Zinkový prst a doména BTB obsahující protein 16

Aktuální verze stránky ještě nebyla zkontrolována zkušenými přispěvateli a může se výrazně lišit od verze recenzované 17. listopadu 2021; kontroly vyžadují 2 úpravy .
Zinkový prst a doména BTB obsahující 16

PNR je reprezentován příkladem 1buo.
Dostupné struktury
PNR Ortologické vyhledávání: PDBe , RCSB
Identifikátory
SymbolZBTB16  ; P.L.Z.; ZNF145
Externí IDOMIM:  176797 MGI :  103222 HomoloGene :  21214 GeneCards : ZBTB16 Gene
Profil exprese RNA
Více informací
ortology
PohledČlověkMyš
Entrez7704235320
SouborENSG00000109906ENSMUSG00000066687
UniProtQ05516A3KMN0
RefSeq (mRNA)NM_001018011NM_001033324
RefSeq (protein)NP_001018011NP_001028496
Locus (UCSC)Chr 11:
113,93 – 114,12 Mb
Chr 9:
48,65 – 48,84 Mb
Hledejte v PubMed[jeden][2]

Protein 16, obsahující zinkový prst a doménu BTB  , je protein kódovaný u lidí genem ZBTB16 .

Funkce

Tento gen je členem rodiny proteinů C2H2 zinkový prst kruppel a kóduje transkripční faktor zinkového prstu , který obsahuje devět domén zinkového prstu kruppel ( německy:  Krueppel ) na C-konci. Tento protein se nachází v jádře, účastní se progrese buněčného cyklu a interaguje s histondeacetylázou . Specifické případy aberantních genových přeuspořádání v tomto lokusu byly spojeny s akutní promyelocytární leukémií [1] a fyziologické funkce byly identifikovány u myší jako přirozené zabíječské T buňky [2] [3] a gama delta T buňky. [4] Existují alternativní varianty transkripčního sestřihu , které byly charakterizovány u lidí. [5] [6]

Interakce

Bylo prokázáno, že protein 16, obsahující zinkový prst a doménu BTB, interaguje s následujícími strukturami:

