Histon deacetyláza 6

Zavedeno na základě PDB 3C5K .

Dostupné struktury

Ortologické vyhledávání: PDBe , RCSB

Seznam PDB ID
3C5K , 3GV4 , 3PHD

Identifikátory

Symbol

HDAC6 ; CPBHM; HD6; PPP1R90

Externí ID

OMIM: 300272 MGI : 1333752 HomoloGene : 31353 IUPHAR : ChEMBL : 1865 GeneCards : HDAC6 Gene

EC číslo

3.5.1.98

Genová ontologie
Funkce	• vazba na aktin • aktivita histondeacetylázy • vazba na protein • vazba beta-kateninu • vazba na mikrotubuly • vazba na ionty zinku • vazba na enzym • vazba na polyubiquitin • aktivita histondeacetylázy závislá na NAD (H3-K14 specifická) • vazba na histondeacetylázu • aktivita tubulindeacetylázy • alfa-tubulin vazba • aktivita histondeacetylázy závislá na NAD (H3-K9 specifická) • aktivita histondeacetylázy závislá na NAD (specifická pro H4-K16) • vazba na protein tau • vazba na beta-tubulin • vazba na protein Hsp90 • vazba na komplex dyneinu • NAD-dependentní histondeacetylázová aktivita (H3-K18 specifická)
buněčná složka	• histondeacetylázový komplex • jádro • cytoplazma • cytosol • mikrotubul • komplex asociovaný s mikrotubuly • cytoplazmatický mikrotubul • kaveola • inkluzní tělísko • agresivní • dyneinový komplex • axon • dendrit • náběžná hrana buňky • perikaryon • perinukleární oblast cytoplazmy
biologický proces	• proteinová polyubikvitinace • transkripce, templátová DNA • deacetylace proteinu • špatně složený nebo neúplně syntetizovaný katabolický proces proteinu • intracelulární transport proteinu • negativní regulace depolymerizace mikrotubulů • reakce na toxickou látku • pozitivní regulace přenosu signálu • reakce na organickou látku • regulace aktivity receptoru • pozitivní regulace migrace epiteliálních buněk • negativní regulace metabolického procesu peroxidu vodíku • pozitivní regulace biosyntetického procesu receptoru • makroautofagie • deacetylace histonů • lokalizace lysozomů • deacetylace peptidyl-lysinu • buněčná odpověď na topologicky nesprávný protein • ubiquitin-dependentní proteinový katabolický proces přes multivezikulární cesta třídění těla • rozklad proteinového komplexu • negativní regulace rozkladu proteinového komplexu • negativní regulace proteolýzy • negativní regulace transkripce, DNA-templát • negativní regulace aktivity oxidoreduktázy • reakce na mi sfolded protein • regulace pohybu na základě mikrotubulů • regulace signální dráhy androgenního receptoru • regulace ustavení lokalizace proteinu • buněčná odpověď na peroxid vodíku • agresomální sestavení • polyubikvitinovaný špatně složený transport proteinu • deacetylace Hsp90 • odpověď na růstový faktor • deacetylace histonu H3 • deacetylace histonu H4 • buněčná odpověď na špatně složený protein • pozitivní regulace sestavování proteinového komplexu zprostředkovaného chaperonem • deacetylace tubulinu • pozitivní regulace programované buněčné smrti zprostředkované peroxidem vodíku
Zdroje: Amigo / QuickGO

Profil exprese RNA

Více informací

ortology

Pohled

Člověk

Myš

Entrez

RefSeq (mRNA)

RefSeq (protein)

Locus (UCSC)

Chr HG1436_HG1432_PATCH: 48,66
– 48,68 Mb

Chr X:
7,93 – 7,95 Mb

Hledejte v PubMed

[jeden]

[2]

Histon deacetyláza 6 ( Histone deacetyláza 6 ) je enzym kódovaný u lidí genem HDAC6 [1] [2] .

