Dělení prokaryotických buněk

Dělení prokaryotických buněk  - proces vzniku dceřiných prokaryotických buněk z matky. Klíčové události v buněčném cyklu prokaryot i eukaryot jsou replikace DNA a buněčné dělení . Charakteristickým rysem dělení prokaryotických buněk je přímá účast replikované DNA v procesu dělení [1] . V naprosté většině případů se prokaryotické buňky dělí za vzniku dvou dceřiných buněk stejné velikosti, proto se tento proces někdy také nazývá binární štěpení . Protože prokaryotické buňky mají nejčastěji buněčnou stěnu , je binární dělení doprovázeno vytvořením přepážky  - přepážky mezi dceřinými buňkami, která se pak uprostřed odlupuje. Proces dělení prokaryotické buňky byl podrobně studován na příkladu Escherichia coli [2] .

Dělení gramnegativních bakterií

K objevu mechanismu dělení gramnegativních bakterií přispělo studium mutantních kmenů E. coli , u kterých je tento mechanismus narušen. V důsledku mutací , které ovlivňují geny podílející se na dělení buněk, se mohou tvořit následující fenotypy :

Molekulární mechanismus štěpení

Ústřední roli v buněčném dělení gramnegativních bakterií hraje přepážkový prstenec - prstencová organela umístěná přibližně uprostřed buňky a schopná kontrahování, čímž vzniká zúžení mezi dvěma novými dceřinými buňkami. Zralý septální prstenec je komplexní proteinový komplex složený z více než tuctu různých proteinů. Deset z nich (FtsA, B, I, K, L, N, Q, W, Z a ZipA) je naprosto nezbytných pro vytvoření přepážky a porušení v jejich práci vede ke vzniku filament typu Fts [ 2] . Zbývající komponenty nejsou vyloženě nutné, jejich funkce se mohou částečně překrývat. Tvorba septálního prstence probíhá v několika fázích, nové proteiny se spojují jeden po druhém v následujícím pořadí: FtsZ→FtsA/ZipA→FtsK→FtsQ→FtsL/FtsB→FtsW→FtsI→FtsN [7] .

Proteiny, které tvoří septální prstenec, lze kromě FtsZ rozdělit do několika tříd podle jejich funkcí:

U mnoha proteinů septálního kruhu však přesná funkce stále není známa [8] .

Vznik Z-kroužku

Nezralá forma septálního prstence se nazývá Z-kruh, podle proteinu FtsZ, který hraje klíčovou roli při jeho tvorbě. Je však třeba poznamenat, že termíny septální kroužek a Z-kroužek se často používají jako synonyma, takže v každém jednotlivém případě by to mělo být konkrétně specifikováno [2] . Protein FtsZ má tendenci vytvářet dlouhé fibrilární struktury. Po rozdělení tvoří FtsZ šroubovici přiléhající k vnitřní membráně, zkroucenou podél osy buňky. Tato spirála neustále mění svou polohu a rychle kmitá od jednoho pólu buňky k druhému [9] [10] . Přibližně v době dokončení replikace DNA se šroubovice FtsZ zhroutí, což má za následek vytvoření Z-kruhu uprostřed buňky [11] . Existují všechny důvody se domnívat, že Z-kroužek je ve skutečnosti také krátká hustá spirála [10] .

Protein FtsZ je prokaryotický homolog tubulinu s podobnou terciární strukturou [1] . To naznačuje, že asociace FtsZ do Z-kruhu může připomínat sestavení eukaryotických mikrotubulů . FtsZ, stejně jako tubulin, má aktivitu GTPázy , hydrolýza GTP zajišťuje polymeraci FtsZ s tvorbou lineárních protofilament. Z-kruh je dynamická struktura: molekuly FtsZ v kruhu jsou neustále nahrazovány molekulami z cytoplazmatického poolu [12] [13] .

FtsZ sám o sobě nemá žádnou membránovou afinitu , tvorbu kruhové struktury z protofilament, jejich ukotvení ve vnitřní membráně a stabilizaci Z-kruhu zajišťují proteiny FtsA a ZipA, které interagují přímo a nezávisle s FtsZ. ZipA je integrální protein vnitřní membrány, FtsA je cytoplazmatický protein, který se však může vázat na membránu díky speciální aminokyselinové sekvenci na C-konci. Zdá se, že ZipA je specifický pro γ-proteobakterie , zatímco FtsA je všestrannější [2] . Z-kruh v E. coli může být vytvořen v nepřítomnosti jednoho z těchto proteinů, ale ne obou, což ukazuje na jejich překrývající se funkce [14] [15] .

