Ferredoxin-dependentní dusitan reduktáza

dusitan reduktáza závislá na ferredoxinu

Dusitan reduktáza ze Spinacia oleracea . Syrogem je zobrazen šedě, shluk železa a síry je zobrazen hnědě. [jeden]
Identifikátory
Kód KF 1.7.7.1
Číslo CAS 37256-44-3
Enzymové databáze
IntEnz pohled IntEnz
BRENDA Vstup BRENDA
ExPASy NiceZyme pohled
MetaCyc metabolická dráha
KEGG Vstup do KEGG
PRIAM profil
Struktury PNR RCSB PDB PDBe PDBj PDBsoučet
Genová ontologie AmiGO  • EGO
Vyhledávání
PMC články
PubMed články
NCBI NCBI proteiny
CAS 37256-44-3

Ferredoxin-dependentní nitritreduktáza je enzym, který katalyzuje reakci:

NO 2 - + 6 Fd obnovit + 8 H + → NH 4 + + 2 H 2 O + 6 Fd oxid

U vyšších rostlin je tento enzym přítomen výhradně v plastidech , kde hraje klíčovou roli při asimilaci dusíku redukcí dusitanů na amoniak . [2] Na rozdíl od nitrátreduktázy má dusitanreduktáza velmi vysokou enzymatickou aktivitu, která zajišťuje, že se dusitany nehromadí v buňce. NO 2 je chemicky velmi aktivní a pro rostliny je silným toxinem [3] .

Enzym může využívat různé izoformy ferredoxinu . Ve fotosyntetických tkáních probíhá reakce díky ferredoxinu redukovanému fotosystémem I a v kořeni je využita izoforma FdIII s méně negativním redox potenciálem, která se snadno obnovuje díky NADPH z pentózofosfátové dráhy za účasti enzymu ferredoxinu . -NADP + reduktáza . [čtyři]

U vyšších rostlin je ferredoxin-dependentní nitritreduktáza kódována chloroplastovým genem NIR a je indukována dusičnany (ale ne dusitany ) a světlem. [5]

Budova

Ferredoxin-dependentní nitritreduktáza je monomer s molekulovou hmotností 60-70 kDa, sestává ze dvou domén a kofaktorů, které přenášejí elektrony z ferredoxinu na dusitany. Ferredoxin se váže na N-terminální sekvenci molekuly. Dusitanové vazebné místo je lokalizováno na druhé polovině proteinu na C-konci. Jedná se o shluk [4Fe-4S] železo-síra a syrogem . [6] [7]

Poznámky

  1. PDB 2AKJ
  2. Zumft WG, Paneque A., Aparicio PJ, Losada M. Mechanism of nitrate reduction in Chlorella   // Biochem . Biophys. Res. komunální. : deník. - 1969. - Sv. 36 , č. 6 . - str. 980-986 . - doi : 10.1016/0006-291X(69)90300-3 . — PMID 4390523 .
  3. Strasburger: Plant Physiology Volume 2 str. 156
  4. Guy Thomas Hanke, Yoko Kimata-Ariga, Isao Taniguchi a Toshiharu Hase. Postgenomická charakterizace feredoxinů Arabidopsis  //  Fyziologie rostlin: časopis. - 2004. - Sv. 134 , č. 1 . - str. 255-264 . - doi : 10.1104/pp.103.032755 .
  5. Fyziologie rostlin. I. P. Ermakov str. 368
  6. Joy KW, Hageman RH Čištění a vlastnosti nitritreduktázy z vyšších rostlin a její závislost na ferredoxinu   // Biochem . J. : deník. - 1966. - Sv. 100 , č. 1 . - str. 263-273 . — PMID 4381617 .
  7. Ramirez JM, Del Campo FF, Paneque A., Losada M. Ferredoxin-nitritreduktáza ze špenátu   // Biochim . Biophys. acta. : deník. - 1966. - Sv. 118 , č. 1 . - str. 58-71 . - doi : 10.1016/s0926-6593(66)80144-3 . — PMID 5954064 .