Haploskupina M (mtDNA)

Haploskupina M
Typ mtDNA
Doba vzhledu před 60 tisíci lety
Umístění spawn Asie [1] [2] nebo Afrika [3]
Rodová skupina Haploskupina L3
Podklady M1 , M*, CZ , Q , E , G , D
Markerové mutace 263, 489, 10400, 14783, 15043

V lidské populační genetice je haploskupina M jednou z haploskupin identifikovaných analýzou sekvence mitochondriální DNA (mtDNA). Tato haploskupina je rozšířena v Asii [4] , zejména v Indii [5] . Přesto je samotná makroskupina M jednou z větví mitochondriální haploskupiny L3 , od které se oddělila před 60–75 tisíci lety [2] [1] . TMRCA pro bazální neafrickou haploskupinu M je asi 49 tisíc let (95% interval spolehlivosti: 54,8-43,6 tisíc let) [6] . Rodová haploskupina L3 zase pochází od potomků hypotetické mitochondriální Evy z Afriky.

Přítomnost linie haploskupiny M v Etiopii, nazývané M1, vedla k předpokladu, že haploskupina M mohla vzniknout ve východní Africe asi před 60 tisíci lety. n., a pak se dostat do Asie [7] . V roce 2006 však A. Olivieri uvedl [8] , že přibližně 45-40 tisíc litrů. n. nyní převládající severoafrické haploskupiny M1 a U6 vznikly v jihozápadní Asii a společně se přesunuly do Afriky [9] .

TMRCA pro haploskupinu M71d je asi 22,21 tisíc let (95% interval spolehlivosti: 14,4-31,52 tisíc let). Haploskupina M71d byla identifikována v Thajsku, Laosu a Myanmaru a nebyla nalezena v moderních populacích jižní Číny [10] .

Stephen Oppenheimer navrhl název klanu Manyu pro makroskupinu M. S odkazem na studii estonských genetiků Thomase Kivisilda a Richarda Willemse napsal, že nosiči subkladu M1 překročili Rudé moře a na území dnešní Etiopie se dostali během poslední doby ledové [11] .

Makroskupina M je předkem několika haploskupin. Nejdůležitější z nich:

