Opakující se sekvence DNA
Aktuální verze stránky ještě nebyla zkontrolována zkušenými přispěvateli a může se výrazně lišit od
verze recenzované 15. května 2016; kontroly vyžadují
4 úpravy .
Repetitivní sekvence DNA ( angl. Repetitive DNA ) jsou úseky DNA zahrnuté v genomu , jejichž sekvence se skládá z opakujících se fragmentů. Existují 2 typy takových opakujících se sekvencí:
U primátů je většina repetic LINE a LINE-1, stejně jako většina opakování SINE, Alu repeticemi .
U prokaryot je CRISPR posloupnost střídajících se repetic a spacerů .
Jiné typy opakování
Existují další typy repetic fragmentů DNA kromě těch, které jsou popsány výše [1] :
- Přímé přehrání
- Společné přímé přehrávání
- Místní přímé jednoduché opakování
- Lokální přímé opakování s distančními vložkami
- Invertované opakování
- Běžné obrácené repetice
- Lokálně obrácené repetice
- Invertované repetice s distančními vložkami
- palindromické opakování
- Opakuje se zrcadlově a naruby
Poznámky
- ↑ Ussery, David W.; Wassenaar, Trudy; Borini, Stefano. Frekvence slov, opakování a struktury související s opakováním v bakteriálních genomech // Computing for Comparative Microbial Genomics: Bioinformatics for Microbiologists (anglicky) . - 1. - Springer, 2008. - Sv. 8. - S. 133-144. — (Výpočetní biologie). - ISBN 978-1-84800-254-8 .
Odkazy
Slovníky a encyklopedie |
|
---|