Další dva proteiny, ZapA a ZapB, jsou zahrnuty do Z-kruhu v časném stádiu, ale jejich přítomnost není pro jeho vznik nezbytně nutná [2] [7] [16] . ZapA je univerzální protein pro mnoho prokaryot, ale ZapB se se vší pravděpodobností nachází pouze v γ-proteobakteriích . ZapA se váže přímo na FtsZ, zatímco ZapB se váže na ZapA. Zajímavé je, že ZapB tvoří další kruhovou strukturu, která je dále od membrány než Z-kruh. Funkce těchto proteinů nejsou dosud plně stanoveny, ale předpokládá se, že se podílejí na přeměně FtsZ helixu na Z-kruh a také na následné stabilizaci Z-kruhu [7] .

Zrání septálního prstence

Z-kruh existuje v popsané podobě 14-21 minut (v závislosti na rychlosti dělení) a teprve poté se na něj navážou všechny ostatní klíčové proteiny počínaje FtsQ [17] . Kdy se FtsK připojí, nebylo dosud přesně stanoveno. Zbývající proteiny jsou obsaženy v septálním prstenci téměř současně během 1-3 minut. Než se septální prstenec začne skládat, Z-kruh stimuluje syntézu peptidoglykanu ve středu buňky, takže se buňka začne prodlužovat. Molekulární mechanismus tohoto procesu však dosud nebyl stanoven [2] [17] .

Mezi posledně jmenovanými zahrnuje septální kruh proteiny odpovědné za syntézu polárního peptidoglykanu (FtsW, FtsI) a proteiny, které zajišťují částečnou hydrolýzu peptidoglykanu na rozhraní mezi dvěma buňkami (AmiA, B, C, EnvC, NlpD) [2] .

Tvorba zúžení

Poslední fází dělení prokaryotické buňky je vytvoření konstrikce a konečné oddělení dvou nových buněk. Tvorba konstrikce ovlivňuje všechny složky buněčné stěny (vnitřní membránu, peptidoglykanovou vrstvu a vnější membránu). Existuje důvod se domnívat, že Z-kroužek je zodpovědný za invaginaci vnitřní membrány, ale jak přesně přenáší napětí na membránu, zatím není známo. Paralelně s tímto procesem enzymy septálního kruhu syntetizují (nebo speciálním způsobem modifikují již existující) septální peptidoglykan [2] [17] . Po vytvoření přepážky přicházejí na řadu peptidoglykanhydrolázy, které od sebe oddělují budoucí buňky. Proces dělení je ukončen invaginací a izolací vnějších membrán buněk.