Paleogenetika

Poznámky

  1. 1 2 3 Revathi Rajkumar et al., Fylogeny a starověk M makrohaploskupiny odvozené z kompletní mt DNA sekvence indických specifických linií Archivováno 25. května 2011 na Wayback Machine , BMC Evolutionary Biology 2005, 5:26 doi:6/14111 2148-5-26
  2. 1 2 Gonzalez et al., Mitochondriální linie M1 sleduje raný lidský zpětný tok do Afriky , BMC Genomics 2007, 8:223 doi:10.1186/1471-2164-8-223
  3. Semino a kol. (2000), The Genetic Legacy of Paleolithic Homo sapiens in Extant Europeans: AY Chromosome Perspective Archived 9 October 2017 at the Wayback Machine , Science. 10. listopadu 2000;290(5494):1155-9.
  4. Ghezzi a kol. (2005), mitochondriální DNA haploskupina K je spojena s nižším rizikem Parkinsonovy choroby u Italů Archivováno 28. října 2016 na Wayback Machine , European Journal of Human Genetics (2005) 13, 748-752 .
  5. Edwin a kol. (2002), Diverzita mitochondriální DNA mezi pěti kmenovými populacemi jižní Indie Archivováno 7. června 2011 ve Wayback Machine , CURRENT SCIENCE, VOL. 83, č.p. 2, 25. července 2002.
  6. Cosimo Posth a kol. Pleistocénní mitochondriální genomy naznačují jediné velké rozptýlení Neafričanů a pozdní obrat populace zaledněný v Evropě Archivováno 14. dubna 2017 na Wayback Machine , 2016
  7. Quintana-Murci L., Semino O., Bandelt HJ., Passarino G., McElreavey K. et al. (1999) Genetický důkaz brzkého odchodu Homo sapiens sapiens z Afriky přes východní // Afriku Nat Genet 23: 437–441
  8. Olivieri A., Achilli A., Pala M., Battaglia V., Fornarino S.. et al. (2006) Dědictví mtDNA levantského raného horního paleolitu v Africe. Science 314:1767
  9. Adimoolam Chandrasekar a kol. Aktualizace fylogeneze mitochondriální DNA makrohaploskupiny M v Indii: Rozptýlení moderního člověka v jihoasijském koridoru Archivováno 31. srpna 2021 na Wayback Machine , 20. října
  10. 1 2 Fan Bai, Xinglong Zhang, Xueping Ji, Peng Cao, Xiaotian Feng, Ruowei Yang, Minsheng Peng, Shuwen Pei, Qiaomei Fu . Paleolitické genetické spojení mezi jižní Čínou a pevninskou jihovýchodní Asií odhalené starověkými mitochondriálními genomy Archivováno 10. ledna 2021 na Wayback Machine , 11. července 2020
  11. 12 Stephen Oppenheimer . Z Edenu. 2004, Constable a Robinson ISBN 1-84119-894-3 britský titul The Real Eve.
  12. Haploskupina C. Datum přístupu: 3. ledna 2009. Archivováno z originálu 24. července 2011.
  13. Haploskupina C1 . Získáno 3. ledna 2009. Archivováno z originálu 23. února 2009.
  14. D. Comas et al., Příměsi, migrace a disperze ve Střední Asii: důkazy z linií mateřské DNA . EJHG, 2004 . Získáno 3. ledna 2009. Archivováno z originálu 25. května 2011.
  15. Haploskupina G. Datum přístupu: 3. ledna 2009. Archivováno z originálu 19. února 2009.
  16. Haploskupina M1 . Datum přístupu: 3. ledna 2009. Archivováno z originálu 19. února 2009.
  17. AD Holden et al., Variace MtDNA v populacích severní, východní a střední Afriky poskytuje vodítko k možné zpětné migraci z Blízkého východu Archivováno 3. března 2016 na Wayback Machine , Program 74. výročního setkání Američanů Asociace fyzických antropologů (2005)
  18. Alexandr Markov . Evoluce člověka: opice, kosti a geny. 2011
  19. Erwan Pennarun a kol. Rozvod z pozdního svrchního paleolitu demografické historie haploskupin mtDNA M1 a U6 v Africe Archivováno 20. září 2015 na Wayback Machine
  20. Kivisild T. a kol. (1999) Možný vliv západoasijských mateřských genetických linií na východní Afričany po posledním glaciálu. Cold Springs Harbor Symposium o lidském původu a kostech.
  21. Haploskupina M2 . Datum přístupu: 3. ledna 2009. Archivováno z originálu 19. února 2009.
  22. Haploskupina M3 . Datum přístupu: 3. ledna 2009. Archivováno z originálu 19. února 2009.
  23. Haploskupina M4 . Datum přístupu: 3. ledna 2009. Archivováno z originálu 19. února 2009.
