Haploskupina D (mtDNA)
Haploskupina D |
Typ |
mtDNA |
Doba vzhledu |
před 60 tisíci lety |
Umístění spawn |
Asie |
Rodová skupina |
Haploskupina M |
Haploskupina D je haploskupina lidské mitochondriální DNA .
I. A. Zacharov-Gezekhus a kolegové navrhli dát jméno Daryy haploskupině [1] .
Původ
Předpokládá se, že haploskupina D vznikla v Asii asi před 60 tisíci lety. Je potomkem haploskupiny M.
Podle N. V. Volodka mitochondriální haploskupina D4h3 vznikla na Dálném východě asi před 17 tisíci lety [2] [3] .
Fylogenetický strom
- D
- D4
- D1
- D4a
- D4b
- D4c
- D4d
- D4e
- D4e2
- D4f
- D4g
- D4h
- D4i
- D4j
- D4k
- D4l
- D4m
- D4n
- D4o
- D5'6
Distribuce
Vyskytuje se v severovýchodní Asii (včetně Sibiře ). Je to také jedna z 5 haploskupin mtDNA nalezených u domorodých obyvatel Ameriky [4] , spolu s A , B , C a X2a . D1 je bazální větev D4, která je v Americe rozšířená a různorodá. Podklady D4b1, D4e1 a D4h se nacházejí jak v Asii, tak v Americe. D2 se vyskytuje s vysokou frekvencí u některých arktických a subarktických populací (zejména Aleutů) a je podtřídou D4e1 paralelní s D4e1a a D4e1c, takže by se správně měla nazývat D4e1b. D3 byl nalezen hlavně v některých sibiřských populacích a mezi Eskymáky v Kanadě a Grónsku a je větví D4b1c.
Haploskupina D je také poměrně běžná ve Střední Asii [5] , kde je druhým nejčastějším kladem mtDNA (po mitochondriální haploskupině H ). S nízkou frekvencí se haploskupina D vyskytuje na severovýchodě Evropy a v jihozápadní Asii.
U Mongolů v Číně dosahuje mitochondriální haploskupina D 27,07 %, u Číňanů Han - 23,53 %, u mongolsky mluvících Daurů - 10,53 %. Mitochondriální haploskupina D byla nalezena u 3 z 10 mluvčích jazyka Tungus studovaného v Číně [6] .
Paleogenetika
- D1 byla určena u dospívající dívky z jeskyně Hoyo Negro ( poloostrov Yucatán ), která žila před 13-12 tisíci lety [7] [8]
- D4h3a byla určena u chlapce Anzick-1 ( en:Anzick-1 ), který žil před 12,7 tisíci lety [9]
- D1 identifikovaný v 10 600 let staré mumii Spirit Cave (AHUR_2064), z Nevady [10]
- V jižním kuželu Jižní Ameriky byla mitochondriální haploskupina D1j rozšířena v raném holocénu a mitochondriální haploskupina D1g byla běžná ve středním holocénu [11]
- D1j byl stanoven ve vzorku LLP.S2.E1 (Laguna Chica, před 10223–9764 lety) z Argentiny [12]
- D4h3 byl identifikován u jedince Shuká Káa z jeskyně On Your Knees na ostrově Prince of Wales na jihovýchodní Aljašce, který žil před 9730±60–9880±50 lety [ 13] [14]
- D4h3a byl stanoven ve vzorcích z brazilského Lapa do Santo starých cca. 9,5 tisíce litrů n., Moraes stáří ca. 5,8 tisíce litrů n. a ve vzorku z belizského Mayahak Cab Pek (asi před 9300 lety) [15]
- D5a2a1h1 FY-HT-2 (před 9380±90 lety) z čínské jeskyně Fuyan ( en:Jeskyně Fuyan ) [16] [17] [18]
- D1 byl stanoven ve vzorku ASO_B9_S14a (Arroyo Seco 2, před 7832–7573 lety) z Argentiny [12]
- D4 byla určena ze vzorku DevilsGate1 (5726–5622 př.nl) z jeskyně Devil's Gate v Primorye [19]
