodelace nukleozomů závislým na ATP  //  Nature: journal. - 1998. - Sv. 395 , č.p. 6705 . - S. 917-921 . - doi : 10.1038/27699 . — PMID 9804427 .
• Bhattacharya SK, Ramchandani S., Cervoni N., Szyf M. Savčí protein se specifickou demethylázovou aktivitou pro mCpG DNA  //  Nature : journal. - 1999. - Sv. 397 , č.p. 6720 . - str. 579-583 . - doi : 10.1038/17533 . — PMID 10050851 .
• Zhang Y., Ng HH, Erdjument-Bromage H., Tempst P., Bird A., Reinberg D. Analýza podjednotek NuRD odhaluje komplex jádra histon deacetylázy a spojení s metylací DNA  (anglicky)  // Genes Dev.  : deník. - 1999. - Sv. 13 , č. 15 . - S. 1924-1935 . - doi : 10.1101/gad.13.15.1924 . — PMID 10444591 .
• Ng HH, Zhang Y., Hendrich B., Johnson CA, Turner BM, Erdjument-Bromage H., Tempst P., Reinberg D., Bird A. MBD2 je transkripční represor patřící do komplexu histon deacetylázy MeCP1   // Nat. Genet.  : deník. - 1999. - Sv. 23 , č. 1 . - str. 58-61 . - doi : 10.1038/12659 . — PMID 10471499 .
• Tatematsu KI, Yamazaki T., Ishikawa F. Komplex MBD2-MBD3 se váže na hemimethylovanou DNA a tvoří komplex obsahující DNMT1 v replikačních ohniscích v pozdní S fázi  (anglicky)  // Genes Cells : deník. - 2000. - Sv. 5 , č. 8 . - str. 677-688 . - doi : 10.1046/j.1365-2443.2000.00359.x . — PMID 10947852 .
• Boeke J., Ammerpohl O., Kegel S., Moehren U., Renkawitz R. Minimální represní doména MBD2b se překrývá s methyl-CpG-vazebnou doménou a váže se přímo na Sin3A  (anglicky)  // J. Biol. Chem.  : deník. - 2001. - Sv. 275 , č.p. 45 . - S. 34963-34967 . - doi : 10.1074/jbc.M005929200 . — PMID 10950960 .
• Humphrey GW, Wang Y., Russanova VR, Hirai T., Qin J., Nakatani Y., Howard BH Stabilní histondeacetylázové komplexy vyznačující se přítomností SANT doménových proteinů CoREST/kiaa0071 a Mta-   L1 // J Biol. Chem.  : deník. - 2001. - Sv. 276 , č.p. 9 . - str. 6817-6824 . - doi : 10.1074/jbc.M007372200 . — PMID 11102443 .
• Feng Q., Zhang Y. Komplex MeCP1 potlačuje transkripci prostřednictvím preferenční vazby, remodelace a deacetylace methylovaných nukleozomů  // Genes Dev  .  : deník. - 2001. - Sv. 15 , č. 7 . - S. 827-832 . - doi : 10.1101/gad.876201 . — PMID 11297506 .
• Sekimata M., Takahashi A., Murakami-Sekimata A., Homma Y. Zapojení nového proteinu zinkového prstu, MIZF, do transkripční represe interakcí s proteinem vázajícím methyl-CpG,  MBD2  J.// Chem.  : deník. - 2001. - Sv. 276 , č.p. 46 . - S. 42632-42638 . - doi : 10.1074/jbc.M107048200 . — PMID 11553631 .
• Müller-Tidow C., Kügler K., Diederichs S., Klümpen S., Möller M., Vogt U., Metzger R., Schneider PM, Berdel WE, Serve H. Ztráta exprese HDAC-recruiting methyl-CpG- proteiny vazebné domény u lidské rakoviny  (anglicky)  // Br. J. Cancer : deník. - 2001. - Sv. 85 , č. 8 . - S. 1168-1174 . - doi : 10.1054/bjoc.2001.2041 . — PMID 11710831 .
• Feng Q., Cao R., Xia L., Erdjument-Bromage H., Tempst P., Zhang Y. Identifikace a funkční charakterizace složek p66/p68 komplexu MeCP1  (anglicky)  // Mol. buňka. Biol. : deník. - 2002. - Sv. 22 , č. 2 . - str. 536-546 . - doi : 10.1128/MCB.22.2.536-546.2002 . — PMID 11756549 .
• Bakker J., Lin X., Nelson WG Methyl-CpG vazebný doménový protein 2 potlačuje transkripci z hypermethylovaných promotorů genu glutathion S-transferázy třídy pí v buňkách hepatocelulárního karcinomu  //  J. Biol. Chem.  : deník. - 2002. - Sv. 277 , č.p. 25 . - S. 22573-22580 . - doi : 10.1074/jbc.M203009200 . — PMID 11960994 .
• Saito M., Ishikawa F. mCpG-vazebná doména lidského MBD3 se neváže na mCpG, ale interaguje s NuRD/Mi2 složkami HDAC1 a MTA2  //  J. Biol. Chem.  : deník. - 2002. - Sv. 277 , č.p. 38 . - S. 35434-35439 . - doi : 10.1074/jbc.M203455200 . — PMID 12124384 .
• Detich N., Theberge J., Szyf M. Promotor-specifická aktivace a demethylace MBD2/demethylázou   // J. Biol. Chem.  : deník. - 2002. - Sv. 277 , č.p. 39 . - S. 35791-35794 . - doi : 10.1074/jbc.C200408200 . — PMID 12177048 .
• Brackertz M., Boeke J., Zhang R., Renkawitz R. Dva vysoce příbuzné proteiny p66 zahrnují novou rodinu účinných transkripčních represorů interagujících s MBD2 a MBD3  //  J. Biol. Chem.  : deník. - 2002. - Sv. 277 , č.p. 43 . - S. 40958-40966 . - doi : 10.1074/jbc.M207467200 . — PMID 12183469 .
• Krithivas A., Fujimuro M., Weidner M., Young DB, Hayward SD Protein Interactions Targeting the Latency-Associated Nuclear Antigen of Kaposi's Sarcoma Associated Herpesvirus to Cell Chromosomes  //  J. Virol. : deník. - 2002. - Sv. 76 , č. 22 . - S. 11596-11604 . doi : 10.1128/ JVI.76.22.11596-11604.2002 . — PMID 12388720 .