  24. 1 2 K. Thangaraj et al, In situ původ hluboko zakořeněných linií mitochondriální makrohaploskupiny 'M' v Indii . BMC Genomics, 2006 . Získáno 3. ledna 2009. Archivováno z originálu 15. října 2008.
  25. Haploskupina M5 . Datum přístupu: 3. ledna 2009. Archivováno z originálu 19. února 2009.
  26. Haploskupina M6 . Datum přístupu: 3. ledna 2009. Archivováno z originálu 19. února 2009.
  27. Haploskupina M7 . Datum přístupu: 3. ledna 2009. Archivováno z originálu 19. února 2009.
  28. Haploskupina M8 . Datum přístupu: 3. ledna 2009. Archivováno z originálu 19. února 2009.
  29. Haploskupina M9 . Datum přístupu: 3. ledna 2009. Archivováno z originálu 19. února 2009.
  30. Haploskupina M10 . Datum přístupu: 3. ledna 2009. Archivováno z originálu 19. února 2009.
  31. Haploskupina M21 . Datum přístupu: 3. ledna 2009. Archivováno z originálu 19. února 2009.
  32. 12 Haploskupin M11 & 12 . Získáno 19. června 2022. Archivováno z originálu dne 22. září 2020.
  33. Dubut ; PROTI; Cartault, F; Payet, C; Thionville, M.D.; Murail, P. a kol. Kompletní mitochondriální sekvence pro haploskupiny M23 a M46: pohledy do asijského původu malgašské populace  //  Human Biology: journal. - 2009. - Sv. 81 , č. 4 . - S. 495-500 . - doi : 10.3378/027.081.0407 . — PMID 20067372 .
  34. Ricaut, FX; Razafindrazaka, H; Cox, poslanec; Dugoujon, JM; Guitar, E; Sambo, C; Mormina, M; Mirazon-Lahr, M; Ludes, B; Crubezy, Eric a kol. Nová hluboká větev euroasijské mtDNA makrohaploskupiny M odhaluje další složitost ohledně osídlení Madagaskaru  //  BMC Genomics : deník. - 2009. - Sv. 10 . — S. 605 . - doi : 10.1186/1471-2164-10-605 . — PMID 20003445 .
  35. Haploskupina M27-29 . Datum přístupu: 3. ledna 2009. Archivováno z originálu 20. února 2009.
  36. Haploskupina Q. Datum přístupu: 3. ledna 2009. Archivováno z originálu 19. února 2009.
  37. Haploskupina M31 . Datum přístupu: 3. ledna 2009. Archivováno z originálu 19. února 2009.
  38. Haploskupina M32 . Datum přístupu: 3. ledna 2009. Archivováno z originálu 19. února 2009.
  39. Haploskupina M33 . Datum přístupu: 3. ledna 2009. Archivováno z originálu 19. února 2009.
  40. Haploskupina M34 . Datum přístupu: 3. ledna 2009. Archivováno z originálu 19. února 2009.
  41. Haploskupina M35 . Datum přístupu: 3. ledna 2009. Archivováno z originálu 19. února 2009.
  42. Haploskupina M39 . Datum přístupu: 3. ledna 2009. Archivováno z originálu 19. února 2009.
  43. Haploskupina M40 . Datum přístupu: 3. ledna 2009. Archivováno z originálu 19. února 2009.
  44. Jean-Jacques Hublin a kol. Počáteční svrchní paleolit ​​Homo sapiens z jeskyně Bacho Kiro, Bulharsko Archivováno 19. června 2020 ve Wayback Machine , 11. května 2020
  45. Cosimo Posth a kol. Pleistocénní mitochondriální genomy naznačují jediné velké rozptýlení Neafričanů a pozdní obrat populace zaledněný v Evropě Archivováno 14. dubna 2017 na Wayback Machine , 2016
  46. Qiaomei Fu a kol. Genetická historie Evropy doby ledové , 2016
  47. 1 2 3 4 Fuzuki Mizuno a kol. Dynamika populace na japonském souostroví od pleistocénu odhalená kompletními sekvencemi mitochondriálního genomu // Vědecké zprávy, 2021
  48. Ken-ichi Shinoda, Noboru Adach . Analýza starověké DNA paleolitických obyvatel Ryukyu Archived 29. března 2021 na Wayback Machine // Tento text je převzat z New Perspectives in Southeast Asian and Pacific Prehistory, editovali Philip J. Piper, Hirofumi Matsumura a David Bulbeck, publikoval 2017 ANU Press, Australská národní univerzita, Canberra, Austrálie
  49. M. van de Loosdrecht el al. Pleistocénní genomy severní Afriky spojují lidskou populaci z Blízkého východu a subsaharské Afriky , Science (2018)
  50. Starověká epigenomika . Získáno 18. března 2018. Archivováno z originálu 17. března 2018.