- D4 byl určen mezi zástupci kultury Boysman (~5000 př.nl) v Primorye [20]
- D* a D1 byly nalezeny u starých obyvatel Jižní Ameriky (D* a D1 v Huaca Pucllana, D1 v Pasamayo, Pueblo Viejo (Peru) a Llullaillaco (Argentina) [21] [22]
- D4b1a byl identifikován u zástupců kultury Longshan (2275–1844 př. n. l.) [23]
- D4j byl identifikován ve vzorku KPT005 (před 4142–3980 lety, starší doba bronzová) z pohřebiště Khaptsagai poblíž vesnice Lyura ( Irkutská oblast ) [24]
- D2a1a byl identifikován mezi starověkými Aleuty z Aleutských ostrovů (od 2320–1900 do 500–140 let) [25]
- D2a1 byl nalezen u zástupce paleo-eskymácké kultury Saqqaq , který žil v Grónsku cca. před 4 tisíci lety [26]
- D4b2b byl nalezen ve vzorcích JJD 3 01.1 a JJD 3 01.6 (před 3300 lety) z čínské jeskyně Yangjiapo [16]
- D5a1a2ab byl stanoven ve vzorku FY-HT-1 (před 2510 ± 140 lety) z čínské jeskyně Fuyan ( en: jeskyně Fuyan ) [16]
- Mitochondriální haploskupina D byla nalezena u mužského válečníka z pohřbu v Pokrovsku (Jakutsko), který žil před 2400–2200 lety [27]
- U zástupců středního období Yayoi byly identifikovány mitochondriální haploskupiny D4b2b1 (vzorky z Doigahama DH-S01 (2,306-2,238 ka) a DH-A) a D4b2a1 (vzorek HN-SJ002, Hanaura, Japonsko) [28] .
- Muž a žena Xiongnu z Duurlig Nars v severovýchodním Mongolsku, kteří žili před 2000 lety, byli identifikováni s mitochondriální haploskupinou D4 [29].
- D1g5 byl stanoven ve vzorku LCH.E4.4 (Laguna Chica, před 1627–1565 lety) z Argentiny [12]
- Urdžarská princezna z pohřbu doby Saka (III-IV století př. n. l.) v okrese Urdžar v oblasti východního Kazachstánu měla podklad D4o [30] [31]
- Studie DNA kostry hunského období z Přírodovědného muzea (Budapešť), datovaná do střední třetiny 5. století, ukázala, že měla podklad D4j12 [31].
- D2a1 byl stanoven ve vzorcích kultury Tokarevského (druhá polovina roku 1000 př. n. l. - začátek roku 1000 n. l.) z lokality Olskaja na mysu Vostočnyj (Olskij) ( oblast Magadan ) [24].
- D5c1a byl identifikován ve vzorku imperiálního období Kofun JpIw31 (před 1303–1377 lety) [32] .
- D4o2a byl identifikován ve vzorku Yana _young (před 766 lety) z lokality Yana ( Jakutsko ) [24]
- D4b1 byl identifikován u muže z pohřbu 688 z období Hunno-Sarmat na lokalitě Sopka-2 v lesostepi Baraba [33]
- D4j byl stanoven ze vzorku Uyelgi21 z pohřebiště z 9. století na jezeře Uelgi (Čeljabinská oblast) [34]
- D4o2a, D5b1 identifikované vzorky z hřbitova Zhenzishan v Shangdu, Čína (XIII. století) [35]
- D4b1a2a1a se nachází v exemplářích z hřbitova v Nuvuk (Barrow) na Aljašce s kalibrovanými daty mezi lety 981 a 1885 našeho letopočtu [36]
- D1 byla určena ve vzorku I1742 (před 880 lety) z peruánské Tranca (Laramate, Vysočina) [15]
Viz také
Poznámky
- ↑ Zakharov I. A. Středoasijský původ předků prvních Američanů Archivní kopie ze 17. října 2018 na Wayback Machine // First Americans. 2003. č. 11. S. 139-144.
