Dvojité základny
Párové báze - pár dvou dusíkatých bází nukleotidů na komplementárních řetězcích nukleových kyselin (opačná DNA nebo identická RNA ), spojených pomocí vodíkových můstků .
V kanonickém párování bází Watson - Crick DNA se adenin (A) páruje s thyminem (T) a guaninem (G) s cytosinem (C). V RNA je thymin nahrazen uracilem (U). Vyskytují se také jiné páry, které nejsou Watson-Crickovy, zejména v RNA a jsou výsledkem změněného vzoru vodíkových vazeb: Hoogstenovy (imidazolové) spárované báze jsou typickým příkladem . Pár AT (nebo AU) je spojen dvěma vodíkovými vazbami a pár GC třemi [1] .
Hlavní úlohou tvorby párových bází v biologických systémech je schopnost číst a kopírovat informace kódované v nukleových kyselinách. Během translačního procesu , díky tvorbě párových bází, jsou antikodony transferových RNA rozpoznány kodony molekul messenger RNA .
Některé enzymy vázající DNA nebo RNA mohou rozpoznat určité sekvence párů bází: například transkripční faktory takto identifikují specifické regulační oblasti genů.
Použití jako měrná jednotka
Velikost jednotlivých genů nebo celých genomů (hodnota C) organismů je často vyjádřena v párech bází, protože tyto geny a genomy jsou spojeny a tvoří dvouvláknovou DNA. Počet párů bází se rovná počtu nukleotidů v jednom z řetězců (s výjimkou nekódujících oblastí telomer , které jsou jednořetězcové).
V případě použití termínu „paired base“ jako měrné jednotky se název obvykle zkracuje na „bp“ (z anglického base pair ). V ruskojazyčné literatuře se někdy používá i zkratka b.n. - pár nukleotidů. Kromě toho se používají odvozené jednotky [2] :
- kilobáze nebo atd. o. (tbp nebo kb; anglicky kilobase , kb nebo kbp) - tisíc párů bází;
- megabase nebo milion p.o. (milión párů bází nebo Mb; anglicky megabase , Mb nebo Mbp) - jeden milion párů bází;
- gigabase nebo miliarda p.o. (miliarda bp nebo Gb; anglicky gigabase , Gb nebo Gbp) - miliarda párů bází.
Jeden pár bází odpovídá vzdálenosti podél molekuly dvouvláknové DNA rovné 3,4 Á (0,34 nm ), jedné desetině úplného závitu šroubovice [3] . Molekulová hmotnost jednoho páru bází v DNA je v průměru 643 daltonů .
Viz také
Poznámky
- ↑ Kantor Ch., Schimmel P. Biofyzikální chemie / Per. z angličtiny. vyd. A. A. Bogdanov, Yu. S. Lazurkina, M. D. Frank-Kamenetsky. - M. : Mir, 1984. - T. 1. - S. 295. - 336 s.
- ↑ Genomy obojživelníků byly od začátku velké . Elements.ru _ Datum přístupu: 1. ledna 2016. Archivováno z originálu 5. února 2016.
- ↑ Alberts B., Johnson A., Lewis J., Morgan D., Raff M., Roberts K., Walter P. Molekulární biologie buňky . — 6. vyd. — New York/Abingdon: Garland Science, Taylor & Francis Group, 2014. — S. 177. — ISBN 978-0-8153-4432-2 .
Literatura
- Watson JD, Baker TA, Bell SP, Gann A., Levine M., Losick R. Molecular Biology of the Gene (neopr.) . — 5. — Pearson Benjamin Cummings: CSHL Press, 2004. (Viz zejména kap. 6 a 9)
- Olson, WK, Bansal, M., Burley, SK, Dickerson, RE, Gerstein, M., Harvey, SC, Heinemann, X.-JLU, Neidle, S., Shakked, Z., Sklenář, H., Suzuki, M., Tung, C.-S., Westhof, E., Wolberger, C. & Berman, HM Standardní referenční rámec pro popis geometrie párů bází nukleové kyseliny // Journal of Molecular Biology . - 2001. - Sv. 313. - S. 229-237.
- Myron F. Goodman. Revidovaná vodíková vazba: Geometrický výběr jako hlavní determinant věrnosti replikace DNA // Proceedings of the National Academy of Sciences . - 1997. - Sv. 94. - S. 10493-10495.
Odkazy
- Nucleic Acid Basepair Geometry Nomenklatura - Univerzita Hamburk - Fakulta biologie, Nejvýznamnější body biochemie
 Slovníky a encyklopedie |
|---|