Poznámky

  1. Chen Z., Brand NJ, Chen A., Chen SJ, Tong JH, Wang ZY, Waxman S., Zelent A. Fúze mezi novým genem zinkového prstu podobného Krüppelovi a lokusem alfa receptoru retinové kyseliny v důsledku varianty t(11;17) translokace spojená s akutní promyelocytární leukémií  (anglicky)  // The EMBO Journal : deník. - 1993. - Sv. 12 , č. 3 . - S. 1161-1167 . — PMID 8384553 .
  2. Kovalovsky D., Uche OU, Eladad S., Hobbs RM, Yi W., Alonzo E., Chua K., Eidson M., Kim HJ, Im JS, Pandolfi PP, Sant'Angelo DB The BTB-zinc finger transscriptional regulátor, PLZF, řídí vývoj funkcí efektoru buněk iNKT  (anglicky)  // Nature Immunology  : journal. - 2008. - Sv. 9 , č. 9 . - S. 1055-1064 . - doi : 10.1038/ni.1641 . — PMID 18660811 .
  3. Savage AK, Constantinides MG, Han J., Picard D., Martin E., Li B., Lantz O., Bendelac A. Transkripční faktor PLZF (Zbtb16) řídí efektorový program buněčné  linie NKT  // Imunita: časopis. - Cell Press , 2008. - Vol. 29 , č. 3 . - S. 391-403 . - doi : 10.1016/j.immuni.2008.07.011 . — PMID 18703361 .
  4. Kreslavsky T., Savage AK, Hobbs R., Gounari F., Bronson R., Pereira P., Pandolfi PP, Bendelac A., von Boehmer H. TCR-inducible PLZF transkripční faktor požadovaný pro vrozený fenotyp podskupiny γδ T buňky s omezenou diverzitou TCR  (anglicky)  // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America  : journal. - 2009. - Sv. 106 , č. 30 . - S. 12453-12458 . - doi : 10.1073/pnas.0903895106 . — PMID 19617548 .
  5. Zhang T., Xiong H., Kan LX, Zhang CK, Jiao XF, Fu G., Zhang QH, Lu L., Tong JH, Gu BW, Yu M., Liu JX, Licht J., Waxman S., Zelent A., Chen E., Chen SJ Genomová sekvence, strukturní organizace, molekulární evoluce a aberantní přeuspořádání genu pro zinkový prst promyelocytární leukémie  // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America  : journal  . - 1999. - Sv. 96 , č. 20 . - S. 11422-11427 . - doi : 10.1073/pnas.96.20.11422 . — PMID 10500192 .
  6. ZBTB16 zinkový prst a doména BTB obsahující 16 . Entrez (4. října 2009). Staženo: 10. října 2009.
  7. Senbonmatsu T., Saito T., Landon EJ, Watanabe O., Price E., Roberts RL, Imboden H., Fitzgerald TG, Gaffney FA, ​​​​Inagami T. Nová signální dráha receptoru angiotenzinu II typu 2: možná role při srdeční hypertrofii  (anglicky)  // EMBO J. : deník. — Sv. 22 , č. 24 . - S. 6471-6482 . - doi : 10.1093/emboj/cdg637 . — PMID 14657020 .
  8. Dhordain P., Albagli O., Honore N., Guidez F., Lantoine D., Schmid M., The HD, Zelent A., Koken MH Kolokalizace a heteromerizace mezi dvěma lidskými onkogenovými proteiny POZ/zinkový prst, LAZ3 ( BCL6 ) a PLZF   // onkogen : deník. — Sv. 19 , č. 54 . - S. 6240-6250 . - doi : 10.1038/sj.onc.1203976 . — PMID 11175338 .
  9. Barna M., Merghoub T., Costoya JA, Ruggero D., Branford M., Bergia A., Samori B., Pandolfi PP Plzf zprostředkovává transkripční represi exprese genu HoxD prostřednictvím remodelace chromatinu  (Angl.)  // Dev. buňka : deník. — Sv. 3 , ne. 4 . - str. 499-510 . - doi : 10.1016/s1534-5807(02)00289-7 . — PMID 12408802 .
  10. 1 2 Ward JO, McConnell MJ, Carlile GW, Pandolfi PP, Licht JD, Freedman LP receptorem vitaminu D(3)  // Krev : deník. — Americká hematologická společnost. — Sv. 98 , č. 12 . - S. 3290-3300 . - doi : 10.1182/blood.v98.12.3290 . — PMID 11719366 .
  11. Puccetti E., Obradovic D., Beissert T., Bianchini A., Washburn B., Chiaradonna F., Boehrer S., Hoelzer D., Ottmann OG, Pelicci PG, Nervi C., Ruthardt M. AML-associated translocation produkty blokují diferenciaci vyvolanou vitaminem D(3) sekvestrací receptoru vitaminu D(3)  //  Cancer Research : deník. — Americká asociace pro výzkum rakoviny. — Sv. 62 , č. 23 . - str. 7050-7058 . — PMID 12460926 .
  12. McLoughlin P., Ehler E., Carlile G., Licht JD, Schäfer BW Pouze LIM protein DRAL/FHL2 interaguje a je korepresorem proteinu zinkového prstu promyelocytární leukémie  //  J. Biol. Chem.  : deník. — Sv. 277 , č.p. 40 . - S. 37045-37053 . - doi : 10.1074/jbc.M203336200 . — PMID 12145280 .
  13. Labbaye C., Quaranta MT, Pagliuca A., Militi S., Licht JD, Testa U., Peschle C. PLZF indukuje vývoj megakaryocytů, aktivuje expresi Tpo receptoru a interaguje s  proteinem  GATA1 // Onkogen : deník. — Sv. 21 , č. 43 . - S. 6669-6679 . - doi : 10.1038/sj.onc.1205884 . — PMID 12242665 .
  14. Tsuzuki S., Enver T. Interakce GATA-2 s proteinem zinkového prstu promyelocytární leukémie (PLZF), jeho homologem FAZF a alfa   onkoproteinem receptoru PLZF-kyseliny retinové generovaným t(11;17) / Krev : deník. — Americká hematologická společnost. — Sv. 99 , č. 9 . - S. 3404-3410 . - doi : 10.1182/blood.v99.9.3404 . — PMID 11964310 .