- ↑ Vasiliev S. A. , veBerezkin Yu Wayback Machine . Petrohrad: Nestor-historie, 2015.
- ↑ Volodko NV, Starikovskaya EB, Mazunin IO et al., 2008. Mitochondriální diverzita u arktických Sibiřanů, se zvláštním odkazem na evoluční historii Beringie a pleistocénního obyvatelstva Ameriky // American Journal of Human Genetics. sv. 82. č. 5. S. 1084–1100.
- ↑ Natalia V. Volodko, Elena B. Starikovskaya, Ilya O. Mazunin et al., "Mitochondriální genomová diverzita u arktických Sibiřanů, se zvláštním odkazem na evoluční historii Beringie a pleistocénního obyvatelstva Ameriky", The American Journal of Human Genetics 82, 1084-1100, květen 2008. DOI 10.1016/j.ajhg.2008.03.019.
- ↑ D. Comas a kol. Příměsi, migrace a rozptýlení ve Střední Asii: důkazy z linií mateřské DNA . European Journal of Human Genetics Archived 25. května 2011 na Wayback Machine , 2004
- ↑ Guanglin He a kol. Genomické pohledy na diferencovanou strukturu populačních příměsí a demografickou historii severovýchodních Asiatů Archivováno 23. července 2021 na Wayback Machine , 20. července 2021 ( PDF archivováno 23. července 2021 na Wayback Machine )
- ↑ Lidská kostra z pozdního pleistocénu a mtDNA spojují Paleoameričany a moderní domorodé Američany . Získáno 17. 5. 2014. Archivováno z originálu 17. 5. 2014. (neurčitý)
- ↑ Američan mexický ze Sibiře (nedostupný odkaz) . Staženo 16. 5. 2014. Archivováno z originálu 19. 5. 2014. (neurčitý)
- ↑ Rasmussen M. a kol. Genom člověka z pozdního pleistocénu z pohřebiště Clovis v západní Montaně, příroda. 2014. V. 506. S. 225-229.
- ↑ J. Victor Moreno-Mayar a kol. Časné rozptýlení lidí v Americe Archivováno 25. listopadu 2018 na Wayback Machine , 2018
- ↑ Roca-Rada Xavier et al. Starověké mitochondriální genomy z argentinských pamp informují obyvatele jižního kužele Jižní Ameriky // ISBA9 ( PDF archivováno 16. října 2021 na Wayback Machine
- ↑ 1 2 3 Xavier Roca-Rada a kol. Starověké mitochondriální genomy z argentinských pamp informují rané obyvatele jižního kužele Jižní Ameriky , 14. května 2021 (Tabulka 1. Kalibrovaná data a mitochondriální haploskupiny 18 jedinců raného až pozdního holocénu z argentinských pamp)
- ↑ Informace o podpoře. Lindo a kol. 10.1073/pnas.1620410114 . Získáno 8. dubna 2017. Archivováno z originálu 2. září 2017. (neurčitý)
- ↑ Kemp Brian M. a kol. (2007). Genetická analýza raně holocénních kosterních pozůstatků z Aljašky a její důsledky pro osídlení Ameriky (nedostupný odkaz)
- ↑ 1 2 Cosimo Posth a kol. Rekonstrukce hluboké populační historie Střední a Jižní Ameriky Archivováno 22. prosince 2021 na Wayback Machine , 2018
- ↑ 1 2 3 Xue-feng Slunce. Starověká DNA a multimetodní datování potvrzují pozdní příchod anatomicky moderních lidí do jižní Číny Archivováno 7. března 2021 na Wayback Machine , 23. února 2021
- ↑ María Martinón-Torres a kol. O chybné identifikaci a nespolehlivém kontextu nových „lidských zubů“ z jeskyně Fuyan (Čína) Archivováno 30. května 2021 na Wayback Machine , 24. května 2021
- ↑ Darren Curnoe a kol. Odpověď pro Martinón-Torres et al. a Higham a Douka: Odmítnutí uznat složitost datování jeskyně Fuyan posiluje náš případ Archivováno 2. června 2021 na Wayback Machine , 1. června 2021