  51. Doplňkové materiály pro. Tabulka S16. Zadání Y-haploskupiny pro šest samců Taforalt. Všichni jedinci mohli být zařazeni do haploskupiny E1b1b a pět z nich konkrétněji do E1b1b1a1 (M-78). . Získáno 18. března 2018. Archivováno z originálu 18. března 2018.
  52. Xiaoming Zhang a kol. Lidský genom z pozdního pleistocénu z jihozápadní Číny , 14. července 2022
  53. 1 2 Tianyi Wang a kol. Historie lidské populace na křižovatce východní a jihovýchodní Asie od doby před 11 000 lety // Cell, 24. června 2021
  54. Veronica Siska a kol. Údaje o celém genomu od dvou raně neolitických východoasijských jedinců z doby před 7700 lety Archivováno 27. července 2018 na Wayback Machine , 2017
  55. 1 2 3 Hugh McColl a kol. Starověká genomika odhaluje čtyři prehistorické migrační vlny do jihovýchodní Asie , 2018
  56. Tabulka SI 17 Archivováno 26. srpna 2021 na Wayback Machine // Doplňkové informace pro: Genom lovce a sběrače ze středního holocénu z Wallacea
  57. Selina Carlhoff a kol. Genom lovce a sběrače ze středního holocénu z Wallacea Archivováno 26. srpna 2021 na Wayback Machine , 25. srpna 2021
  58. Sokolov AS et al. Šest kompletních mitochondriálních genomů od lidí z rané doby bronzové na Severním Kavkaze Archivováno 11. května 2017 na Wayback Machine
  59. Iñigo Olalde a kol. Genomická historie Pyrenejského poloostrova za posledních 8000 let Archivováno 21. února 2020 na Wayback Machine , 2019
  60. Gülşah Merve Kılınç a kol. Dynamika lidské populace a Yersinia pestis ve starověké severovýchodní Asii Archivováno 17. června 2021 na Wayback Machine , 2021
  61. Morten E. Allentoft a kol. "Populační genomika z doby bronzové Eurasie" Archivováno 30. dubna 2016 na Wayback Machine , 2015
  62. Konstantina Drosou a kol. Příbuzenství dvou mumií z 12. dynastie odhalené starověkým sekvenováním DNA Archivováno 17. ledna 2018 na Wayback Machine , 2018
  63. Verena J. Schuenemann a kol. Genomy staroegyptských mumií naznačují nárůst předků ze subsaharské Afriky v postřímských obdobích Archivováno 30. září 2019 na Wayback Machine , 30. května 2017
  64. Jean-Philippe Gourdine, SOY Keita, Jean-Luc Gourdine, Alain Anselin . Starověké egyptské genomy ze severního Egypta: Další diskuse Archivováno 18. srpna 2018 na Wayback Machine
  65. Vagheesh M. Narasimhan a kol. Genomická formace jižní a střední Asie archivována 1. dubna 2018 na Wayback Machine , 31. března 2018
  66. Vagheesh M. Narasimhan a kol. Vznik lidských populací v jižní a střední Asii Archivováno 4. dubna 2021 na Wayback Machine , 6. září 2019
  67. Mary E. Prendergast a kol. Starověká DNA odhaluje několikastupňové rozšíření prvních pastevců do subsaharské Afriky Archivováno 1. června 2019 na Wayback Machine (tabulka S7. (samostatný soubor) mtDNA haplogroups), 2019
  68. 1 2 Niall P. Cooke a kol. Starověká genomika odhaluje tripartitní původ japonských populací Archivováno 18. září 2021 na Wayback Machine // Science Advances • 17. září 2021 • Vol 7, Issue 38
  69. Maja Krzewińska a kol. Starověké genomy naznačují, že východní ponticko-kaspická step je zdrojem západních nomádů z doby železné Archivováno 7. října 2018 na Wayback Machine , 2018
  70. Aranka Csősz a kol. Mateřský genetický původ a dědictví Maďarů z 10. století našeho letopočtu Archivováno 23. března 2019 na Wayback Machine , 16. září 2016
  71. Kitti Mar a kol. Mateřské linie z 10.–11. století obyčejných hřbitovů v Karpatské pánvi Archivováno 30. března 2021 na Wayback Machine , březen 2021
  72. Bea Szeifert et al. Sledování genetických spojení starých Maďarů s populací oblasti Volha-Ural ze 6.–14. století Archivováno 12. února 2022 na Wayback Machine , 8. února 2022

Viz také

Strom haploskupin lidské mtDNA

Mitochondriální Eva
|
L0 L1 L2 L3 L4 L5 L6 L7
|
M N
| |
cz D E G Q R Ó A S X Y N1 N2
| | | |
C Z B F R0 před JT P Spojené království N1a W
| | |
HV JT U K
| |
H PROTI J T Starší klastry IWX


Odkazy