ARNT
ARNT
|
---|
|
PNR | Ortologické vyhledávání: PDBe RCSB |
4PKY , 1X0O , 2A24 , 2B02 , 2HV1 , 2K7S , 3F1N , 3F1O , 3F1P , 3H7W , 3H82 , 4EQ1 , 4GHI , 4HXTZ9 , 4HXTZ2 , 4H6 _ _
| | |
|
Symboly
| ARNT , HIF-1-beta, HIF-1beta, HIF1-beta, HIF1B, HIF1BETA, TANGO, bHLHe2, jaderný translokátor aryl uhlovodíkového receptoru, jaderný translokátor aryl uhlovodíkového receptoru |
---|
Externí ID |
OMIM: 126110 MGI: 88071 HomoloGene: 1261 GeneCards: 405
|
---|
Funkce |
• sekvenčně specifická vazba DNA • vazba DNA • aktivita dimerizace proteinu • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 aktivita transkripčního faktoru vázajícího DNA • GO:0001105 aktivita transkripčního koaktivátoru • vazba aryltrankarbonového receptoru • vazba faktor • GO:0001948, GO:0016582 vazba na plazmatické proteiny • aktivita heterodimerizace proteinu • aktivita transkripčního faktoru, vazba specifická pro sekvenci distálního zesilovače RNA polymerázy II • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-vazebná aktivita, vazebná aktivita transkripčního faktoru Specifická pro RNA polymerázu II • homodimerizace proteinu • sekvenčně specifická vazba na dvouvláknovou DNA • GO:0038050, GO:0004886, GO:0038051 aktivita jaderného receptoru
|
---|
buněčná složka |
• cytoplazma • regulátor transkripčního komplexu • nukleoplazma • komplex regulátoru transkripce RNA polymerázy II • buněčné jádro • jaderná tělíska
|
---|
biologický proces |
• pozitivní regulace signální dráhy receptoru vaskulárního endoteliálního růstového faktoru • Buněčná diferenciace • reakce na hypoxii • GO:0009373 DNA-dependentní regulace transkripce • pozitivní regulace proliferace endoteliálních buněk • regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II v reakci na oxidační stres • pozitivní regulace diferenciace erytrocytů • vývoj embryonální placenty • transkripce mRNA RNA polymerázou II • pozitivní regulace sumoylace proteinů • transkripce, závislá na DNA • GO:0060469, GO:0009371 pozitivní regulace transkripce • signální dráha intracelulárního receptoru • regulace transkripce z Promotor RNA polymerázy II v reakci na hypoxii • pozitivní regulace produkce vaskulárního endoteliálního růstového faktoru • pozitivní regulace glykolytického procesu • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 pozitivní regulace transkripce RNA polymerázy II promotor • pozitivní regulace procesu biosyntézy hormonů • xenobiotický metabolický proces
|
---|
Zdroje: Amigo / QuickGO | |
|
Více informací
|
Druhy |
Člověk |
Myš |
---|
Entrez |
|
|
---|
Soubor |
|
|
---|
UniProt |
|
|
---|
RefSeq (mRNA) |
| |
---|
RefSeq (protein) |
| |
---|
Locus (UCSC) |
Chr 1: 150,81 – 150,88 Mb
| Chr 3: 95,34 – 95,4 Mb
|
---|
Vyhledávání PubMed |
[jeden]
| [2] |
---|
Upravit (člověk) | Upravit (myš) |
ARNT (zkr. z angl. Aryl hydrocarbon receptor nuclear translocator ) - jaderný translokátor (nosič) aromatického uhlovodíkového receptoru (AHR), je protein , který tvoří komplex s ligandem vázaným receptorem AHR a je nezbytný pro funkci receptoru. Je kódován stejnojmenným genem ARNT , lokalizovaným na krátkém rameni (p-raménku) 1-chromozomu [1] .
Kódovaný protein byl také identifikován jako beta podjednotka heterodimerního transkripčního faktoru , hypoxií indukovatelného faktoru (HIF1p). Translokace t(1; 12) (q21; p13), vedoucí k adhezi na protein TEL-ARNT, je spojena s akutní myeloblastickou leukémií. Pro tento gen byly popsány tři alternativní sestřižené varianty kódující různé izoformy.
Aromatický uhlovodíkový receptor (AHR) se podílí na indukci několika enzymů, které se podílejí na metabolismu xenobiotik . Ligand-cytosolová forma aromatického uhlovodíkového receptoru je komplexně spojena s proteinem tepelného šoku (Hsp90). Vazba ligandů včetně dioxinů ( TCDD ) a polycyklických aromatických uhlovodíků (PAH) vede k translokaci (pohybu) podjednotky vázající ligand pouze v [2] buněčném jádře . K indukci enzymů podílejících se na metabolismu xenobiotik dochází v důsledku vazby ligandem vázaného AhR na prvky citlivé na xenobiotika v promotorových oblastech genů pro tyto enzymy.
Interakce s jinými proteiny
ARNT interaguje s následujícími proteiny:
Poznámky
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC: 700 . Získáno 21. září 2017. Archivováno z originálu 21. září 2017.
- ↑ Hughes D. , Guttenplan JB , Marcus CB , Subbaramaiah K. , Dannenberg AJ Inhibitory Heat Shock Protein 90 potlačují aktivaci transkripce CYP1A1 a CYP1B1 a tvorbu aduktů DNA // Výzkum prevence rakoviny. - 2008. - 1. listopadu ( roč. 1 , č. 6 ). - str. 485-493 . — ISSN 1940-6207 . - doi : 10.1158/1940-6207.CAPR-08-0149 .
