N - konec ( anglicky N-terminus ), také amino-konec , je aminoskupina první aminokyseliny, kterou začíná molekula proteinu nebo peptid [1] .
Každá aminokyselina má aminoskupinu a karboxylovou skupinu . Aminokyseliny se na sebe vážou dehydratační reakcí přidáním karboxylové skupiny jedné aminokyseliny k aminoskupině druhé. Polypeptidové řetězce tedy končí volnou karboxylovou skupinou - C-koncem a začínají aminoskupinou - N-koncem [1] .
Pro stanovení povahy N-terminální aminokyseliny byla navržena řada metod, zejména Sangerova metoda (F. Sanger), založená na arylační reakci polypeptidu 2,4-dinitrofluorbenzenu (DNFB), která vede k tvorbě žlutě zbarveného 2,4-dinitrofenylového derivátu N-terminální aminokyseliny. Na roztok polypeptidu se působí DNFB, který interaguje s volnou NH2 skupinou N-terminální aminokyseliny peptidu.
Po kyselé hydrolýze reakčního produktu, dinitrofenylpeptidu, se na činidlo váže pouze jedna N-terminální aminokyselina ve formě 2,4-dinitrofenylaminokyseliny (stabilní při hydrolýze). Na rozdíl od jiných volných aminokyselin vzniklých během hydrolýzy polypeptidu je žlutý. Identifikuje se chromatografií.
Pro stanovení N-terminální aminokyseliny je mnohem více využívána fenylthiohydantoinová Edmanova metoda pro její vysokou citlivost a možnost vícenásobného použití ve stejném vzorku. Fenylizothiokyanát reaguje s volnou a-NH2 skupinou N-terminální aminokyseliny polypeptidu za vzniku fenylthiokarbamoylpeptidu.