Funkce

Histony hrají klíčovou roli v regulaci transkripce , buněčného cyklu a vývojového procesu. Acetylace/deacetylace histonů mění strukturu chromatinu a ovlivňuje transkripci. Histondeacetyláza 6 patří do třídy II rodiny histondeacetylázy/acuc/APHA. Obsahuje dvě katalytické domény , které fungují nezávisle na sobě. Protein má aktivitu histondeacetylázy a inhibuje transkripci [3] .

Klinická relevance

Mutace v tomto genu byly spojovány s Alzheimerovou chorobou [4] .

Nadměrná exprese tohoto proteinu koreluje s onkogenezí a přežitím buněk a také podporuje metastázování rakovinných buněk [5] .

Funkce

Histondeacetyláza 6 se podílí na rozkladu buněčných řasinek , což je nezbytné pro začátek mitózy [6] . Podporuje také migraci buněk a katalyzuje deacetylaci α -tubulinu [7] , což může podporovat metastázy rakoviny [5] . Ovlivňuje transkripci a translaci regulací proteinu tepelného šoku Hsp90 a stresových granulí [5] .

Známý pro svou vysokou afinitu k ubikvitinovaným proteinům [8] . Histondeacetyláza 6 hraje důležitou roli při tvorbě stresových granulí ; s farmakologickou inhibicí nebo supresí syntézy histondeacetylázy 6 na genetické úrovni se tvorba stresových granulí zastaví.

Interakce

Ukázalo se, že HDAC6 interaguje s HDAC11 [9] a ZBTB16 [10] .

HDAC6 také interaguje se stresovým granulovým proteinem G3BP1 8] .

Viz také

Histonové deacetylázy

Poznámky

↑ Grozinger CM, Hassig CA, Schreiber SL Tři proteiny definují třídu lidských histonových deacetyláz souvisejících s kvasinkou Hda1p // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal . - 1999. - Červen ( roč. 96 , č. 9 ). - str. 4868-4873 . - doi : 10.1073/pnas.96.9.4868 . — PMID 10220385 .
↑ Nagase T., Ishikawa K., Suyama M., Kikuno R., Hirosawa M., Miyajima N., Tanaka A., Kotani H., Nomura N., Ohara O. Predikce kódujících sekvencí neidentifikovaných lidských genů. XII. Kompletní sekvence 100 nových cDNA klonů z mozku, které kódují velké proteiny in vitro // Výzkum DNA : deník. - 1999. - Květen ( ročník 5 , č. 6 ). - S. 355-364 . - doi : 10.1093/dnares/5.6.355 . — PMID 10048485 .
↑ Entrez Gen: HDAC6 histon deacetyláza 6 . (neurčitý)
↑ Cook C., Gendron TF, Scheffel K., Carlomagno Y., Dunmore J., DeTure M., Petrucelli L. Ztráta HDAC6, nového substrátu CHIP, zmírňuje abnormální akumulaci tau // Human Molecular Genetics : deník. - Oxford University Press , 2012. - 5. dubna. - doi : 10.1093/hmg/dds125 . — PMID 22492994 .
↑ 1 2 3 Aldana-Masangkay GI, Sakamoto KM Role HDAC6 u rakoviny // BioMed Research International : deník. - 2011. - Sv. 2011 . - P. 875824 . - doi : 10.1155/2011/875824 . — PMID 21076528 .
↑ Gradilone SA , Radtke BN , Bogert PS , Huang BQ , Gajdos GB , LaRusso NF Inhibice HDAC6 obnovuje ciliární expresi a snižuje růst nádoru. (anglicky) // Cancer research. - 2013. - Sv. 73, č.p. 7 . - S. 2259-2270. - doi : 10.1158/0008-5472.CAN-12-2938 . — PMID 23370327 .
↑ Gao YS, Hubbert CC, Lu J., Lee YS, Lee JY, Yao TP Histonová deacetyláza 6 reguluje růstovým faktorem indukovanou remodelaci aktinu a endocytózu // Molekulární a buněčná biologie : deník. - 2007. - Sv. 27 , č. 24 . - S. 8637-8647 . - doi : 10.1128/MCB.00393-07 . — PMID 17938201 .
↑ 1 2 Kwon S., Zhang Y., Matthias P. Deacetyláza HDAC6 je nová kritická složka stresových granulí podílejících se na reakci na stres // Genes & Development : journal . - 2007. - prosinec ( roč. 21 , č. 24 ). - str. 3381-3394 . - doi : 10.1101/gad.461107 . — PMID 18079183 .
↑ Gao L., Cueto MA, Asselbergs F., Atadja P. Klonování a funkční charakterizace HDAC11, nového člena rodiny lidských histonových deacetyláz // Journal of Biological Chemistry : journal. - 2002. - Červenec ( roč. 277 , č. 28 ). - S. 25748-25755 . - doi : 10.1074/jbc.M111871200 . — PMID 11948178 .
↑ Chauchereau A., Mathieu M., de Saintignon J., Ferreira R., Pritchard LL, Mishal Z., Dejean A., Harel-Bellan A. HDAC4 zprostředkovává transkripční represi proteinem PLZF spojeným s akutní promyelocytární leukémií . / Onkogen : deník. - 2004. - Listopad ( roč. 23 , č. 54 ). - S. 8777-8784 . - doi : 10.1038/sj.onc.1208128 . — PMID 15467736 .