  15. 1 2 3 4 Chauchereau A., Mathieu M., de Saintignon J., Ferreira R., Pritchard LL, Mishal Z., Dejean A., Harel-Bellan A. HDAC4 zprostředkovává transkripční represi proteinem spojeným s akutní promyelocytární leukémií PLZF   // Onkogen _ : deník. — Sv. 23 , č. 54 . - S. 8777-8784 . - doi : 10.1038/sj.onc.1208128 . — PMID 15467736 .
  16. 1 2 3 David G., Alland L., Hong SH, Wong CW, DePinho RA, Dejean A. Histonová deacetyláza asociovaná s mSin3A zprostředkovává represi  proteinem PLZF asociovaným s akutní promyelocytární leukémií //  Onkogen : deník. — Sv. 16 , č. 19 . - S. 2549-2556 . - doi : 10.1038/sj.onc.1202043 . — PMID 9627120 .
  17. 1 2 3 Wong CW, Privalsky ML Komponenty korepresorového komplexu SMRT vykazují výrazné interakce s onkoproteiny domény POZ PLZF, PLZF-RARalpha a BCL-6  //  J. Biol. Chem.  : deník. — Sv. 273 , č.p. 42 . - S. 27695-27702 . doi : 10.1074/ jbc.273.42.27695 . — PMID 9765306 .
  18. 1 2 Lemercier C., Brocard MP, Puvion-Dutilleul F., Kao HY, Albagli O., Khochbin S. Histon deacetylázy II. třídy jsou přímo získávány transkripčním represorem BCL6  (anglicky)  // J. Biol. Chem.  : deník. — Sv. 277 , č.p. 24 . - S. 22045-22052 . - doi : 10.1074/jbc.M201736200 . — PMID 11929873 .
  19. Nanba D., Mammoto A., Hashimoto K., Higashiyama S. Proteolytické uvolňování karboxy-terminálního fragmentu proHB-EGF způsobuje jaderný export PLZF  //  J. Cell Biol. : deník. — Sv. 163 , č.p. 3 . - S. 489-502 . - doi : 10.1083/jcb.200303017 . — PMID 14597771 .
  20. Nanba D., Toki F., Higashiyama S. Role nabitých aminokyselinových zbytků v cytoplazmatické doméně proHB-EGF   // Biochem . Biophys. Res. komunální. : deník. — Sv. 320 , č.p. 2 . - str. 376-382 . - doi : 10.1016/j.bbrc.2004.05.176 . — PMID 15219838 .
  21. Takahashi S., McConnell MJ, Harigae H., Kaku M., Sasaki T., Melnick AM, Licht JD Interní tandemový duplikační mutant Flt3 inhibuje funkci transkripčních represorů blokováním interakcí s   SMRT // Krev : deník. — Americká hematologická společnost. — Sv. 103 , č. 12 . - S. 4650-4658 . - doi : 10.1182/krev-2003-08-2759 . — PMID 14982881 .
  22. Hong SH, David G., Wong CW, Dejean A., Privalsky ML Korepresor SMRT interaguje s PLZF a s PML-receptorem kyseliny retinové alfa (RARalpha) a  PLZF -RARalfa onkoproteiny spojenými s akutní promyelocytární leukémií  // National Proceedings of the National Proceedings of the Akademie věd Spojených států amerických  : časopis. — Sv. 94 , č. 17 . - S. 9028-9033 . - doi : 10.1073/pnas.94.17.9028 . — PMID 9256429 .
  23. Koken MH, Reid A., Quignon F., Chelbi-Alix MK, Davies JM, Kabarowski JH, Zhu J., Dong S., Chen S., Chen Z., Tan CC, Licht J., Waxman S., de Thé H., Zelent A. Fúzní partneři receptoru alfa kyseliny retinové spojené s leukémií, PML a PLZF, heterodimerizují a kolokalizují na jaderná těla  // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America  : journal  . — Sv. 94 , č. 19 . - S. 10255-10260 . - doi : 10.1073/pnas.94.19.10255 . — PMID 9294197 .
  24. Melnick AM, Westendorf JJ, Polinger A., ​​​​Carlile GW, Arai S., Ball HJ, Lutterbach B., Hiebert SW, Licht JD Protein ETO narušený u akutní myeloidní leukémie související s t(8;21) je korepresor pro protein zinkového prstu promyelocytární leukémie  (anglicky)  // Mol. buňka. Biol. : deník. — Sv. 20 , č. 6 . - S. 2075-2086 . - doi : 10.1128/mcb.20.6.2075-2086.2000 . — PMID 10688654 .
  25. Melnick A., Carlile GW, McConnell MJ, Polinger A., ​​​​Hiebert SW, Licht JD Fúzní protein AML-1  / ETO je dominantním negativním inhibitorem transkripční represe proteinem zinkového prstu promyelocytární leukémie  // Krev : deník. — Americká hematologická společnost. — Sv. 96 , č. 12 . - str. 3939-3947 . — PMID 11090081 .
  26. Martin PJ, Delmotte MH, Formstecher P., Lefebvre P. PLZF je negativní regulátor transkripční aktivity receptoru kyseliny retinové   // Nucl . Recept. : deník. — Sv. 1 , ne. 1 . — str. 6 . - doi : 10.1186/1478-1336-1-6 . — PMID 14521715 .
  27. Hoatlin ME, Zhi Y., Ball H., Silvey K., Melnick A., Stone S., Arai S., Hawe N., Owen G., Zelent A., Licht JD Nový BTB/POZ transkripční represorový protein interaguje s proteinem Fanconiho anémie skupiny C a   PLZF // Krev : deník. — Americká hematologická společnost. — Sv. 94 , č. 11 . - str. 3737-3747 . — PMID 10572087 .

Literatura