Poznámky

  1. 1 2 Benjamin Lewin. Kapitola 13: Replikon // Genes VIII . - Upper Saddle River, NJ: Pearson Prentice Hall, 2004. - ISBN 0131439812 .
  2. 1 2 3 4 5 6 7 8 de Boer PA. Pokroky v porozumění buněčnému štěpení E. coli  (neurčité)  // Curr Opin Microbiol .. - 2010. - T. 13 . - S. 730-737 . - doi : 10.1016/j.mib.2010.09.015 . — PMID 20943430 .
  3. Adler HI, Hardigree AA. Růst a rozdělení vláknitých forem Escherichia coli  //  Journal of Bacteriology : deník. - 1965. - Sv. 90 . - str. 223-226 . — PMID 16562021 .
  4. 1 2 Hirota Y., Ryter A., ​​​​Jacob F. Termocitlivé mutanty E. coli ovlivněné v procesech syntézy DNA a buněčného dělení  //  Cold Spring Harb Symp Quant Biol. : deník. - 1968. - Sv. 33 . - str. 677-693 . — PMID 4892005 .
  5. Adler HI, Fisher WD, Cohen A., Hardigree AA. MINIATURE Escherichia coli BUŇKY DEFICIENTNÍ V DNA  // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America  : journal  . - 1967. - Sv. 57 . - str. 321-326 . — PMID 16591472 .
  6. Hiraga S., Niki H., Ogura T., Ichinose C., Mori H., Ezaki B., Jaffé A. Chromozomové dělení v Escherichia coli: nové mutanty produkující anukleátové buňky  //  Journal of Bacteriology : deník. - 1989. - Sv. 171 . - S. 1496-1505 . — PMID 2646284 .
  7. 1 2 3 Galli E., Gerdes K. Prostorové rozlišení dvou proteinů dělení bakteriálních buněk: ZapA rekrutuje ZapB na vnitřní stranu Z-kruhu.  (anglicky)  // Mikrobiologie : deník. — Mikrobiologická společnost, 2010. - Sv. 76 . - S. 1514-1526 . - doi : 10.1111/j.1365-2958.2010.07183.x . — PMID 20487275 .
  8. Weiss D.S. Dělení bakteriálních buněk a septální prstenec.  (anglicky)  // Mikrobiologie : deník. — Mikrobiologická společnost, 2004. - Sv. 54 . - str. 588-597 . - doi : 10.1111/j.1365-2958.2004.04283.x . — PMID 15491352 .
  9. Thanedar S., Margolin W. FtsZ vykazuje rychlý pohyb a oscilační vlny v helixovitých vzorech u Escherichia coli.  (anglicky)  // Curr Biol.  : deník. - 2004. - Sv. 14 . - S. 1167-1173 . - doi : 10.1016/j.cub.2004.06.048 . — PMID 15242613 .
  10. 1 2 Erickson HP, Anderson DE, Osawa M. FtsZ v bakteriální cytokinezi: cytoskelet a generátor síly v jednom.  (anglicky)  // Recenze mikrobiologie a molekulární biologie : deník. — Americká společnost pro mikrobiologii, 2010. - Sv. 74 . - str. 504-528 . - doi : 10.1128/MMBR.00021-10 . — PMID 21119015 .
  11. Den Blaauwen T., Buddelmeijer N., Aarsman ME, Hameete CM, Nanninga N. Načasování montáže FtsZ v Escherichia coli.  (anglicky)  // Curr Biol.  : deník. - 1999. - Sv. 181 . - str. 5167-5175 . — PMID 10464184 .
  12. Stricker J., Maddox P., Salmon ED, Erickson HP. Rychlá dynamika sestavování FtsZ-kroužku Escherichia coli demonstrovaná obnovením fluorescence po fotobělení.  (anglicky)  // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America  : journal. - 2002. - Sv. 99 . - str. 3171-3175 . - doi : 10.1073/pnas.052595099 . — PMID 11854462 .
  13. Romberg L., Levin P. A. Dynamika sestavení bakteriálního buněčného dělení proteinu FTSZ: na hraně stability.  (anglicky)  // Annu Rev Microbiol. : deník. - 2003. - Sv. 57 . - S. 125-154 . - doi : 10.1146/annurev.micro.57.012903.074300 . — PMID 14527275 .
  14. Hale CA, de Boer PA. Přímá vazba FtsZ na ZipA, základní složku septální kruhové struktury, která zprostředkovává buněčné dělení v E. coli. (anglicky)  // Cell  : journal. - Cell Press , 1997. - Vol. 88 . - S. 175-185 . - doi : 10.1016/S0092-8674(00)81838-3 . — PMID 9008158 .
  15. Pichoff S., Lutkenhaus J. Jedinečné a překrývající se role pro ZipA a FtsA při montáži septálních kroužků u Escherichia coli.  (anglicky)  // EMBO J. : deník. - 2002. - Sv. 21 . - str. 685-693 . - doi : 10.1093/emboj/21.4.685 . — PMID 11847116 .
  16. Ebersbach G., Galli E., Møller-Jensen J., Löwe J., Gerdes K. Nový coiled-coil cell division factor ZapB stimuluje sestavení Z kruhu a buněčné dělení.  (anglicky)  // Mikrobiologie : deník. — Mikrobiologická společnost, 2008. - Sv. 68 . - str. 720-735 . doi : 10.1111 / j.1365-2958.2008.06190.x . — PMID 18394147 .
  17. 1 2 3 Aarsman ME, Piette A., Fraipont C., Vinkenvleugel TM, Nguyen-Distèche M., den Blaauwen T. Zrání divize Escherichia coli probíhá ve dvou krocích.  (anglicky)  // Mikrobiologie : deník. — Mikrobiologická společnost, 2005. - Sv. 55 . - S. 1631-1645 . - doi : 10.1111/j.1365-2958.2005.04502.x . — PMID 15752189 .