- ↑ Veronica Siska a kol. Údaje o celém genomu od dvou raně neolitických východoasijských jedinců z doby před 7700 lety Archivováno 27. července 2018 na Wayback Machine , 2017
- ↑ Chuan-Chao Wang a kol. Genomická formace lidských populací ve východní Asii archivována 1. dubna 2020 na Wayback Machine , 2020
- ↑ Andrej Konkov . Dešifrování starověké DNA vyprávělo o původu jihoamerických indiánů Archivní kopie z 26. prosince 2017 na Wayback Machine
- ↑ Bastien Llamas a kol. Starověká mitochondriální DNA poskytuje časové měřítko s vysokým rozlišením obyvatel Ameriky, 2016 // Doplňkové materiály. Tabulka S2. Seznam starých vzorků, související metadata a výsledky sekvenování (samostatný dokument Excel Archived 8. ledna 2018 na Wayback Machine
- ↑ Chao Ning a kol. Analýzy starověkého genomu vrhají světlo na organizaci příbuzenství a praktiky páření v pozdně neolitické společnosti v Číně , 2021
- ↑ 1 2 3 Martin Sikora a kol. Populační historie severovýchodní Sibiře od pleistocénu Archivováno 5. července 2021 na Wayback Machine , 05. června 2019 ( bioRxiv, 2018 Archivováno 24. října 2018 na Wayback Machine )
- ↑ Pavel Flegontov a kol. Paleo-eskymácké genetické dědictví v Severní Americe Archivováno 23. ledna 2018 na Wayback Machine , 2017
- ↑ Rasmussen, M. et al., "Starověká lidská gonomová sekvence vyhynulého paleoeskymáka". Nature 463: 757-762.
- ↑ Amory S, Crubézy E, Keyser C, Alekseev AN, Ludes B (říjen 2006). „První vliv stepních kmenů na obyvatele Sibiře“ . Human Biology 78 (5): 531-49.
- ↑ Fuzuki Mizuno a kol. Dynamika populace na japonském souostroví od pleistocénu odhalená kompletními sekvencemi mitochondriálního genomu // Vědecké zprávy, 2021
- ↑ Západní euroasijský samec byl nalezen na 2000 let starém elitním hřbitově Xiongnu v severovýchodním Mongolsku . Datum přístupu: 21. ledna 2015. Archivováno z originálu 27. prosince 2014. (neurčitý)
- ↑ První výsledky práce Laboratoře populační genetiky . Získáno 9. února 2020. Archivováno z originálu dne 17. ledna 2021. (neurčitý)
- ↑ 1 2 Kazakhstan DNA Project Archived 26. listopadu 2016 na Wayback Machine
- ↑ Niall P. Cooke a kol. Starověká genomika odhaluje tripartitní původ japonských populací Archivováno 18. září 2021 na Wayback Machine // Science Advances • 17. září 2021 • Vol 7, Issue 38
- ↑ Pilipenko A. S. Unikátní pohřeb válečníka hunsko-sarmatského období v západosibiřské lesostepi: výsledky paleogenetické analýzy Archivní kopie ze dne 30. prosince 2018 na Wayback Machine // Archeologie, etnografie a antropologie Eurasie. Ročník 46 č. 4 2018
- ↑ Veronika Csáky a kol. Raně středověká genetická data z oblasti Ural vyhodnocena ve světle archeologických důkazů starých Maďarů , 2020
- ↑ Jiawei Li a kol. Starověké genomy odhalují složitou genetickou historii mezinárodní metropole v Kublajchánově horním hlavním městě (Xanadu) , 14. června 2022
- ↑ Justin Tackney a spol. Molekulární analýza starověké populace Thule v Nuvuk, Point Barrow, Aljaška , 9. ledna 2019
Odkazy
Obecné informace
Haploskupina D
Genetika |
---|
|
Klíčové koncepty |
| |
---|
Obory genetiky |
|
---|
vzory |
|
---|
související témata |
|
---|