Ektomie (z jiného řeckého ἐκτομή „řezání, zkrácení“), excize ( lat . excīsiō „řezání, vyříznutí“) nebo exstirpace ( lat . exstirpātiō „vykořenění“) – zpravidla úplné odstranění orgánu nebo jasně definované anatomické části tělo , na rozdíl od resekce ( lat. resectiō „zkrácení“), která zahrnuje částečné odstranění.
Obvykle se ektomie provádí, pokud je orgán postižen nádorem (zejména pokud je nádor maligní). Ektomie se provádí také v případě akutního nebo chronického zánětu (např. tonzilitida krčních mandlí ) nebo jsou-li známky neplodnosti ( vazektomie nebo kastrace ), a ektomie zubu , pokud nelze zachránit zničený zub .