Literatura

Pazin MJ, Kadonaga JT Co je nahoru a dolů s deacetylací a transkripcí histonů? (anglicky) // Cell : journal. - Cell Press , 1997. - Vol. 89 , č. 3 . - str. 325-328 . - doi : 10.1016/S0092-8674(00)80211-1 . — PMID 9150131 .
Wolffe AP Transkripční řízení. Hříšná represe (anglicky) // Nature. - 1997. - Sv. 387 , č.p. 6628 . - str. 16-7 . - doi : 10.1038/387016a0 . — PMID 9139815 .
Huynh KD, Fischle W., Verdin E., Bardwell VJ BCoR, nový korepresor zapojený do represe BCL-6 // Genes & Development : journal . - 2000. - Sv. 14 , č. 14 . - S. 1810-1823 . - doi : 10.1101/gad.14.14.1810 . — PMID 10898795 .
Mahlknecht U., Schnittger S., Landgraf F., Schoch C., Ottmann OG, Hiddemann W., Hoelzer D. Přiřazení genu lidské histon deacetylázy 6 (HDAC6) k chromozomu X p11.23 hybridizací in situ (angl. ) // Cytogenetika a výzkum genomu : deník. - 2001. - Sv. 93 , č. 1-2 . - str. 135-136 . - doi : 10.1159/000056967 . — PMID 11474198 .
Kao HY, Lee CH, Komarov A., Han CC, Evans RM Izolace a charakterizace savčí HDAC10, nové histonové deacetylázy (anglicky) // Journal of Biological Chemistry : journal. - 2002. - Sv. 277 , č.p. 1 . - S. 187-193 . - doi : 10.1074/jbc.M108931200 . — PMID 11677242 .
Seigneurin-Berny D., Verdel A., Curtet S., Lemercier C., Garin J., Rousseaux S., Khochbin S. Identifikace komponent myšího histonového deacetylázového 6 komplexu: Spojení mezi acetylací a ubikvitinačními signalizačními cestami ) // Molekulární a buněčná biologie : deník. - 2001. - Sv. 21 , č. 23 . - S. 8035-8044 . - doi : 10.1128/MCB.21.23.8035-8044.2001 . — PMID 11689694 .
Tong JJ, Liu J., Bertos NR, Yang XJ Identifikace HDAC10, nové lidské histondeacetylázy třídy II obsahující doménu bohatou na leucin // Výzkum nukleových kyselin : deník. - 2002. - Sv. 30 , č. 5 . - S. 1114-1123 . doi : 10.1093/nar/ 30.5.1114 . — PMID 11861901 .
Gao L., Cueto MA, Asselbergs F., Atadja P. Klonování a funkční charakterizace HDAC11, nového člena rodiny lidských histonových deacetyláz // Journal of Biological Chemistry : journal. - 2002. - Sv. 277 , č.p. 28 . - S. 25748-25755 . - doi : 10.1074/jbc.M111871200 . — PMID 11948178 .
Hubbert C., Guardiola A., Shao R., Kawaguchi Y., Ito A., Nixon A., Yoshida M., Wang XF, Yao TP HDAC6 je deacetyláza spojená s mikrotubuly // Nature . - 2002. - Sv. 417 , č.p. 6887 . - str. 455-458 . - doi : 10.1038/417455a . — PMID 12024216 .