- ↑ Carver LA, Bradfield CA Ligand-dependentní interakce arylového uhlovodíkového receptoru s novým homologem imunofilinu in vivo // Journal of Biological Chemistry : journal. - 1997. - Duben ( roč. 272 , č. 17 ). - S. 11452-11456 . doi : 10.1074 / jbc.272.17.11452 . — PMID 9111057 .
- ↑ Kazlauskas A., Sundström S., Poellinger L., Pongratz I. Chaperonový komplex hsp90 reguluje intracelulární lokalizaci dioxinového receptoru // Molekulární a buněčná biologie : deník. - 2001. - Duben ( roč. 21 , č. 7 ). - S. 2594-2607 . - doi : 10.1128/MCB.21.7.2594-2607.2001 . — PMID 11259606 .
- ↑ Lindebro MC, Poellinger L., Whitelaw ML Interakce protein-protein prostřednictvím PAS domén: role PAS domény v pozitivní a negativní regulaci komplexu bHLH/PAS dioxinový receptor-Arnt transkripční faktor // The EMBO Journal : deník. - 1995. - Červenec ( roč. 14 , č. 14 ). - str. 3528-3539 . — PMID 7628454 .
- ↑ Whitelaw M., Pongratz I., Wilhelmsson A., Gustafsson JA, Poellinger L. Ligandově závislý nábor Arnt koregulátoru určuje rozpoznávání DNA dioxinovým receptorem // Molekulární a buněčná biologie : deník. - 1993. - Duben ( roč. 13 , č. 4 ). - S. 2504-2514 . — PMID 8384309 .
- ↑ Yamaguchi Y., Kuo MT Funkční analýza interakcí jaderného translokátoru aryluhlovodíkového receptoru s aryluhlovodíkovým receptorem v kvasinkovém dvouhybridním systému // Biochemická farmakologie : deník. - 1995. - říjen ( roč. 50 , č. 8 ). - S. 1295-1302 . - doi : 10.1016/0006-2952(95)02016-6 . — PMID 7488247 .
- ↑ Mimura J., Ema M., Sogawa K., Fujii-Kuriyama Y. Identifikace nového mechanismu regulace funkce receptoru Ah (dioxin) (anglicky) // Genes & Development : journal. - 1999. - Leden ( roč. 13 , č. 1 ). - S. 20-5 . - doi : 10.1101/gad.13.1.20 . — PMID 9887096 .
- ↑ 1 2 Hogenesch JB, Chan WK, Jackiw VH, Brown RC, Gu YZ, Pray-Grant M., Perdew GH, Bradfield CA Charakterizace podskupiny nadrodiny basic-helix-loop-helix-PAS, která interaguje s komponentami the dioxin signaling pathway (anglicky) // Journal of Biological Chemistry : journal. - 1997. - březen ( roč. 272 , č. 13 ). - S. 8581-8593 . doi : 10.1074 / jbc.272.13.8581 . — PMID 9079689 .
- ↑ 1 2 3 Woods SL, Whitelaw ML Rozdílné aktivity myší jednosměrné 1 (SIM1) a SIM2 na element hypoxické odezvy. Cross-talk mezi základními transkripčními faktory homologie helix-loop-helix/per-Arnt-Sim (anglicky) // Journal of Biological Chemistry : journal. - 2002. - březen ( roč. 277 , č. 12 ). - S. 10236-10243 . - doi : 10.1074/jbc.M110752200 . — PMID 11782478 .
- ↑ 1 2 Beischlag TV, Wang S., Rose DW, Torchia J., Reisz-Porszasz S., Muhammad K., Nelson WE, Probst MR, Rosenfeld MG, Hankinson O. Nábor rodiny NCoA/SRC-1/p160 transkripčních koaktivátorů komplexem nukleární translokátor aryl uhlovodíkový receptor/aryl uhlovodíkový receptor // Molekulární a buněčná biologie : deník. - 2002. - Červen ( roč. 22 , č. 12 ). - str. 4319-4333 . - doi : 10.1128/mcb.22.12.4319-4333.2002 . — PMID 12024042 .
- ↑ 1 2 Probst MR, Fan CM, Tessier-Lavigne M., Hankinson O. Dva myší homology jednoúčelového proteinu Drosophila, které interagují s nukleárním translokátorem myšího arylhydrokarbonového receptoru (anglicky) // Journal of Biological Chemistry : journal . - 1997. - Únor ( roč. 272 , č. 7 ). - S. 4451-4457 . doi : 10.1074 / jbc.272.7.4451 . — PMID 9020169 .
- ↑ Ooe N., Saito K., Mikami N., Nakatuka I., Kaneko H. Identifikace nového základního faktoru helix-loop-helix-PAS, NXF, odhaluje Sim2 konkurenční, pozitivní regulační roli v drebrinu modulátoru dendritického cytoskeletu genová exprese (anglicky) // Molecular and Cellular Biology : deník. - 2004. - Leden ( roč. 24 , č. 2 ). - S. 608-616 . - doi : 10.1128/mcb.24.2.608-616.2004 . — PMID 14701734 .
- ↑ Moffett P., Reece M., Pelletier J. Myší genový produkt Sim- 2 inhibuje transkripci aktivní represí a funkční interferencí // Molekulární a buněčná biologie : deník. - 1997. - září ( roč. 17 , č. 9 ). - S. 4933-4947 . - doi : 10.1128/mcb.17.9.4933 . — PMID 9271372 .