Pachyten neboli pachinema ( řecky πάχους - tlustý a νήμα - vlákno) je jedním z profázních stupňů prvního dělení meiózy , nazývaného také stádium tlustého vlákna , během kterého je dokončena tvorba synaptonemálního komplexu mezi homologními chromozomy a křížením . dojde k překročení [1] . Pachytenu předcházejí taková meiotická stádia profáze I, jako je leptoten (stadium tenkých vláken) a zygoten . Následuje diploten a diakineze .
Termín „pachyten“ spolu s „leptotenem“ a „diplotenem“ poprvé použil belgický cytolog Hans von Winiwarter v roce 1900 [1] .
Konjugující homologní chromozomy, z nichž každý sestává ze dvou chromatid , tvoří bivalenty ve stádiu pachytenu , jejichž počet odpovídá haploidnímu počtu chromozomů [2] . Na konci této fáze meiózy se bivalenty zkracují a ztlušťují a tvoří asi ¼ délky chromozomu v leptotenu. Charakteristickým znakem pachytenu je jasně vyjádřená chromomerní struktura chromozomů. U pachytenu je striktně odhalena individualita každé chromomery, což umožnilo vytvořit cytologické mapy pachytenových chromozomů pro některé druhy a využít je pro cytogenetickou analýzu (tzv. pachytenovou analýzu). Pachyten se vyznačuje výrazným zvětšením jádra a jadérka . Pachyten u zvířat je jednou z nejdelších fází meiózy [3] .
Ve stádiu pachytenu lze detekovat chromozomální přestavby všech typů ( delece , duplikace , inverze , translokace ) . Podobnou analýzu poprvé provedla Barbara McClintock v roce 1930 při studiu chromozomálních přestaveb v kukuřici [4] . Detekce chromozomálních abnormalit v pachytenovém stadiu je spojena s charakteristickými rysy konjugace chromozomů, které spočívají v tom, že v profázi meiózy jsou chromozomy konjugovány homologními lokusy, to znamená, že k synapsi nedochází u chromozomů jako celku, ale jednotlivých homologních lokusů [5] .