Kirsh O., Seeler JS, Pichler A., Gast A., Müller S., Miska E., Mathieu M., Harel-Bellan A., Kouzarides T., Melchior F., Dejean A. Ligáza SUMO E3 RanBP2 podporuje modifikaci HDAC4 deacetylázy // The EMBO Journal : deník. - 2002. - Sv. 21 , č. 11 . - S. 2682-2691 . - doi : 10.1093/emboj/21.11.2682 . — PMID 12032081 .
Hook SS, Orian A., Cowley SM, Eisenman RN Histone deacetyláza 6 váže polyubiquitin prostřednictvím svého zinkového prstu (doména PAZ) a kopurifikuje se s deubikvitinačními enzymy // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. - 2002. - Sv. 99 , č. 21 . - S. 13425-13430 . - doi : 10.1073/pnas.172511699 . — PMID 12354939 .
Westendorf JJ, Zaidi SK, Cascino JE, Kahler R., van Wijnen AJ, Lian JB, Yoshida M., Stein GS, Li X. Runx2 (Cbfa1, AML-3) interaguje s histon deacetylázou 6 a potlačuje promotor p21CIP1/WAF1 (anglicky) // Molekulární a buněčná biologie : deník. - 2002. - Sv. 22 , č. 22 . - str. 7982-7992 . - doi : 10.1128/MCB.22.22.7982-7992.2002 . — PMID 12391164 .
North BJ, Marshall BL, Borra MT, Denu JM, Verdin E. Lidský ortholog Sir2, SIRT2, je NAD+ závislá tubulin deacetyláza // Molecular Cell : deník. - 2003. - Sv. 11 , č. 2 . - str. 437-444 . - doi : 10.1016/S1097-2765(03)00038-8 . — PMID 12620231 .
Voelter-Mahlknecht S., Mahlknecht U. Klonování a strukturální charakterizace genu lidské histondeacetylázy 6 // International Journal of Molecular Medicine : deník. - 2004. - Sv. 12 , č. 1 . - str. 87-93 . - doi : 10.3892/ijmm.12.1.87 . — PMID 12792815 .
Brush MH, Guardiola A., Connor JH, Yao TP, Shenolikar S. Inhibitory deaktylázy narušují buněčné komplexy obsahující proteinové fosfatázy a deacetylázy // Journal of Biological Chemistry : journal. - 2004. - Sv. 279 , č.p. 9 . - str. 7685-7691 . - doi : 10.1074/jbc.M310997200 . — PMID 14670976 .
Pandey UB, Batlevi Y., Baehrecke EH, Taylor JP HDAC6 na průsečíku autofagie, systému ubikvitin-proteazom a neurodegenerace (anglicky) // Autophagy: journal. — Sv. 3 , ne. 6 . - S. 643-645 . - doi : 10.4161/auto.5050 . — PMID 17912024 . (Epub 2007, 10. září)
Pandey UB, Nie Z., Batlevi Y., McCray BA, Ritson GP, Nedelsky NB, Schwartz SL, DiProspero NA, Knight MA, Schuldiner O., Padmanabhan R., Hild M., Berry DL, Garza D., Hubbert CC, Yao TP, Baehrecke EH, Taylor JP HDAC6 zachraňuje neurodegeneraci a poskytuje zásadní spojení mezi autofagií a UPS // Nature : journal. - 2007. - 14. června ( roč. 447 , č. 7146 ). - S. 859-863 . - doi : 10.1038/nature05853 . — PMID 17568747 .